40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2835 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2835  wyosine base formation  100 
 
 		 284 aa  560  1.0000000000000001e-159  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114649  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3207  hypothetical protein  49.8 
 
 		 270 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.113668  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3269  wyosine base formation  49.8 
 
 		 270 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3218  wyosine base formation  49.8 
 
 		 270 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0337846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4597  wyosine base formation  49.62 
 
 		 270 aa  249  4e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.992249 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0343  hypothetical protein  51.2 
 
 		 264 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6694  wyosine base formation  52.53 
 
 		 270 aa  240  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.288227 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4430  Wyosine base formation domain protein  50 
 
 		 264 aa  224  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0401839 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16480  conserved hypothetical protein TIGR03084  49.42 
 
 		 271 aa  215  9e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5394  hypothetical protein  46.43 
 
 		 258 aa  211  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5483  wyosine base formation  46.43 
 
 		 258 aa  211  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.308542  normal  0.354276 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5770  wyosine base formation  46.43 
 
 		 258 aa  211  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0624769  normal  0.773498 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1710  hypothetical protein  47.04 
 
 		 332 aa  209  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0848  wyosine base formation  46.43 
 
 		 260 aa  206  5e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.57773  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6059  hypothetical protein  45.24 
 
 		 258 aa  204  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3832  wyosine base formation  41.98 
 
 		 269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.530439  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10035  hypothetical protein  44.76 
 
 		 257 aa  191  8e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.447139 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4556  hypothetical protein  46.22 
 
 		 266 aa  186  4e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.67145  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1030  hypothetical protein  43.65 
 
 		 269 aa  185  8e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.098599  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4324  wyosine base formation  47.69 
 
 		 269 aa  183  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0254069 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4764  wyosine base formation domain-containing protein  47.1 
 
 		 268 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000208476 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4873  Wyosine base formation domain protein  47.83 
 
 		 261 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0690  Wyosine base formation domain protein  46.15 
 
 		 261 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3148  hypothetical protein  42.06 
 
 		 269 aa  171  9e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2825  hypothetical protein  44.54 
 
 		 260 aa  171  9e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7298  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6990  wyosine base formation  35.83 
 
 		 267 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143006 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2414  hypothetical protein  40.15 
 
 		 266 aa  159  4e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.096621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6381  wyosine base formation  37.35 
 
 		 266 aa  159  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0318909  normal  0.0240218 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2706  wyosine base formation  36.58 
 
 		 306 aa  159  7e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.338329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0559  wyosine base formation domain-containing protein  37.07 
 
 		 264 aa  156  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1024  hypothetical protein  32.3 
 
 		 259 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4594  hypothetical protein  29.07 
 
 		 266 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6364  Wyosine base formation domain protein  36.82 
 
 		 250 aa  125  8.000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.24755 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2877  wyosine base formation  28.46 
 
 		 265 aa  103  5e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1355  hypothetical protein  28.14 
 
 		 213 aa  50.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2431  hypothetical protein  29.6 
 
 		 163 aa  48.9  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4225  hypothetical protein  28.19 
 
 		 227 aa  43.9  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0824  hypothetical protein  28.76 
 
 		 198 aa  43.1  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3849  hypothetical protein  25.97 
 
 		 263 aa  42.7  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05210  hypothetical protein  27.64 
 
 		 227 aa  42.7  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>