56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0334 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0334  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  449  1e-125  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2137  hypothetical protein  55.12 
 
 
206 aa  185  5e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00112657 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6121  hypothetical protein  49.25 
 
 
202 aa  179  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18336  normal  0.0364143 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2150  hypothetical protein  52.68 
 
 
206 aa  174  8e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2196  hypothetical protein  52.68 
 
 
206 aa  174  8e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582945  normal  0.0278946 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2465  hypothetical protein  51.04 
 
 
193 aa  159  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00930954  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1558  hypothetical protein  52.04 
 
 
200 aa  141  8e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.131331 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0059  hypothetical protein  32.32 
 
 
192 aa  88.2  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8890  hypothetical protein  30.94 
 
 
199 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2519  hypothetical protein  30.6 
 
 
186 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.291648 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0915  hypothetical protein  32.31 
 
 
197 aa  69.3  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.649673  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10752  hypothetical protein  31.22 
 
 
182 aa  62  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000019473  normal  0.221771 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2932  hypothetical protein  29.38 
 
 
226 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0149  hypothetical protein  28.47 
 
 
194 aa  60.8  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214633  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7213  hypothetical protein  27.84 
 
 
180 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3545  hypothetical protein  30.65 
 
 
197 aa  59.7  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.266411  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2526  hypothetical protein  28.86 
 
 
202 aa  59.3  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19758  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5694  hypothetical protein  32.26 
 
 
190 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.195445 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4205  hypothetical protein  26.29 
 
 
185 aa  57  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520104  normal  0.0181669 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2112  hypothetical protein  29.12 
 
 
177 aa  56.6  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0874  hypothetical protein  28.57 
 
 
197 aa  56.2  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0824  hypothetical protein  28.04 
 
 
198 aa  55.8  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1542  hypothetical protein  28.72 
 
 
184 aa  56.2  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.272764  hitchhiker  0.00246606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5427  hypothetical protein  32.43 
 
 
198 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1118  hypothetical protein  32.78 
 
 
190 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.581554 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2648  hypothetical protein  31.37 
 
 
191 aa  53.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0118253  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2309  hypothetical protein  29.23 
 
 
193 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0901282  normal  0.039758 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0105  hypothetical protein  29.31 
 
 
187 aa  52.4  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0859584  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5150  hypothetical protein  30.94 
 
 
189 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11744  hypothetical protein  33.58 
 
 
189 aa  52  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213346  normal  0.501181 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4018  hypothetical protein  32.84 
 
 
196 aa  52  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.483907  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3933  hypothetical protein  30.52 
 
 
198 aa  51.6  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0576755  hitchhiker  0.00503729 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4511  hypothetical protein  28.41 
 
 
188 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0916947  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3356  hypothetical protein  28.89 
 
 
194 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0403747  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1843  hypothetical protein  26.94 
 
 
186 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000379282  normal  0.068852 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4394  hypothetical protein  30.6 
 
 
186 aa  50.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.487067  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5441  hypothetical protein  30.39 
 
 
194 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4594  hypothetical protein  30.19 
 
 
187 aa  49.3  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.232846  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5062  hypothetical protein  30.81 
 
 
167 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6375  hypothetical protein  29.28 
 
 
220 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.172776 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1401  hypothetical protein  28.27 
 
 
194 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136211  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3298  hypothetical protein  28.65 
 
 
200 aa  47.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.584526  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3764  hypothetical protein  29.89 
 
 
194 aa  47  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.343176  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1453  hypothetical protein  29.9 
 
 
186 aa  45.8  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.313622  normal  0.465473 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5365  hypothetical protein  27.12 
 
 
194 aa  45.1  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.561933 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4984  hypothetical protein  27.12 
 
 
194 aa  45.1  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5072  hypothetical protein  27.12 
 
 
194 aa  45.1  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2270  hypothetical protein  26.51 
 
 
198 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.674256  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3649  hypothetical protein  27.31 
 
 
238 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0565628 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1384  hypothetical protein  29.58 
 
 
184 aa  43.9  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.132892  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  30 
 
 
437 aa  43.5  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04730  conserved hypothetical protein TIGR03086  28.33 
 
 
196 aa  43.5  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.217314  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2103  hypothetical protein  31.55 
 
 
216 aa  42.4  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3609  hypothetical protein  25.98 
 
 
220 aa  42  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.171671  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4038  hypothetical protein  31.3 
 
 
188 aa  42  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000921877  normal  0.0152581 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22230  hypothetical protein  31.01 
 
 
184 aa  41.6  0.01  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>