38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6694 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6694  wyosine base formation  100 
 
 		 270 aa  525  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.288227 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4597  wyosine base formation  55.08 
 
 		 270 aa  261  6e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.992249 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3207  hypothetical protein  54.69 
 
 		 270 aa  255  6e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.113668  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3269  wyosine base formation  54.69 
 
 		 270 aa  255  6e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3218  wyosine base formation  54.69 
 
 		 270 aa  255  6e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0337846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2835  wyosine base formation  52.53 
 
 		 284 aa  252  4.0000000000000004e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114649  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4430  Wyosine base formation domain protein  50.93 
 
 		 264 aa  237  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0401839 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3832  wyosine base formation  49.81 
 
 		 269 aa  228  6e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.530439  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0343  hypothetical protein  46 
 
 		 264 aa  222  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16480  conserved hypothetical protein TIGR03084  50.19 
 
 		 271 aa  221  9e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1710  hypothetical protein  49.63 
 
 		 332 aa  216  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6059  hypothetical protein  48.63 
 
 		 258 aa  211  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0848  wyosine base formation  49 
 
 		 260 aa  211  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.57773  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5483  wyosine base formation  48.25 
 
 		 258 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.308542  normal  0.354276 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5770  wyosine base formation  48.25 
 
 		 258 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0624769  normal  0.773498 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10035  hypothetical protein  48.21 
 
 		 257 aa  210  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.447139 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5394  hypothetical protein  48.25 
 
 		 258 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4764  wyosine base formation domain-containing protein  50.38 
 
 		 268 aa  207  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000208476 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0690  Wyosine base formation domain protein  53.66 
 
 		 261 aa  206  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4873  Wyosine base formation domain protein  53.88 
 
 		 261 aa  205  7e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4324  wyosine base formation  50.37 
 
 		 269 aa  198  6e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0254069 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2825  hypothetical protein  45.28 
 
 		 260 aa  182  6e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7298  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3148  hypothetical protein  45.38 
 
 		 269 aa  181  9.000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6990  wyosine base formation  39.77 
 
 		 267 aa  178  8e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143006 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4556  hypothetical protein  46.51 
 
 		 266 aa  177  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.67145  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6381  wyosine base formation  39.16 
 
 		 266 aa  173  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0318909  normal  0.0240218 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2706  wyosine base formation  38.82 
 
 		 306 aa  171  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.338329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1030  hypothetical protein  43.92 
 
 		 269 aa  169  3e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.098599  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0559  wyosine base formation domain-containing protein  38.91 
 
 		 264 aa  156  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1024  hypothetical protein  36.65 
 
 		 259 aa  151  8.999999999999999e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4594  hypothetical protein  30.97 
 
 		 266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2877  wyosine base formation  33.07 
 
 		 265 aa  124  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2414  hypothetical protein  36.68 
 
 		 266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.096621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6364  Wyosine base formation domain protein  33.98 
 
 		 250 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.24755 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2431  hypothetical protein  30.51 
 
 		 163 aa  49.7  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6362  hypothetical protein  32.87 
 
 		 416 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3849  hypothetical protein  26.11 
 
 		 263 aa  48.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0410  hypothetical protein  29.79 
 
 		 277 aa  46.2  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249012  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>