More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1369 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1369  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 
133 aa  260  4e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0400  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  57.14 
 
 
131 aa  140  8e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.376121  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1543  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.24 
 
 
135 aa  100  7e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2066  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.11 
 
 
135 aa  100  9e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3669  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.48 
 
 
127 aa  91.7  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0393  TonB system transport protein ExbD  38.02 
 
 
127 aa  90.9  5e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0498331  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0628  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.27 
 
 
130 aa  88.2  4e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.203844  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3062  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 
127 aa  85.1  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.196503  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0281  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.71 
 
 
139 aa  84.7  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149561  hitchhiker  0.000106063 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1650  TonB system transport protein ExbD  35.54 
 
 
129 aa  84.3  5e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.351181  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1241  TonB system transport protein ExbD  35.54 
 
 
126 aa  84  7e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.977225  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0729  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.75 
 
 
127 aa  80.5  0.000000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120053  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1370  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.92 
 
 
140 aa  79.7  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2363  protein TolR  36.29 
 
 
139 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372464 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1249  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.92 
 
 
125 aa  79  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2667  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.95 
 
 
127 aa  77.4  0.00000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1662  iopolymer transport protein ExbD/TolR  36.51 
 
 
133 aa  77  0.00000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00365164  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1619  protein TolR  37.19 
 
 
153 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.1444  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3630  biopolymer ExbD/TolR family transporter  34.71 
 
 
146 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4149  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.78 
 
 
156 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0266463  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1512  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 
133 aa  74.7  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0467  TonB system transport protein ExbD  31.67 
 
 
129 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2279  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.8 
 
 
138 aa  74.7  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.435564 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0690  biopolymer transport protein  36.72 
 
 
132 aa  74.7  0.0000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0276966  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3381  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.79 
 
 
143 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000113024 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1904  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.71 
 
 
133 aa  74.3  0.0000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.358326  normal  0.205106 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1810  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.78 
 
 
157 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48447  normal  0.302248 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1899  protein TolR  35.54 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.937922 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1617  protein TolR  35.54 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776263  hitchhiker  0.0037279 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1309  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.23 
 
 
135 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1803  biopolymer ExbD/TolR family transporter  32.33 
 
 
142 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.831218  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2064  ExbD/TolR family transport energizing protein  32.33 
 
 
142 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132783  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1930  biopolymer ExbD/TolR family transporter  32.33 
 
 
142 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2145  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.03 
 
 
167 aa  72  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0617  ExbD/TolR family transport energizing protein  32.33 
 
 
142 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.843085  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2158  TonB system transport protein ExbD  34.15 
 
 
131 aa  72.8  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1092  ExbD/TolR family transport energizing protein  32.33 
 
 
142 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0520  ExbD/TolR family transport energizing protein  32.33 
 
 
142 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0800  ExbD/TolR family transport energizing protein  32.33 
 
 
140 aa  72  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0872  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.82 
 
 
141 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.532124  normal  0.142279 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1397  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.21 
 
 
140 aa  71.2  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5006  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.59 
 
 
140 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.108407 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1249  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.38 
 
 
133 aa  71.2  0.000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.368012 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3453  biopolymer ExbD/TolR family transporter  30.33 
 
 
176 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2026  biopolymer ExbD/TolR family transporter  31.58 
 
 
142 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.597145  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0915  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 
140 aa  70.9  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.574244  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1805  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.77 
 
 
137 aa  70.5  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2454  biopolymer ExbD/TolR family transporter  30.33 
 
 
176 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1230  biopolymer ExbD/TolR family transporter  30.33 
 
 
176 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2641  biopolymer ExbD/TolR family transporter  30.33 
 
 
176 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0371  biopolymer ExbD/TolR family transporter  30.33 
 
 
176 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5304  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.43 
 
 
149 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.159444  normal  0.423662 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1715  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.59 
 
 
140 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1466  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.08 
 
 
126 aa  69.3  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0559794  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1015  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32 
 
 
150 aa  69.7  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1435  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32 
 
 
137 aa  69.7  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.559612  normal  0.665441 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0575  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.15 
 
 
143 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523101  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5229  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.21 
 
 
149 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.334933  normal  0.0672636 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1573  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.97 
 
 
139 aa  70.1  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.320463 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6363  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.59 
 
 
140 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0283531  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4762  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.21 
 
 
149 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.718124  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2589  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.48 
 
 
158 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.382062  hitchhiker  0.000000237185 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0527  protein TolR  34.48 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1003  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.61 
 
 
125 aa  69.3  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1730  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.59 
 
 
140 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.245052  normal  0.398781 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6883  putative TolR protein  31.3 
 
 
159 aa  69.3  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.604254  normal  0.0755944 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0856  protein TolR  38.33 
 
 
157 aa  68.6  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2179  hypothetical protein  28.69 
 
 
146 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0277  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.13 
 
 
127 aa  68.6  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0746  protein TolR  36.8 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.87 
 
 
139 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031299  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1730  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.54 
 
 
132 aa  67.4  0.00000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0848  TonB system transport protein ExbD  30.51 
 
 
128 aa  67.4  0.00000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000199461  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2154  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.61 
 
 
155 aa  67.4  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.8914  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5529  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.52 
 
 
140 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0594  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.13 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25500  hypothetical protein  28.69 
 
 
146 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.236019  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0388  biopolymer transport protein  30.43 
 
 
145 aa  67  0.00000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3136  protein TolR  32.79 
 
 
146 aa  66.6  0.00000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0352  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.43 
 
 
145 aa  67  0.00000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2428  biopolymer transport ExbD like protein  30.88 
 
 
148 aa  66.6  0.00000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.303812 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1587  protein TolR  34.48 
 
 
138 aa  66.6  0.00000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.437138  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1396  protein TolR  38.33 
 
 
156 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2225  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.52 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361252  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3166  protein TolR  35.9 
 
 
158 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4176  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.34 
 
 
142 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0268987  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3074  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.71 
 
 
136 aa  66.2  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00262954  normal  0.170197 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0689  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.77 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.828997  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2200  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.52 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2998  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.77 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5877  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.52 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1634  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.21 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0335583  normal  0.448537 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00589  biopolymer transport protein  28.99 
 
 
154 aa  65.9  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.265658  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0506  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.84 
 
 
154 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529067  hitchhiker  0.000695312 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0646  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.15 
 
 
134 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.419547  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0478  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.29 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1442  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.77 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0486  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  34.15 
 
 
134 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.244667  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0374  TonB system transport protein ExbD type-1  34.96 
 
 
141 aa  65.1  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>