More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0467 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0467  TonB system transport protein ExbD  100 
 
 		 129 aa  246  5e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1620  biopolymer transport exbD protein  68.22 
 
 		 136 aa  171  2.9999999999999996e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.916703  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1801  biopolymer transport exbD protein  67.44 
 
 		 136 aa  171  3.9999999999999995e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.221711  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1988  biopolymer transport exbD protein  66.67 
 
 		 136 aa  169  1e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1650  TonB system transport protein ExbD  62.02 
 
 		 129 aa  164  5e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.351181  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0393  TonB system transport protein ExbD  61.29 
 
 		 127 aa  154  6e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0498331  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1241  TonB system transport protein ExbD  59.68 
 
 		 126 aa  144  6e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.977225  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0848  TonB system transport protein ExbD  52.46 
 
 		 128 aa  124  5e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000199461  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0283  TonB system transport protein ExbD  51.56 
 
 		 126 aa  124  6e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0879  TonB system transport protein ExbD  48.78 
 
 		 127 aa  119  9.999999999999999e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0628  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.83 
 
 		 130 aa  95.9  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.203844  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1568  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.18 
 
 		 127 aa  95.1  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.969872  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2158  TonB system transport protein ExbD  39.66 
 
 		 131 aa  93.6  8e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0717  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.86 
 
 		 126 aa  92  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.962323  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3062  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.97 
 
 		 127 aa  85.5  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.196503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1249  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.29 
 
 		 125 aa  85.5  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3669  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.04 
 
 		 127 aa  84.7  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1003  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.43 
 
 		 125 aa  84.7  4e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0277  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.59 
 
 		 127 aa  83.6  7e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1623  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.79 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122502  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0690  biopolymer transport protein  33.33 
 
 		 132 aa  80.1  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0276966  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1466  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0559794  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2279  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.19 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.435564 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1369  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.67 
 
 		 133 aa  75.1  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1543  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.19 
 
 		 135 aa  73.6  0.0000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2066  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.62 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2667  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.25 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0729  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.91 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120053  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2589  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.83 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.382062  hitchhiker  0.000000237185 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0400  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.67 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.376121  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1525  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.4 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0168753  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1522  ExbDTolR family transport protein  31.09 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3381  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.33 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000113024 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2237  biopolymer ExbD/TolR family transporter  28.93 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271991  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2566  biopolymer transport TolR  23.81 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000208666  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04990  TolR-like protein  27.86 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0118688  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2733  protein TolR  23.81 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0139663  hitchhiker  0.0000179602 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.17 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1855  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.02 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126112  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3619  protein TolR  23.58 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0506  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.59 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529067  hitchhiker  0.000695312 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  24.17 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0478  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0725  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.154388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2145  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.97 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2569  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.97 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  20 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1587  protein TolR  22.13 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.437138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2531  biopolymer transport protein  25.58 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000400528  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2088  tolR protein  21.54 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00030908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2221  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.61 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.109447  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0313  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.83 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1783  protein TolR  22.66 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000043737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.62 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1227  tolR protein  25.2 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0105  TonB system transport protein ExbD, putative  29.84 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.664696  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1531  hypothetical protein  21.37 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1452  hypothetical protein  21.37 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0145  TonB system transport protein ExbD, putative  29.84 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000057869  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2719  biopolymer transport protein ExbD/TolR  21.31 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.746273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1573  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.77 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.320463 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2402  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.2 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.705571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0575  biopolymer transport protein ExbD/TolR  20.83 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0470  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.83 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.923665 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0594  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.83 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0117  TonB system transport protein ExbD, putative  29.84 
 
 		 129 aa  51.6  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000384782  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1370  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.2 
 
 		 140 aa  51.6  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1744  biopolymer transport protein ExbD/TolR  21.88 
 
 		 144 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000276409  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2540  protein TolR  21.88 
 
 		 144 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000662541  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1851  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.03 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2212  biopolymer transport TolR  24.17 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000948089  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1740  biopolymer transport TolR  21.88 
 
 		 144 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000388711  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1512  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.97 
 
 		 133 aa  51.6  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0534  protein TolR  22.9 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156343  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1114  biopolymer transport protein ExbD/TolR  22.88 
 
 		 141 aa  51.2  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.809728  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0872  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.19 
 
 		 141 aa  51.2  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.532124  normal  0.142279 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3173  biopolymer transport protein ExbD/TolR  22.66 
 
 		 149 aa  51.2  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.673251  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0527  protein TolR  21.97 
 
 		 155 aa  51.6  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1729  tolR protein  25.22 
 
 		 141 aa  50.8  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3239  tolR protein  24.09 
 
 		 148 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0285  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.19 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3630  biopolymer ExbD/TolR family transporter  21.49 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3511  protein TolR  23.2 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114553  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0592  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.26 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.127488 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0840  biopolymer transport protein ExbD/TolR  19.85 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0352738 
 
 
-
 
NC_004310  BR1699  ExbD/TolR family TonB system transport protein  23.39 
 
 		 150 aa  50.8  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1641  protein TolR  23.39 
 
 		 150 aa  50.8  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  23.2 
 
 		 139 aa  50.4  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3136  protein TolR  20.97 
 
 		 146 aa  50.4  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3406  biopolymer transport protein ExbD  23.14 
 
 		 141 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.479649 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2363  protein TolR  20.66 
 
 		 139 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372464 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3341  biopolymer transport protein ExbD  23.14 
 
 		 141 aa  50.1  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.620363 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1049  biopolymer transport ExbD protein  28.23 
 
 		 133 aa  50.1  0.000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2955  putative TolR-like translocation protein  27.93 
 
 		 142 aa  50.4  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163827  normal  0.682621 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2991  biopolymer transport protein ExbD/TolR  22.95 
 
 		 134 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158684  normal  0.0282837 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0673  biopolymer transport protein ExbD  24.11 
 
 		 143 aa  50.4  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.717059  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0592  biopolymer transport protein ExbD  24.11 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0358  biopolymer ExbD/TolR family transporter  23.81 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0309097 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2919  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.69 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0661927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2135  biopolymer transport, TolR  22.69 
 
 		 167 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>