35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6381 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6381  wyosine base formation  100 
 
 		 266 aa  540  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0318909  normal  0.0240218 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2706  wyosine base formation  58.08 
 
 		 306 aa  297  1e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.338329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6990  wyosine base formation  56.65 
 
 		 267 aa  293  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143006 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0559  wyosine base formation domain-containing protein  53.82 
 
 		 264 aa  263  2e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4430  Wyosine base formation domain protein  44.53 
 
 		 264 aa  219  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0401839 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4556  hypothetical protein  46 
 
 		 266 aa  212  5.999999999999999e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.67145  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4764  wyosine base formation domain-containing protein  47.73 
 
 		 268 aa  212  5.999999999999999e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000208476 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4873  Wyosine base formation domain protein  47.69 
 
 		 261 aa  208  9e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6364  Wyosine base formation domain protein  44.19 
 
 		 250 aa  207  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.24755 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5483  wyosine base formation  43.58 
 
 		 258 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.308542  normal  0.354276 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5770  wyosine base formation  43.58 
 
 		 258 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0624769  normal  0.773498 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5394  hypothetical protein  43.58 
 
 		 258 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3832  wyosine base formation  43.97 
 
 		 269 aa  205  8e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.530439  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6059  hypothetical protein  44.36 
 
 		 258 aa  204  9e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4597  wyosine base formation  44.06 
 
 		 270 aa  203  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.992249 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4324  wyosine base formation  46.84 
 
 		 269 aa  202  5e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0254069 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3207  hypothetical protein  42.75 
 
 		 270 aa  198  7e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.113668  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3269  wyosine base formation  42.75 
 
 		 270 aa  198  7e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3218  wyosine base formation  42.75 
 
 		 270 aa  198  7e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0337846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16480  conserved hypothetical protein TIGR03084  43.08 
 
 		 271 aa  198  7.999999999999999e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10035  hypothetical protein  42.02 
 
 		 257 aa  191  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.447139 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1710  hypothetical protein  44.09 
 
 		 332 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0848  wyosine base formation  41.25 
 
 		 260 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.57773  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0690  Wyosine base formation domain protein  43.25 
 
 		 261 aa  182  7e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3148  hypothetical protein  39.23 
 
 		 269 aa  177  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6694  wyosine base formation  39.16 
 
 		 270 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.288227 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2825  hypothetical protein  37.5 
 
 		 260 aa  159  3e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7298  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2835  wyosine base formation  37.8 
 
 		 284 aa  159  5e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114649  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0343  hypothetical protein  33.6 
 
 		 264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1030  hypothetical protein  33.2 
 
 		 269 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.098599  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4594  hypothetical protein  29.85 
 
 		 266 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1024  hypothetical protein  30.23 
 
 		 259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2414  hypothetical protein  26.67 
 
 		 266 aa  92  8e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.096621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2877  wyosine base formation  31.6 
 
 		 265 aa  89  8e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0057  hypothetical protein  25.95 
 
 		 201 aa  43.5  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2084 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>