35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3148 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3148  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  534  1e-151  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4556  hypothetical protein  59.68 
 
 		 266 aa  281  6.000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.67145  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4430  Wyosine base formation domain protein  55.68 
 
 		 264 aa  263  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0401839 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3832  wyosine base formation  54.55 
 
 		 269 aa  249  3e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.530439  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5394  hypothetical protein  49.81 
 
 		 258 aa  238  9e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5483  wyosine base formation  49.81 
 
 		 258 aa  238  9e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.308542  normal  0.354276 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5770  wyosine base formation  49.81 
 
 		 258 aa  238  9e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0624769  normal  0.773498 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6059  hypothetical protein  50.19 
 
 		 258 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10035  hypothetical protein  49.8 
 
 		 257 aa  221  7e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.447139 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3218  wyosine base formation  46.92 
 
 		 270 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0337846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3269  wyosine base formation  46.92 
 
 		 270 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3207  hypothetical protein  46.92 
 
 		 270 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.113668  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0848  wyosine base formation  47.13 
 
 		 260 aa  212  5.999999999999999e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.57773  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16480  conserved hypothetical protein TIGR03084  48.09 
 
 		 271 aa  209  5e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4597  wyosine base formation  45.63 
 
 		 270 aa  205  8e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.992249 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0690  Wyosine base formation domain protein  49.41 
 
 		 261 aa  202  6e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4764  wyosine base formation domain-containing protein  48.33 
 
 		 268 aa  200  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000208476 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2825  hypothetical protein  45.76 
 
 		 260 aa  195  8.000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7298  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4324  wyosine base formation  48.88 
 
 		 269 aa  194  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0254069 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4873  Wyosine base formation domain protein  47.92 
 
 		 261 aa  192  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1710  hypothetical protein  44.28 
 
 		 332 aa  189  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6381  wyosine base formation  39.23 
 
 		 266 aa  179  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0318909  normal  0.0240218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6990  wyosine base formation  41.33 
 
 		 267 aa  178  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143006 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6694  wyosine base formation  45.38 
 
 		 270 aa  178  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.288227 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2835  wyosine base formation  42.06 
 
 		 284 aa  176  4e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114649  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0343  hypothetical protein  38.65 
 
 		 264 aa  165  8e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2706  wyosine base formation  39.38 
 
 		 306 aa  154  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.338329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0559  wyosine base formation domain-containing protein  40 
 
 		 264 aa  150  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1030  hypothetical protein  38.28 
 
 		 269 aa  146  3e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.098599  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6364  Wyosine base formation domain protein  37.84 
 
 		 250 aa  145  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.24755 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1024  hypothetical protein  33.33 
 
 		 259 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2414  hypothetical protein  40.62 
 
 		 266 aa  115  6e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.096621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4594  hypothetical protein  30.55 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2877  wyosine base formation  30.97 
 
 		 265 aa  102  7e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1129  hypothetical protein  25.65 
 
 		 225 aa  43.9  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>