More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0277 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0277  biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 		 127 aa  247  5e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0628  biopolymer transport protein ExbD/TolR  54.1 
 
 		 130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.203844  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0283  TonB system transport protein ExbD  42.74 
 
 		 126 aa  97.1  8e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1466  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.58 
 
 		 126 aa  95.1  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0559794  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0848  TonB system transport protein ExbD  40.32 
 
 		 128 aa  94.4  5e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000199461  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0393  TonB system transport protein ExbD  42.19 
 
 		 127 aa  94  7e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0498331  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1241  TonB system transport protein ExbD  38.21 
 
 		 126 aa  93.2  1e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.977225  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2158  TonB system transport protein ExbD  39.67 
 
 		 131 aa  93.2  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1650  TonB system transport protein ExbD  39.84 
 
 		 129 aa  92.4  2e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.351181  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0690  biopolymer transport protein  37.8 
 
 		 132 aa  91.3  4e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0276966  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3062  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.2 
 
 		 127 aa  90.1  9e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.196503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2279  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.13 
 
 		 138 aa  90.1  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.435564 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2667  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.1 
 
 		 127 aa  84.7  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1249  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.51 
 
 		 125 aa  84  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3669  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36 
 
 		 127 aa  84  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0467  TonB system transport protein ExbD  33.59 
 
 		 129 aa  83.6  8e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1988  biopolymer transport exbD protein  43.51 
 
 		 136 aa  80.1  0.000000000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1801  biopolymer transport exbD protein  42.75 
 
 		 136 aa  79.3  0.00000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.221711  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1620  biopolymer transport exbD protein  42.64 
 
 		 136 aa  79  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.916703  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0729  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.48 
 
 		 127 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120053  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1623  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.22 
 
 		 128 aa  78.2  0.00000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122502  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0400  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.58 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.376121  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1587  protein TolR  33.33 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.437138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0879  TonB system transport protein ExbD  37.1 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0717  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.57 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.962323  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0281  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.15 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149561  hitchhiker  0.000106063 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1003  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.51 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3173  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.35 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.673251  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2367  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.33 
 
 		 162 aa  68.9  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1369  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.13 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4538  TolR protein  31.39 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2066  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.77 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04990  TolR-like protein  30.88 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0118688  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51740  TolR protein  31.39 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101841  hitchhiker  0.0000169267 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2237  biopolymer ExbD/TolR family transporter  29.6 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271991  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2629  biopolymer transport TolR  27.2 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3753  biopolymer transport exbD protein  31.67 
 
 		 133 aa  67.4  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.677985  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2363  protein TolR  29.51 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372464 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3498  protein TolR  25.81 
 
 		 151 aa  67  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124794 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3203  protein TolR  25.81 
 
 		 151 aa  67  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.349327  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1699  ExbD/TolR family TonB system transport protein  27.56 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1641  protein TolR  27.56 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3058  biopolymer transport TolR  27.2 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0312035  normal  0.159163 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3619  protein TolR  26.23 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1216  biopolymer transport TolR  27.56 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2135  biopolymer transport, TolR  26.4 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1512  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.6 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0586  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.26 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0531481  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0671  ExbD/TolR family protein  28.35 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045773  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1109  biopolymer transport TolR  29.75 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00176605  normal  0.311844 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2324  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.35 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0663066  normal  0.292388 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1092  ExbD/TolR family transport energizing protein  27.05 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0617  ExbD/TolR family transport energizing protein  27.05 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.843085  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1803  biopolymer ExbD/TolR family transporter  27.05 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.831218  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0520  ExbD/TolR family transport energizing protein  27.05 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1930  biopolymer ExbD/TolR family transporter  27.05 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0800  ExbD/TolR family transport energizing protein  27.05 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2064  ExbD/TolR family transport energizing protein  27.05 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132783  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2026  biopolymer ExbD/TolR family transporter  27.05 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.597145  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1851  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.31 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0560  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.46 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3630  biopolymer ExbD/TolR family transporter  29.17 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0863  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.45 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0638904  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2418  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.68 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0594  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.25 
 
 		 143 aa  63.5  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2118  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.05 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1249  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.57 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.368012 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2088  tolR protein  27.41 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00030908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1525  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.92 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0168753  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1662  iopolymer transport protein ExbD/TolR  26.61 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00365164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.28 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0971  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.67 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1904  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.61 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.358326  normal  0.205106 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0695  protein TolR  27.56 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2154  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.39 
 
 		 155 aa  62  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.8914  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0661  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.56 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602006  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2200  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.21 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2225  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.21 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5877  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.21 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0920  putative polysaccharide deacetylase  32.81 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0743675  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0696  protein TolR  27.56 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.76246  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4061  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.26 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.603451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2239  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.21 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1543  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.15 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3239  tolR protein  28.89 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2237  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.46 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.83 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3520  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.59 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0389  biopolymer transport protein ExbD  33.61 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.627769  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2569  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.54 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2941  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.57 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000159512  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1227  tolR protein  30 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0391  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.61 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3918  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.46 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.833668  normal  0.0813936 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.23 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2733  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.42 
 
 		 153 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1855  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.69 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126112  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2120  biopolymer transport TolR  28.57 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0523748  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4429  protein TolR  26.23 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.681247 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5529  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.05 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>