37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0318 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0318  hypothetical protein  100 
 
 
203 aa  405  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2103  hypothetical protein  43.81 
 
 
216 aa  141  5e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2674  hypothetical protein  39.61 
 
 
230 aa  132  3.9999999999999996e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3206  hypothetical protein  35.53 
 
 
200 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000108092  hitchhiker  0.000809588 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2399  hypothetical protein  37.13 
 
 
214 aa  117  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.496136  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4506  hypothetical protein  38.38 
 
 
219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0471296 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1367  hypothetical protein  38.86 
 
 
224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.824327  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1840  hypothetical protein  37.19 
 
 
211 aa  102  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0519466  normal  0.0708195 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3889  hypothetical protein  37.5 
 
 
196 aa  99.4  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3963  hypothetical protein  37.5 
 
 
196 aa  99.4  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.73221  normal  0.396579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3875  hypothetical protein  37.5 
 
 
196 aa  99.4  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.171113 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05210  hypothetical protein  36.02 
 
 
227 aa  96.7  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3323  hypothetical protein  35.71 
 
 
208 aa  96.3  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115476  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3646  hypothetical protein  38.31 
 
 
205 aa  95.9  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588267  normal  0.0194127 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12073  hypothetical protein  35.14 
 
 
213 aa  95.5  5e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5391  hypothetical protein  41.67 
 
 
167 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00711 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3528  hypothetical protein  34.69 
 
 
212 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3084  hypothetical protein  36.23 
 
 
209 aa  92.8  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3609  hypothetical protein  33.97 
 
 
220 aa  91.7  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.171671  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3596  hypothetical protein  34.69 
 
 
215 aa  91.3  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3523  hypothetical protein  34.69 
 
 
215 aa  91.3  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0057  hypothetical protein  37.36 
 
 
201 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.2084 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1697  hypothetical protein  37.7 
 
 
202 aa  89.4  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.942057  normal  0.254485 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1595  hypothetical protein  35.24 
 
 
218 aa  85.9  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.795711  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0520  hypothetical protein  34.59 
 
 
198 aa  86.3  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2303  hypothetical protein  32.67 
 
 
199 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.78102 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4990  hypothetical protein  32.14 
 
 
229 aa  83.6  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5928  hypothetical protein  33.51 
 
 
215 aa  79.7  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1355  hypothetical protein  30.85 
 
 
213 aa  77.8  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14430  hypothetical protein  33.8 
 
 
220 aa  76.3  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1737  hypothetical protein  34.46 
 
 
197 aa  73.2  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4343  hypothetical protein  30.26 
 
 
192 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.502553  normal  0.0390845 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0923  hypothetical protein  30.88 
 
 
217 aa  69.7  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.56103  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2520  hypothetical protein  38.19 
 
 
173 aa  66.2  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0328527  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02000  hypothetical protein  31.96 
 
 
215 aa  62.4  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0824  hypothetical protein  27.81 
 
 
198 aa  41.2  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1843  hypothetical protein  28.57 
 
 
186 aa  41.2  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000379282  normal  0.068852 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>