38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3035 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3035  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  407  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0510116  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1443  hypothetical protein  46.7 
 
 		 211 aa  159  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.210948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2927  hypothetical protein  42.36 
 
 		 210 aa  142  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.549173 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2970  hypothetical protein  44.55 
 
 		 238 aa  137  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0094971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5808  hypothetical protein  41.79 
 
 		 206 aa  136  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2240  hypothetical protein  41.2 
 
 		 209 aa  134  9e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.168407  normal  0.37732 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0292  hypothetical protein  41.78 
 
 		 220 aa  131  7.999999999999999e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0452  hypothetical protein  39.71 
 
 		 205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0439  hypothetical protein  40.2 
 
 		 205 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.471698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0463  hypothetical protein  39.71 
 
 		 205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.78842 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3408  hypothetical protein  39.9 
 
 		 209 aa  125  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4607  hypothetical protein  39.41 
 
 		 210 aa  122  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0303145  hitchhiker  0.0000208711 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0630  hypothetical protein  38.1 
 
 		 207 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0331446 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2192  hypothetical protein  37.98 
 
 		 210 aa  115  6e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3182  hypothetical protein  39.9 
 
 		 209 aa  113  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.429032 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1677  hypothetical protein  36.71 
 
 		 220 aa  113  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.47521e-17 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0267  hypothetical protein  36.23 
 
 		 207 aa  107  9.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1682  hypothetical protein  36.06 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.087821  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12830  conserved hypothetical protein TIGR03085  36.95 
 
 		 248 aa  106  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.213535  normal  0.0190582 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0865  hypothetical protein  41.07 
 
 		 221 aa  104  9e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.642531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3980  hypothetical protein  39.9 
 
 		 203 aa  103  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6520  hypothetical protein  36.24 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.223836  normal  0.0543517 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10040  hypothetical protein  36.45 
 
 		 211 aa  101  8e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0305113  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1770  hypothetical protein  39.04 
 
 		 205 aa  98.2  7e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.92711  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3229  hypothetical protein  36.96 
 
 		 207 aa  98.2  8e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1996  hypothetical protein  37 
 
 		 210 aa  92.4  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11958  hypothetical protein  34.54 
 
 		 214 aa  92  6e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0608324  normal  0.971894 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2229  hypothetical protein  37.31 
 
 		 207 aa  89  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15570  conserved hypothetical protein TIGR03085  33.82 
 
 		 209 aa  86.3  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1129  hypothetical protein  31.84 
 
 		 225 aa  74.7  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20820  conserved hypothetical protein TIGR03085  32.02 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.395226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3523  hypothetical protein  33.08 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3596  hypothetical protein  33.08 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3528  hypothetical protein  29.75 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22230  hypothetical protein  32 
 
 		 184 aa  46.2  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12073  hypothetical protein  29.09 
 
 		 213 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3206  hypothetical protein  30.7 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000108092  hitchhiker  0.000809588 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1367  hypothetical protein  28.89 
 
 		 224 aa  42  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.824327  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>