59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0149 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0149  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  387  1e-107  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214633  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0824  hypothetical protein  38.78 
 
 
198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2519  hypothetical protein  31.72 
 
 
186 aa  90.9  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.291648 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6625  hypothetical protein  35.94 
 
 
189 aa  89.7  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2150  hypothetical protein  31.75 
 
 
206 aa  81.3  0.000000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2196  hypothetical protein  31.75 
 
 
206 aa  81.3  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582945  normal  0.0278946 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2137  hypothetical protein  31.75 
 
 
206 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00112657 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1384  hypothetical protein  32.45 
 
 
184 aa  78.2  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.132892  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10752  hypothetical protein  31.28 
 
 
182 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000019473  normal  0.221771 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3545  hypothetical protein  30.05 
 
 
197 aa  75.5  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.266411  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5694  hypothetical protein  31.91 
 
 
190 aa  74.7  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.195445 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4511  hypothetical protein  34.44 
 
 
188 aa  73.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0916947  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7305  hypothetical protein  30.39 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2526  hypothetical protein  31.33 
 
 
202 aa  72.4  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19758  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4394  hypothetical protein  34.46 
 
 
186 aa  71.6  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.487067  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5441  hypothetical protein  30.73 
 
 
194 aa  71.2  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1118  hypothetical protein  29.26 
 
 
190 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.581554 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5150  hypothetical protein  31.05 
 
 
189 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04730  conserved hypothetical protein TIGR03086  32.53 
 
 
196 aa  67.4  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.217314  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7213  hypothetical protein  32.04 
 
 
180 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3764  hypothetical protein  35.23 
 
 
194 aa  66.2  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.343176  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2932  hypothetical protein  31.82 
 
 
226 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1843  hypothetical protein  29.47 
 
 
186 aa  64.7  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000379282  normal  0.068852 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2112  hypothetical protein  32.34 
 
 
177 aa  63.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1542  hypothetical protein  30.34 
 
 
184 aa  63.5  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.272764  hitchhiker  0.00246606 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5062  hypothetical protein  32.32 
 
 
167 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1069  hypothetical protein  31.43 
 
 
191 aa  61.6  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0874  hypothetical protein  30.11 
 
 
197 aa  61.6  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0334  hypothetical protein  28.47 
 
 
230 aa  60.5  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0200  hypothetical protein  26.02 
 
 
196 aa  59.7  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.29432  normal  0.0560607 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4205  hypothetical protein  34.27 
 
 
185 aa  59.3  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520104  normal  0.0181669 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4956  hypothetical protein  32.07 
 
 
207 aa  57  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56336  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4530  hypothetical protein  29.79 
 
 
183 aa  57.4  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.635551 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1401  hypothetical protein  29.21 
 
 
194 aa  55.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136211  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11744  hypothetical protein  29.66 
 
 
189 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213346  normal  0.501181 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1355  hypothetical protein  34.06 
 
 
213 aa  54.7  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2465  hypothetical protein  28.4 
 
 
193 aa  54.7  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00930954  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13807  hypothetical protein  25.4 
 
 
194 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.280753  normal  0.497634 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0915  hypothetical protein  25.79 
 
 
197 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.649673  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  25.41 
 
 
437 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22230  hypothetical protein  27.63 
 
 
184 aa  50.4  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3933  hypothetical protein  31.58 
 
 
198 aa  49.3  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0576755  hitchhiker  0.00503729 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2309  hypothetical protein  25.25 
 
 
193 aa  48.9  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0901282  normal  0.039758 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2270  hypothetical protein  30.15 
 
 
198 aa  48.5  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.674256  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5427  hypothetical protein  32.33 
 
 
198 aa  48.5  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4018  hypothetical protein  27.42 
 
 
196 aa  48.5  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.483907  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1453  hypothetical protein  26.01 
 
 
186 aa  48.5  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.313622  normal  0.465473 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0105  hypothetical protein  26.59 
 
 
187 aa  47.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0859584  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2648  hypothetical protein  30.17 
 
 
191 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0118253  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6121  hypothetical protein  23.62 
 
 
202 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18336  normal  0.0364143 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4984  hypothetical protein  23.66 
 
 
194 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5365  hypothetical protein  23.66 
 
 
194 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.561933 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5072  hypothetical protein  23.66 
 
 
194 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3356  hypothetical protein  22.75 
 
 
194 aa  46.2  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0403747  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1558  hypothetical protein  27.56 
 
 
200 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.131331 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3542  hypothetical protein  28.74 
 
 
157 aa  45.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325273  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0059  hypothetical protein  21.67 
 
 
192 aa  45.1  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2103  hypothetical protein  31.25 
 
 
216 aa  45.1  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4594  hypothetical protein  26.6 
 
 
187 aa  44.7  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.232846  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>