58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3596 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3523  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  428  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3596  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  428  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3528  hypothetical protein  99.06 
 
 
212 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12073  hypothetical protein  70.05 
 
 
213 aa  263  2e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1367  hypothetical protein  51.9 
 
 
224 aa  204  9e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.824327  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2103  hypothetical protein  39.3 
 
 
216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2674  hypothetical protein  36.23 
 
 
230 aa  111  8.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5391  hypothetical protein  39.38 
 
 
167 aa  108  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00711 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4506  hypothetical protein  36.68 
 
 
219 aa  104  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0471296 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0318  hypothetical protein  34.87 
 
 
203 aa  97.4  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3206  hypothetical protein  38.8 
 
 
200 aa  95.5  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000108092  hitchhiker  0.000809588 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5928  hypothetical protein  35.85 
 
 
215 aa  92.8  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3323  hypothetical protein  36.14 
 
 
208 aa  90.9  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115476  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3609  hypothetical protein  33.48 
 
 
220 aa  90.9  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.171671  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1840  hypothetical protein  36.02 
 
 
211 aa  90.5  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0519466  normal  0.0708195 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1355  hypothetical protein  32.83 
 
 
213 aa  89.4  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3084  hypothetical protein  33.98 
 
 
209 aa  88.2  8e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14430  hypothetical protein  33.64 
 
 
220 aa  81.6  0.000000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0057  hypothetical protein  36.32 
 
 
201 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.2084 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2399  hypothetical protein  34.5 
 
 
214 aa  80.9  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.496136  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2520  hypothetical protein  51.04 
 
 
173 aa  80.1  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0328527  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05210  hypothetical protein  36.63 
 
 
227 aa  79.3  0.00000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0520  hypothetical protein  33.7 
 
 
198 aa  77.8  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4990  hypothetical protein  32.18 
 
 
229 aa  75.5  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1697  hypothetical protein  36.27 
 
 
202 aa  72.8  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.942057  normal  0.254485 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0923  hypothetical protein  29.21 
 
 
217 aa  71.6  0.000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.56103  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2303  hypothetical protein  35.05 
 
 
199 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.78102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3646  hypothetical protein  30.43 
 
 
205 aa  68.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588267  normal  0.0194127 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3875  hypothetical protein  32.98 
 
 
196 aa  68.2  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.171113 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3889  hypothetical protein  32.98 
 
 
196 aa  68.2  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3963  hypothetical protein  32.98 
 
 
196 aa  68.2  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.73221  normal  0.396579 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1129  hypothetical protein  30.82 
 
 
225 aa  67  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4343  hypothetical protein  32.62 
 
 
192 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.502553  normal  0.0390845 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1699  hypothetical protein  30.37 
 
 
194 aa  62.8  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0159021  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1595  hypothetical protein  34.92 
 
 
218 aa  62  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.795711  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02000  hypothetical protein  30.24 
 
 
215 aa  60.5  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1737  hypothetical protein  31.25 
 
 
197 aa  59.3  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4607  hypothetical protein  29.33 
 
 
210 aa  55.1  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0303145  hitchhiker  0.0000208711 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3035  hypothetical protein  33.08 
 
 
210 aa  50.1  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0510116  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3446  hypothetical protein  36.62 
 
 
234 aa  48.5  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.351822  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2927  hypothetical protein  30.23 
 
 
210 aa  48.1  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.549173 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1443  hypothetical protein  30.71 
 
 
211 aa  47.8  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.210948  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5808  hypothetical protein  30.37 
 
 
206 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3408  hypothetical protein  29.63 
 
 
209 aa  47  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12830  conserved hypothetical protein TIGR03085  29.75 
 
 
248 aa  46.6  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.213535  normal  0.0190582 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0105  hypothetical protein  55.81 
 
 
187 aa  45.8  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0859584  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0691  hypothetical protein  30.77 
 
 
214 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0325788 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3897  hypothetical protein  42.37 
 
 
135 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0910689 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3218  hypothetical protein  27.88 
 
 
258 aa  43.5  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000118719  hitchhiker  0.000448278 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3849  hypothetical protein  32.39 
 
 
263 aa  43.9  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0848  wyosine base formation  30.53 
 
 
260 aa  43.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.57773  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3182  hypothetical protein  27.54 
 
 
209 aa  43.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.429032 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0630  hypothetical protein  28.5 
 
 
207 aa  42.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0331446 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1779  hypothetical protein  30.83 
 
 
220 aa  42.7  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.20203  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2240  hypothetical protein  30.51 
 
 
209 aa  42.7  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.168407  normal  0.37732 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0292  hypothetical protein  31.58 
 
 
220 aa  42.4  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0059  hypothetical protein  28.12 
 
 
192 aa  42  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3542  hypothetical protein  45.71 
 
 
157 aa  41.6  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325273  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>