37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0848 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0848  wyosine base formation  100 
 
 		 260 aa  507  1e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.57773  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6059  hypothetical protein  78.99 
 
 		 258 aa  390  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5394  hypothetical protein  75.88 
 
 		 258 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5770  wyosine base formation  75.88 
 
 		 258 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0624769  normal  0.773498 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5483  wyosine base formation  75.88 
 
 		 258 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.308542  normal  0.354276 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10035  hypothetical protein  71.98 
 
 		 257 aa  354  1e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.447139 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3832  wyosine base formation  58.37 
 
 		 269 aa  275  5e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.530439  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16480  conserved hypothetical protein TIGR03084  57.31 
 
 		 271 aa  274  1.0000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4430  Wyosine base formation domain protein  57.75 
 
 		 264 aa  265  5e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0401839 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0690  Wyosine base formation domain protein  61.16 
 
 		 261 aa  251  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4556  hypothetical protein  56.18 
 
 		 266 aa  249  3e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.67145  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1710  hypothetical protein  53.6 
 
 		 332 aa  233  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4764  wyosine base formation domain-containing protein  55.29 
 
 		 268 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000208476 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2825  hypothetical protein  52.14 
 
 		 260 aa  230  2e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7298  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4873  Wyosine base formation domain protein  57.98 
 
 		 261 aa  229  5e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4324  wyosine base formation  55.86 
 
 		 269 aa  228  6e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0254069 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3207  hypothetical protein  50.2 
 
 		 270 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.113668  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3218  wyosine base formation  50.2 
 
 		 270 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0337846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3269  wyosine base formation  50.2 
 
 		 270 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4597  wyosine base formation  48.22 
 
 		 270 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.992249 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6990  wyosine base formation  47.01 
 
 		 267 aa  212  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143006 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3148  hypothetical protein  47.13 
 
 		 269 aa  207  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2835  wyosine base formation  46.43 
 
 		 284 aa  205  5e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114649  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6694  wyosine base formation  49 
 
 		 270 aa  200  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.288227 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2706  wyosine base formation  45.24 
 
 		 306 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.338329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0343  hypothetical protein  46.99 
 
 		 264 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0559  wyosine base formation domain-containing protein  43.6 
 
 		 264 aa  187  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6381  wyosine base formation  41.25 
 
 		 266 aa  182  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0318909  normal  0.0240218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6364  Wyosine base formation domain protein  38.8 
 
 		 250 aa  157  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.24755 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1030  hypothetical protein  40.16 
 
 		 269 aa  156  4e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.098599  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4594  hypothetical protein  33.85 
 
 		 266 aa  129  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1024  hypothetical protein  30.89 
 
 		 259 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2414  hypothetical protein  35.68 
 
 		 266 aa  118  7e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.096621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2877  wyosine base formation  29.41 
 
 		 265 aa  105  7e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2103  hypothetical protein  32.39 
 
 		 216 aa  45.4  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3596  hypothetical protein  30.53 
 
 		 215 aa  42.4  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3523  hypothetical protein  30.53 
 
 		 215 aa  42.4  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>