15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4225 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4225  hypothetical protein  100 
 
 
227 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2918  hypothetical protein  47.51 
 
 
233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3118  hypothetical protein  46.61 
 
 
234 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.27418  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0947  hypothetical protein  32.67 
 
 
220 aa  55.8  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.667579  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5026  hypothetical protein  26.42 
 
 
198 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1779  hypothetical protein  43.48 
 
 
220 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.20203  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0200  hypothetical protein  36.36 
 
 
196 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.29432  normal  0.0560607 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0690  hypothetical protein  27.37 
 
 
237 aa  45.8  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.435926 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3446  hypothetical protein  39.29 
 
 
234 aa  45.8  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.351822  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1392  protein of unknown function DUF1503  25.43 
 
 
272 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2835  wyosine base formation  28.19 
 
 
284 aa  44.3  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114649  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2756  hypothetical protein  23.81 
 
 
306 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348584  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2443  hypothetical protein  32.2 
 
 
238 aa  42.7  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00201258  normal  0.0194223 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2897  hypothetical protein  26.23 
 
 
218 aa  42.7  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.551165 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3609  hypothetical protein  34.69 
 
 
220 aa  42.4  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.171671  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>