49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4018 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4018  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  379  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.483907  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1118  hypothetical protein  46.32 
 
 		 190 aa  157  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.581554 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1401  hypothetical protein  46.07 
 
 		 194 aa  155  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5441  hypothetical protein  47.34 
 
 		 194 aa  154  9e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5150  hypothetical protein  46.28 
 
 		 189 aa  151  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1069  hypothetical protein  46.03 
 
 		 191 aa  150  8.999999999999999e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5694  hypothetical protein  46.84 
 
 		 190 aa  150  8.999999999999999e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195445 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3764  hypothetical protein  49.74 
 
 		 194 aa  150  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.343176  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5062  hypothetical protein  49.09 
 
 		 167 aa  145  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0915  hypothetical protein  41.4 
 
 		 197 aa  128  6e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.649673  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2648  hypothetical protein  40 
 
 		 191 aa  104  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0118253  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4205  hypothetical protein  33.33 
 
 		 185 aa  94.7  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520104  normal  0.0181669 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7213  hypothetical protein  35.39 
 
 		 180 aa  88.2  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4394  hypothetical protein  36.46 
 
 		 186 aa  87.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.487067  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4956  hypothetical protein  33.33 
 
 		 207 aa  85.1  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6625  hypothetical protein  30.51 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0059  hypothetical protein  28.96 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4511  hypothetical protein  29.1 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0916947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1542  hypothetical protein  35.09 
 
 		 184 aa  60.5  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.272764  hitchhiker  0.00246606 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1843  hypothetical protein  27.23 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000379282  normal  0.068852 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6121  hypothetical protein  28.8 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18336  normal  0.0364143 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3545  hypothetical protein  30.21 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.266411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4594  hypothetical protein  31.03 
 
 		 187 aa  50.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.232846  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13807  hypothetical protein  26.9 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.280753  normal  0.497634 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0824  hypothetical protein  29.7 
 
 		 198 aa  49.3  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2519  hypothetical protein  29.55 
 
 		 186 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.291648 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1384  hypothetical protein  31.18 
 
 		 184 aa  49.3  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.132892  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2270  hypothetical protein  26.19 
 
 		 198 aa  48.5  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.674256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8890  hypothetical protein  26.86 
 
 		 199 aa  48.5  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 437 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4984  hypothetical protein  30.69 
 
 		 194 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5365  hypothetical protein  30.69 
 
 		 194 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.561933 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5072  hypothetical protein  30.69 
 
 		 194 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0149  hypothetical protein  27.78 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2137  hypothetical protein  29.21 
 
 		 206 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00112657 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2932  hypothetical protein  27.72 
 
 		 226 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2150  hypothetical protein  28.71 
 
 		 206 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2196  hypothetical protein  28.71 
 
 		 206 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582945  normal  0.0278946 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2465  hypothetical protein  23.88 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00930954  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04730  conserved hypothetical protein TIGR03086  25.77 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.217314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11744  hypothetical protein  30.1 
 
 		 189 aa  44.7  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213346  normal  0.501181 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3356  hypothetical protein  29.78 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0403747  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0334  hypothetical protein  30.54 
 
 		 230 aa  43.5  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4038  hypothetical protein  26.92 
 
 		 188 aa  42.4  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000921877  normal  0.0152581 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10752  hypothetical protein  26.36 
 
 		 182 aa  42.4  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000019473  normal  0.221771 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0874  hypothetical protein  30.56 
 
 		 197 aa  42  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3933  hypothetical protein  27.86 
 
 		 198 aa  42  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0576755  hitchhiker  0.00503729 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1453  hypothetical protein  36.05 
 
 		 186 aa  41.2  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.313622  normal  0.465473 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6375  hypothetical protein  27.09 
 
 		 220 aa  41.2  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.172776 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>