36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5928 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5928  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  429  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1840  hypothetical protein  68.29 
 
 		 211 aa  280  9e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0519466  normal  0.0708195 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4990  hypothetical protein  53.73 
 
 		 229 aa  191  9e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2520  hypothetical protein  61.04 
 
 		 173 aa  178  5.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0328527  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02000  hypothetical protein  48.79 
 
 		 215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14430  hypothetical protein  44.66 
 
 		 220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3084  hypothetical protein  42.36 
 
 		 209 aa  141  8e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1355  hypothetical protein  39.13 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3323  hypothetical protein  45.13 
 
 		 208 aa  135  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115476  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0923  hypothetical protein  38.54 
 
 		 217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.56103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05210  hypothetical protein  41.38 
 
 		 227 aa  125  5e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0057  hypothetical protein  39.36 
 
 		 201 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2084 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3206  hypothetical protein  37.11 
 
 		 200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000108092  hitchhiker  0.000809588 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3646  hypothetical protein  34.85 
 
 		 205 aa  99.4  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588267  normal  0.0194127 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2103  hypothetical protein  36.54 
 
 		 216 aa  98.2  8e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2674  hypothetical protein  35.44 
 
 		 230 aa  97.4  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4506  hypothetical protein  35.53 
 
 		 219 aa  91.3  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0471296 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2303  hypothetical protein  38.97 
 
 		 199 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.78102 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1367  hypothetical protein  32.54 
 
 		 224 aa  86.7  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.824327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4343  hypothetical protein  36.65 
 
 		 192 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.502553  normal  0.0390845 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2399  hypothetical protein  35 
 
 		 214 aa  84.7  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.496136  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3889  hypothetical protein  33.16 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3963  hypothetical protein  33.16 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.73221  normal  0.396579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3875  hypothetical protein  33.16 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.171113 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3528  hypothetical protein  35.85 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3523  hypothetical protein  35.85 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3596  hypothetical protein  35.85 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0318  hypothetical protein  33.51 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1595  hypothetical protein  34.33 
 
 		 218 aa  76.3  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.795711  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3609  hypothetical protein  32.42 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.171671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12073  hypothetical protein  33.16 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5391  hypothetical protein  36.69 
 
 		 167 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00711 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1697  hypothetical protein  33.16 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.942057  normal  0.254485 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0520  hypothetical protein  32.09 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1737  hypothetical protein  29.89 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3446  hypothetical protein  31.16 
 
 		 234 aa  41.6  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.351822  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>