36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1401 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1401  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  388  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136211  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4018  hypothetical protein  46.07 
 
 
196 aa  155  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.483907  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5441  hypothetical protein  48.17 
 
 
194 aa  154  6e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5150  hypothetical protein  47.64 
 
 
189 aa  152  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3764  hypothetical protein  48.97 
 
 
194 aa  149  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.343176  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1069  hypothetical protein  43.3 
 
 
191 aa  147  7e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1118  hypothetical protein  43.23 
 
 
190 aa  142  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.581554 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5062  hypothetical protein  48.54 
 
 
167 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5694  hypothetical protein  39.9 
 
 
190 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.195445 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0915  hypothetical protein  41.95 
 
 
197 aa  122  4e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.649673  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4205  hypothetical protein  38.33 
 
 
185 aa  112  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520104  normal  0.0181669 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7213  hypothetical protein  35.57 
 
 
180 aa  97.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4394  hypothetical protein  35.98 
 
 
186 aa  96.7  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.487067  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4956  hypothetical protein  32.11 
 
 
207 aa  87  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56336  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2648  hypothetical protein  35.43 
 
 
191 aa  82.4  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0118253  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1542  hypothetical protein  32.6 
 
 
184 aa  73.9  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.272764  hitchhiker  0.00246606 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3545  hypothetical protein  27.42 
 
 
197 aa  71.6  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.266411  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0059  hypothetical protein  29.44 
 
 
192 aa  68.9  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2932  hypothetical protein  32.82 
 
 
226 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6625  hypothetical protein  31.18 
 
 
189 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0824  hypothetical protein  29.85 
 
 
198 aa  57.4  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  29.19 
 
 
437 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4511  hypothetical protein  25.54 
 
 
188 aa  55.1  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0916947  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4984  hypothetical protein  26.74 
 
 
194 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10752  hypothetical protein  28.09 
 
 
182 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000019473  normal  0.221771 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5365  hypothetical protein  26.74 
 
 
194 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.561933 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5072  hypothetical protein  26.74 
 
 
194 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0149  hypothetical protein  27.68 
 
 
194 aa  50.4  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214633  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1384  hypothetical protein  29.78 
 
 
184 aa  47  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.132892  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6121  hypothetical protein  26.32 
 
 
202 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18336  normal  0.0364143 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1843  hypothetical protein  28.18 
 
 
186 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000379282  normal  0.068852 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2519  hypothetical protein  30.53 
 
 
186 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.291648 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0334  hypothetical protein  28.27 
 
 
230 aa  43.1  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2465  hypothetical protein  31.94 
 
 
193 aa  42.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00930954  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3356  hypothetical protein  29.71 
 
 
194 aa  42.4  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0403747  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0874  hypothetical protein  29.57 
 
 
197 aa  42  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>