37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_02890 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_02890  conserved hypothetical protein TIGR03086  100 
 
 		 187 aa  379  1e-104  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1377  hypothetical protein  47.83 
 
 		 194 aa  135  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2350  hypothetical protein  43.82 
 
 		 187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.146654  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4530  hypothetical protein  34.76 
 
 		 183 aa  82.4  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.635551 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2969  hypothetical protein  30.68 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0761659 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0105  hypothetical protein  33.06 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0859584  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4038  hypothetical protein  35.66 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000921877  normal  0.0152581 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4394  hypothetical protein  28.65 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.487067  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3542  hypothetical protein  27.74 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04730  conserved hypothetical protein TIGR03086  27.17 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.217314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0200  hypothetical protein  28.02 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.29432  normal  0.0560607 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2519  hypothetical protein  28.14 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.291648 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1843  hypothetical protein  30.23 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000379282  normal  0.068852 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6625  hypothetical protein  28.4 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10752  hypothetical protein  29.03 
 
 		 182 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000019473  normal  0.221771 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7305  hypothetical protein  30.51 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4205  hypothetical protein  31.15 
 
 		 185 aa  53.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520104  normal  0.0181669 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2309  hypothetical protein  26.01 
 
 		 193 aa  52  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0901282  normal  0.039758 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2290  hypothetical protein  30.38 
 
 		 190 aa  52  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1542  hypothetical protein  27.39 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.272764  hitchhiker  0.00246606 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0915  hypothetical protein  26.01 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.649673  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2526  hypothetical protein  27.62 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22230  hypothetical protein  29.37 
 
 		 184 aa  49.7  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4956  hypothetical protein  26.2 
 
 		 207 aa  48.9  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0824  hypothetical protein  31.62 
 
 		 198 aa  48.9  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8890  hypothetical protein  26.86 
 
 		 199 aa  48.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3545  hypothetical protein  26.49 
 
 		 197 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.266411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2648  hypothetical protein  26.67 
 
 		 191 aa  46.2  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0118253  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0059  hypothetical protein  27.53 
 
 		 192 aa  45.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2112  hypothetical protein  27.44 
 
 		 177 aa  45.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1384  hypothetical protein  27.59 
 
 		 184 aa  44.7  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.132892  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4246  hypothetical protein  28.8 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0354747  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5150  hypothetical protein  26.2 
 
 		 189 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5441  hypothetical protein  26.11 
 
 		 194 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5062  hypothetical protein  26.32 
 
 		 167 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7213  hypothetical protein  27.92 
 
 		 180 aa  42.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0076  MgtE intracellular region  31.34 
 
 		 459 aa  41.6  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>