38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_14430 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_14430  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  429  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0923  hypothetical protein  50.47 
 
 
217 aa  198  5e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.56103  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02000  hypothetical protein  55.77 
 
 
215 aa  184  1.0000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4990  hypothetical protein  48.36 
 
 
229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3323  hypothetical protein  46.31 
 
 
208 aa  159  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115476  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1840  hypothetical protein  45.02 
 
 
211 aa  152  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0519466  normal  0.0708195 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5928  hypothetical protein  44.66 
 
 
215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0057  hypothetical protein  42.93 
 
 
201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.2084 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1367  hypothetical protein  39.73 
 
 
224 aa  120  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.824327  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1355  hypothetical protein  36.54 
 
 
213 aa  108  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3084  hypothetical protein  36.97 
 
 
209 aa  103  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05210  hypothetical protein  35.41 
 
 
227 aa  95.1  8e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3889  hypothetical protein  37.31 
 
 
196 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3963  hypothetical protein  37.31 
 
 
196 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.73221  normal  0.396579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3875  hypothetical protein  37.31 
 
 
196 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.171113 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3646  hypothetical protein  35.71 
 
 
205 aa  89.7  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588267  normal  0.0194127 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2520  hypothetical protein  38.36 
 
 
173 aa  88.2  8e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0328527  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2103  hypothetical protein  37.44 
 
 
216 aa  88.2  8e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0520  hypothetical protein  37.23 
 
 
198 aa  86.3  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4343  hypothetical protein  37.63 
 
 
192 aa  81.6  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.502553  normal  0.0390845 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2674  hypothetical protein  31.94 
 
 
230 aa  80.9  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1595  hypothetical protein  36.06 
 
 
218 aa  79.3  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.795711  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12073  hypothetical protein  34.65 
 
 
213 aa  78.6  0.00000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3609  hypothetical protein  33.8 
 
 
220 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.171671  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0318  hypothetical protein  33.8 
 
 
203 aa  76.3  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2399  hypothetical protein  32.73 
 
 
214 aa  75.9  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.496136  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3596  hypothetical protein  33.64 
 
 
215 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3523  hypothetical protein  33.64 
 
 
215 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3206  hypothetical protein  31.82 
 
 
200 aa  72.4  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000108092  hitchhiker  0.000809588 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2303  hypothetical protein  36.09 
 
 
199 aa  71.6  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.78102 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3528  hypothetical protein  33.94 
 
 
212 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1697  hypothetical protein  31.98 
 
 
202 aa  65.9  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.942057  normal  0.254485 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4506  hypothetical protein  34.85 
 
 
219 aa  65.1  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0471296 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5391  hypothetical protein  35.42 
 
 
167 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00711 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3446  hypothetical protein  44.68 
 
 
234 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.351822  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1737  hypothetical protein  32.32 
 
 
197 aa  42.4  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1699  hypothetical protein  29.44 
 
 
194 aa  42  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0159021  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1779  hypothetical protein  32.26 
 
 
220 aa  41.6  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.20203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>