40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3084 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3084  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  415  9.999999999999999e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1355  hypothetical protein  55.39 
 
 		 213 aa  212  2.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0057  hypothetical protein  55.61 
 
 		 201 aa  178  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2084 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05210  hypothetical protein  50.49 
 
 		 227 aa  174  7e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1840  hypothetical protein  44.23 
 
 		 211 aa  147  9e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0519466  normal  0.0708195 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5928  hypothetical protein  42.36 
 
 		 215 aa  141  8e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4990  hypothetical protein  39.42 
 
 		 229 aa  122  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02000  hypothetical protein  37.25 
 
 		 215 aa  116  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3206  hypothetical protein  37 
 
 		 200 aa  108  6e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000108092  hitchhiker  0.000809588 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1367  hypothetical protein  39.13 
 
 		 224 aa  105  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.824327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12073  hypothetical protein  36.98 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4506  hypothetical protein  36.82 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0471296 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14430  hypothetical protein  36.97 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2103  hypothetical protein  37.56 
 
 		 216 aa  102  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2674  hypothetical protein  36.23 
 
 		 230 aa  102  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3646  hypothetical protein  35.44 
 
 		 205 aa  101  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588267  normal  0.0194127 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2399  hypothetical protein  35.75 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.496136  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2520  hypothetical protein  41.22 
 
 		 173 aa  97.8  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0328527  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3323  hypothetical protein  35.75 
 
 		 208 aa  93.6  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115476  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0318  hypothetical protein  36.23 
 
 		 203 aa  92.8  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0923  hypothetical protein  32.54 
 
 		 217 aa  89.7  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.56103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3889  hypothetical protein  35.23 
 
 		 196 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3963  hypothetical protein  35.23 
 
 		 196 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.73221  normal  0.396579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3875  hypothetical protein  35.23 
 
 		 196 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.171113 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4343  hypothetical protein  34.92 
 
 		 192 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.502553  normal  0.0390845 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1595  hypothetical protein  33.04 
 
 		 218 aa  84.3  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.795711  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1697  hypothetical protein  34.9 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.942057  normal  0.254485 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5391  hypothetical protein  38.55 
 
 		 167 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00711 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3523  hypothetical protein  33.98 
 
 		 215 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3596  hypothetical protein  33.98 
 
 		 215 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3528  hypothetical protein  34.78 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3609  hypothetical protein  30.09 
 
 		 220 aa  77.4  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.171671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2303  hypothetical protein  34.85 
 
 		 199 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.78102 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0520  hypothetical protein  32.97 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1737  hypothetical protein  30.93 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0267  hypothetical protein  29.03 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3508  hypothetical protein  45.24 
 
 		 237 aa  42.7  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.202242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1129  hypothetical protein  26.32 
 
 		 225 aa  42.4  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1677  hypothetical protein  31.68 
 
 		 220 aa  42.4  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.47521e-17 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4430  Wyosine base formation domain protein  30 
 
 		 264 aa  42.4  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0401839 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>