13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2443 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2443  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  481  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00201258  normal  0.0194223 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3446  hypothetical protein  61.74 
 
 		 234 aa  280  2e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.351822  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3508  hypothetical protein  63.48 
 
 		 237 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.202242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0057  hypothetical protein  39.81 
 
 		 228 aa  145  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2399  hypothetical protein  29.41 
 
 		 214 aa  50.8  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.496136  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0559  wyosine base formation domain-containing protein  25 
 
 		 264 aa  47.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3206  hypothetical protein  32.04 
 
 		 200 aa  47.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000108092  hitchhiker  0.000809588 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04730  conserved hypothetical protein TIGR03086  37.31 
 
 		 196 aa  46.6  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.217314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6990  wyosine base formation  26.12 
 
 		 267 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143006 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3356  hypothetical protein  75 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0403747  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3609  hypothetical protein  42.86 
 
 		 220 aa  43.5  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.171671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4430  Wyosine base formation domain protein  25.52 
 
 		 264 aa  42.4  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0401839 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4225  hypothetical protein  32.2 
 
 		 227 aa  42.7  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>