22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3849 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3849  hypothetical protein  100 
 
 
263 aa  530  1e-149  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4433  hypothetical protein  36.09 
 
 
278 aa  143  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.986132  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3105  hypothetical protein  33.72 
 
 
286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.316613  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13116  hypothetical protein  36.92 
 
 
283 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1122  hypothetical protein  29.81 
 
 
261 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220847  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1478  hypothetical protein  29.55 
 
 
309 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1500  hypothetical protein  29.55 
 
 
309 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1475  hypothetical protein  29.17 
 
 
259 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2918  hypothetical protein  32.74 
 
 
233 aa  52  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1355  hypothetical protein  28.03 
 
 
213 aa  49.7  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6694  wyosine base formation  26.11 
 
 
270 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.288227 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3356  hypothetical protein  26.43 
 
 
194 aa  45.8  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0403747  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3528  hypothetical protein  32.39 
 
 
212 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3523  hypothetical protein  32.39 
 
 
215 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6990  wyosine base formation  23.95 
 
 
267 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.143006 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2411  hypothetical protein  21.59 
 
 
278 aa  44.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.261155  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3596  hypothetical protein  32.39 
 
 
215 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2519  hypothetical protein  27.7 
 
 
186 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.291648 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2969  hypothetical protein  30.53 
 
 
186 aa  43.5  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0761659 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3446  hypothetical protein  33.33 
 
 
234 aa  42.7  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.351822  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2835  wyosine base formation  25.97 
 
 
284 aa  42.7  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114649  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0691  hypothetical protein  27.27 
 
 
214 aa  42.4  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0325788 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>