28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3897 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3897  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  271  3e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0910689 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1355  hypothetical protein  70.27 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3742  hypothetical protein  50.85 
 
 		 280 aa  57.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3889  hypothetical protein  44 
 
 		 196 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3875  hypothetical protein  44 
 
 		 196 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.171113 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3963  hypothetical protein  44 
 
 		 196 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.73221  normal  0.396579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3528  hypothetical protein  52.27 
 
 		 212 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2411  hypothetical protein  54.55 
 
 		 278 aa  50.8  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.261155  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0520  hypothetical protein  52.38 
 
 		 198 aa  50.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05210  hypothetical protein  51.22 
 
 		 227 aa  50.1  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3523  hypothetical protein  42.37 
 
 		 215 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3596  hypothetical protein  42.37 
 
 		 215 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3084  hypothetical protein  43.18 
 
 		 209 aa  48.5  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3446  hypothetical protein  36.59 
 
 		 234 aa  47.8  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.351822  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3206  hypothetical protein  48.78 
 
 		 200 aa  47.4  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000108092  hitchhiker  0.000809588 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2399  hypothetical protein  43.18 
 
 		 214 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.496136  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0057  hypothetical protein  52.5 
 
 		 201 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2084 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0410  hypothetical protein  45.45 
 
 		 277 aa  45.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1779  hypothetical protein  41.51 
 
 		 220 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.20203  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2927  hypothetical protein  42.65 
 
 		 210 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.549173 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1595  hypothetical protein  32.47 
 
 		 218 aa  44.3  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.795711  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1367  hypothetical protein  43.9 
 
 		 224 aa  44.3  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.824327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3609  hypothetical protein  48.57 
 
 		 220 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.171671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0059  hypothetical protein  27.87 
 
 		 192 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3218  hypothetical protein  52.78 
 
 		 258 aa  41.6  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000118719  hitchhiker  0.000448278 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1129  hypothetical protein  40 
 
 		 225 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0105  hypothetical protein  39.53 
 
 		 187 aa  40.8  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0859584  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1699  hypothetical protein  41.86 
 
 		 194 aa  40.4  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0159021  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>