13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3508 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3508  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  476  1e-133  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.202242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3446  hypothetical protein  63.91 
 
 		 234 aa  292  3e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.351822  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2443  hypothetical protein  63.48 
 
 		 238 aa  290  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00201258  normal  0.0194223 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0057  hypothetical protein  38.94 
 
 		 228 aa  146  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3206  hypothetical protein  26.53 
 
 		 200 aa  50.1  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000108092  hitchhiker  0.000809588 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2706  wyosine base formation  25.55 
 
 		 306 aa  46.2  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.338329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6990  wyosine base formation  24.38 
 
 		 267 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143006 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3609  hypothetical protein  29.06 
 
 		 220 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.171671  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3084  hypothetical protein  45.24 
 
 		 209 aa  42.7  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2399  hypothetical protein  54.29 
 
 		 214 aa  42.7  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.496136  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2969  hypothetical protein  46.81 
 
 		 186 aa  42  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0761659 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3356  hypothetical protein  51.35 
 
 		 194 aa  42  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0403747  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04730  conserved hypothetical protein TIGR03086  32.2 
 
 		 196 aa  41.6  0.01  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.217314  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>