34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4594 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4594  hypothetical protein  100 
 
 		 266 aa  547  1e-155  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1024  hypothetical protein  61.42 
 
 		 259 aa  324  1e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2877  wyosine base formation  51.32 
 
 		 265 aa  260  2e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4597  wyosine base formation  33.71 
 
 		 270 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.992249 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0848  wyosine base formation  33.85 
 
 		 260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.57773  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3832  wyosine base formation  32.95 
 
 		 269 aa  129  6e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.530439  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16480  conserved hypothetical protein TIGR03084  35.25 
 
 		 271 aa  128  8.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0343  hypothetical protein  34.47 
 
 		 264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2835  wyosine base formation  29.69 
 
 		 284 aa  125  9e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114649  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6694  wyosine base formation  30.97 
 
 		 270 aa  122  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.288227 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3207  hypothetical protein  31.66 
 
 		 270 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.113668  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3218  wyosine base formation  31.66 
 
 		 270 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0337846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3269  wyosine base formation  31.66 
 
 		 270 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6059  hypothetical protein  31.54 
 
 		 258 aa  118  7.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10035  hypothetical protein  32.03 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.447139 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5770  wyosine base formation  30.92 
 
 		 258 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0624769  normal  0.773498 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5483  wyosine base formation  30.92 
 
 		 258 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.308542  normal  0.354276 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5394  hypothetical protein  30.92 
 
 		 258 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0690  Wyosine base formation domain protein  31.27 
 
 		 261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6381  wyosine base formation  29.85 
 
 		 266 aa  112  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0318909  normal  0.0240218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4430  Wyosine base formation domain protein  30.47 
 
 		 264 aa  112  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0401839 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4556  hypothetical protein  30.62 
 
 		 266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.67145  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4764  wyosine base formation domain-containing protein  30.94 
 
 		 268 aa  102  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000208476 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3148  hypothetical protein  30.55 
 
 		 269 aa  102  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2825  hypothetical protein  29.37 
 
 		 260 aa  102  8e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7298  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2706  wyosine base formation  28.68 
 
 		 306 aa  96.3  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.338329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1710  hypothetical protein  27.65 
 
 		 332 aa  95.9  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1030  hypothetical protein  31.7 
 
 		 269 aa  94.7  1e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.098599  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4324  wyosine base formation  30.5 
 
 		 269 aa  94.7  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0254069 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6364  Wyosine base formation domain protein  26.82 
 
 		 250 aa  93.6  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.24755 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0559  wyosine base formation domain-containing protein  26.97 
 
 		 264 aa  88.6  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6990  wyosine base formation  27.55 
 
 		 267 aa  88.2  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143006 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2414  hypothetical protein  32.92 
 
 		 266 aa  84.7  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.096621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4873  Wyosine base formation domain protein  29.12 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>