34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0690 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0690  Wyosine base formation domain protein  100 
 
 		 261 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4430  Wyosine base formation domain protein  62.4 
 
 		 264 aa  297  1e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0401839 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6059  hypothetical protein  61.48 
 
 		 258 aa  288  8e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5394  hypothetical protein  61.11 
 
 		 258 aa  285  7e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5483  wyosine base formation  61.11 
 
 		 258 aa  285  7e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.308542  normal  0.354276 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5770  wyosine base formation  61.11 
 
 		 258 aa  285  7e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0624769  normal  0.773498 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16480  conserved hypothetical protein TIGR03084  58.78 
 
 		 271 aa  279  4e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10035  hypothetical protein  61.48 
 
 		 257 aa  278  6e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.447139 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0848  wyosine base formation  62 
 
 		 260 aa  278  9e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.57773  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3832  wyosine base formation  60.38 
 
 		 269 aa  277  1e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.530439  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4873  Wyosine base formation domain protein  61.92 
 
 		 261 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1710  hypothetical protein  56.59 
 
 		 332 aa  251  8.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4764  wyosine base formation domain-containing protein  56.39 
 
 		 268 aa  246  3e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000208476 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3207  hypothetical protein  54.23 
 
 		 270 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.113668  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3269  wyosine base formation  54.23 
 
 		 270 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3218  wyosine base formation  54.23 
 
 		 270 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0337846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4324  wyosine base formation  57.09 
 
 		 269 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0254069 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4556  hypothetical protein  55.95 
 
 		 266 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.67145  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6990  wyosine base formation  49.03 
 
 		 267 aa  232  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143006 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3148  hypothetical protein  50.76 
 
 		 269 aa  228  8e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6694  wyosine base formation  54.05 
 
 		 270 aa  226  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.288227 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4597  wyosine base formation  51.15 
 
 		 270 aa  225  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.992249 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2825  hypothetical protein  51.16 
 
 		 260 aa  224  8e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7298  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2706  wyosine base formation  47.45 
 
 		 306 aa  218  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.338329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2835  wyosine base formation  47.47 
 
 		 284 aa  215  4e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114649  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6381  wyosine base formation  43.89 
 
 		 266 aa  209  5e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0318909  normal  0.0240218 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0559  wyosine base formation domain-containing protein  45.25 
 
 		 264 aa  207  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0343  hypothetical protein  41.13 
 
 		 264 aa  178  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1030  hypothetical protein  40.47 
 
 		 269 aa  153  2e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.098599  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6364  Wyosine base formation domain protein  38.49 
 
 		 250 aa  152  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.24755 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1024  hypothetical protein  35.56 
 
 		 259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2414  hypothetical protein  40.72 
 
 		 266 aa  124  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.096621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4594  hypothetical protein  31.8 
 
 		 266 aa  122  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2877  wyosine base formation  31.62 
 
 		 265 aa  118  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>