More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2667 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2667  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 		 127 aa  256  8e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3062  biopolymer transport protein ExbD/TolR  69.29 
 
 		 127 aa  192  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.196503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0729  biopolymer transport protein ExbD/TolR  61.42 
 
 		 127 aa  168  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120053  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2279  biopolymer transport protein ExbD/TolR  53.97 
 
 		 138 aa  151  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.435564 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1466  biopolymer transport protein ExbD/TolR  48.39 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0559794  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3669  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.27 
 
 		 127 aa  110  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1249  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.34 
 
 		 125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0628  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.62 
 
 		 130 aa  101  3e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.203844  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2158  TonB system transport protein ExbD  41.13 
 
 		 131 aa  92.8  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0277  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.1 
 
 		 127 aa  84.7  3e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0848  TonB system transport protein ExbD  33.9 
 
 		 128 aa  82  0.000000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000199461  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0717  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.962323  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1568  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.96 
 
 		 127 aa  78.6  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.969872  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0393  TonB system transport protein ExbD  35.54 
 
 		 127 aa  78.6  0.00000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0498331  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1369  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.95 
 
 		 133 aa  77.4  0.00000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0690  biopolymer transport protein  33.06 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0276966  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1241  TonB system transport protein ExbD  32.48 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.977225  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1003  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.17 
 
 		 125 aa  73.6  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0467  TonB system transport protein ExbD  30.25 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0283  TonB system transport protein ExbD  30.25 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1619  protein TolR  30.77 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.1444  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2237  biopolymer ExbD/TolR family transporter  29.23 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271991  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1650  TonB system transport protein ExbD  31.93 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.351181  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2991  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.54 
 
 		 134 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158684  normal  0.0282837 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2066  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.08 
 
 		 135 aa  70.1  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1617  protein TolR  30 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776263  hitchhiker  0.0037279 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.15 
 
 		 166 aa  68.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1899  protein TolR  30 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.937922 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1623  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.64 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122502  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1015  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.28 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1227  tolR protein  31.82 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2919  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.77 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0661927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0879  TonB system transport protein ExbD  31.3 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2221  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.23 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.109447  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0400  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.02 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.376121  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1801  biopolymer transport exbD protein  30.84 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.221711  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1988  biopolymer transport exbD protein  30.84 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3136  protein TolR  29.37 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1525  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.79 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0168753  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1620  biopolymer transport exbD protein  31.78 
 
 		 136 aa  63.5  0.0000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.916703  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1855  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.58 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126112  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0358  biopolymer ExbD/TolR family transporter  29.55 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0309097 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2733  protein TolR  32.58 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0139663  hitchhiker  0.0000179602 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2120  biopolymer transport TolR  30.4 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0523748  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3166  protein TolR  32.26 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0105  TonB system transport protein ExbD, putative  35.16 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.664696  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0198  TonB system transport protein ExbD  36.15 
 
 		 128 aa  62  0.000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00125254  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2608  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.08 
 
 		 135 aa  62  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0145  TonB system transport protein ExbD, putative  35.16 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000057869  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.45 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0117  TonB system transport protein ExbD, putative  35.16 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000384782  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0527  protein TolR  28.03 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0330  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.92 
 
 		 173 aa  60.8  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2566  biopolymer transport TolR  31.82 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000208666  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0646  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.67 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.419547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0486  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  31.67 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.244667  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1088  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.23 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00516772  normal  0.155031 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2402  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.36 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.705571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2088  tolR protein  29.32 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00030908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2024  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.48 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.34025 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1543  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.77 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0391  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.24 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2367  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.27 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2106  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.14 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2955  putative TolR-like translocation protein  28.03 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163827  normal  0.682621 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1392  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.1 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000255119  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2192  biopolymer transport TolR  27.34 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0164726  normal  0.458286 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1213  protein TolR  28.46 
 
 		 147 aa  57  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1730  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.03 
 
 		 132 aa  57  0.00000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2499  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.17 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0684  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.78 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.508331  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02686  Biopolymer transport protein  28.79 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00153637  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0784  protein TolR  31.58 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0363173  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1012  TonB system transport protein  30 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0874  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.7959 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0711  putative biopolymer transport protein  30 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0310861 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4816  transport protein ExbD  34.17 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55340  transport protein ExbD  34.17 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00981285 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2215  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.85 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3520  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.84 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1740  biopolymer transport TolR  29.32 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000388711  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2154  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.8914  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2540  protein TolR  29.32 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000662541  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1744  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.32 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000276409  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2941  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.36 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000159512  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.19 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1460  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.09 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0971  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.75 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1783  protein TolR  29.32 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000043737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3389  protein TolR  29.41 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436196  normal  0.250194 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2418  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.77 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1573  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.15 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.320463 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1461  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.52 
 
 		 154 aa  53.5  0.0000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.247373  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5529  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.92 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2403  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.34 
 
 		 135 aa  53.5  0.0000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1076  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.98 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1109  biopolymer transport TolR  28.1 
 
 		 134 aa  53.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00176605  normal  0.311844 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2225  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.92 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5877  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.92 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2239  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.15 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>