12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0057 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0057  hypothetical protein  100 
 
 		 228 aa  458  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3446  hypothetical protein  40.89 
 
 		 234 aa  162  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.351822  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2443  hypothetical protein  39.82 
 
 		 238 aa  148  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00201258  normal  0.0194223 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3508  hypothetical protein  38.94 
 
 		 237 aa  137  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.202242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2706  wyosine base formation  28.07 
 
 		 306 aa  48.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.338329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3646  hypothetical protein  25.87 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588267  normal  0.0194127 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13116  hypothetical protein  28.48 
 
 		 283 aa  43.9  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1595  hypothetical protein  29.77 
 
 		 218 aa  44.3  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.795711  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3528  hypothetical protein  37.88 
 
 		 212 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0559  wyosine base formation domain-containing protein  26.14 
 
 		 264 aa  42.4  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2877  wyosine base formation  32.35 
 
 		 265 aa  42.4  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3206  hypothetical protein  28.33 
 
 		 200 aa  42.4  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000108092  hitchhiker  0.000809588 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>