38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4343 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4343  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  385  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.502553  normal  0.0390845 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2303  hypothetical protein  74.35 
 
 		 199 aa  290  9e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.78102 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3889  hypothetical protein  56.25 
 
 		 196 aa  216  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3963  hypothetical protein  56.25 
 
 		 196 aa  216  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.73221  normal  0.396579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3875  hypothetical protein  56.25 
 
 		 196 aa  216  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.171113 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1595  hypothetical protein  47.92 
 
 		 218 aa  151  7e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.795711  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3609  hypothetical protein  47.24 
 
 		 220 aa  150  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.171671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3206  hypothetical protein  43.01 
 
 		 200 aa  142  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000108092  hitchhiker  0.000809588 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4506  hypothetical protein  41.08 
 
 		 219 aa  111  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0471296 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2103  hypothetical protein  41.01 
 
 		 216 aa  107  8.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2399  hypothetical protein  36.98 
 
 		 214 aa  99.4  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.496136  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3646  hypothetical protein  34.38 
 
 		 205 aa  97.8  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588267  normal  0.0194127 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1840  hypothetical protein  38.22 
 
 		 211 aa  94  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0519466  normal  0.0708195 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2674  hypothetical protein  32.97 
 
 		 230 aa  87.8  8e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1367  hypothetical protein  36.61 
 
 		 224 aa  86.7  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.824327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5928  hypothetical protein  36.65 
 
 		 215 aa  86.3  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3323  hypothetical protein  35.29 
 
 		 208 aa  85.5  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115476  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3084  hypothetical protein  34.92 
 
 		 209 aa  84.3  9e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0520  hypothetical protein  35.98 
 
 		 198 aa  83.6  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14430  hypothetical protein  37.63 
 
 		 220 aa  81.6  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12073  hypothetical protein  35.15 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4990  hypothetical protein  34.55 
 
 		 229 aa  76.6  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05210  hypothetical protein  36.32 
 
 		 227 aa  74.7  0.0000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0057  hypothetical protein  36.36 
 
 		 201 aa  74.7  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2084 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0318  hypothetical protein  30.26 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2520  hypothetical protein  40.6 
 
 		 173 aa  73.2  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0328527  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1697  hypothetical protein  35.12 
 
 		 202 aa  71.2  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.942057  normal  0.254485 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1355  hypothetical protein  30.73 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1737  hypothetical protein  34.08 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02000  hypothetical protein  32.57 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3528  hypothetical protein  32.62 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3523  hypothetical protein  32.62 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0923  hypothetical protein  29.88 
 
 		 217 aa  53.9  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.56103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3596  hypothetical protein  32.62 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5391  hypothetical protein  33.33 
 
 		 167 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00711 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1699  hypothetical protein  28.95 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0159021  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1682  hypothetical protein  27.62 
 
 		 214 aa  45.8  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.087821  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1677  hypothetical protein  26.67 
 
 		 220 aa  42.7  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.47521e-17 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>