More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0628 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0628  biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 		 130 aa  254  3e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.203844  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0277  biopolymer transport protein ExbD/TolR  54.1 
 
 		 127 aa  128  2.0000000000000002e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2158  TonB system transport protein ExbD  47.54 
 
 		 131 aa  118  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1241  TonB system transport protein ExbD  44.17 
 
 		 126 aa  103  8e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.977225  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3062  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.8 
 
 		 127 aa  103  8e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.196503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0848  TonB system transport protein ExbD  42.74 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000199461  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2667  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.62 
 
 		 127 aa  101  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0690  biopolymer transport protein  43.9 
 
 		 132 aa  99.4  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0276966  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2279  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.8 
 
 		 138 aa  98.6  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.435564 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0283  TonB system transport protein ExbD  39.5 
 
 		 126 aa  97.8  4e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1249  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.87 
 
 		 125 aa  96.7  9e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0467  TonB system transport protein ExbD  39.83 
 
 		 129 aa  95.9  2e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1623  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.28 
 
 		 128 aa  95.9  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122502  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0393  TonB system transport protein ExbD  43.7 
 
 		 127 aa  93.6  8e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0498331  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3669  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.09 
 
 		 127 aa  93.2  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1466  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.7 
 
 		 126 aa  92.4  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0559794  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0729  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.38 
 
 		 127 aa  92.4  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120053  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1988  biopolymer transport exbD protein  41.38 
 
 		 136 aa  89.7  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1620  biopolymer transport exbD protein  41.38 
 
 		 136 aa  89  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.916703  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1801  biopolymer transport exbD protein  40.52 
 
 		 136 aa  88.6  3e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.221711  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1369  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.27 
 
 		 133 aa  88.2  4e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1650  TonB system transport protein ExbD  36.75 
 
 		 129 aa  87.8  5e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.351181  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0717  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.88 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.962323  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0879  TonB system transport protein ExbD  36.36 
 
 		 127 aa  85.9  2e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2066  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.96 
 
 		 135 aa  82  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2941  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.33 
 
 		 140 aa  79  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000159512  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0400  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.1 
 
 		 131 aa  78.2  0.00000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.376121  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1568  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.96 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.969872  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1525  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.34 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0168753  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1512  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.03 
 
 		 133 aa  74.7  0.0000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0272  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.61 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.512888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1543  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.89 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2733  protein TolR  31.34 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0139663  hitchhiker  0.0000179602 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1605  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.62 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000781876  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1855  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.6 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126112  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2403  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.82 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2088  tolR protein  31.85 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00030908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4538  TolR protein  30.34 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51740  TolR protein  30.34 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101841  hitchhiker  0.0000169267 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2135  biopolymer transport, TolR  29.03 
 
 		 167 aa  72.4  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2192  biopolymer transport TolR  33.33 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0164726  normal  0.458286 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1904  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.86 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.358326  normal  0.205106 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3520  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.54 
 
 		 138 aa  72  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1015  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.27 
 
 		 150 aa  72  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.09 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2991  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.65 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158684  normal  0.0282837 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1783  protein TolR  30.88 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000043737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1662  iopolymer transport protein ExbD/TolR  33.94 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00365164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2566  biopolymer transport TolR  29.85 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000208666  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2370  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.33 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000201992  normal  0.146866 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2531  biopolymer transport protein  33.33 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000400528  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2533  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.33 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432796  normal  0.100758 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1216  biopolymer transport TolR  30.09 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1617  protein TolR  30.08 
 
 		 153 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776263  hitchhiker  0.0037279 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4429  protein TolR  28.1 
 
 		 173 aa  70.5  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.681247 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1899  protein TolR  30.08 
 
 		 153 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.937922 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1396  protein TolR  31.97 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0352  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.15 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2540  protein TolR  30.88 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000662541  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0506  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.5 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529067  hitchhiker  0.000695312 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1744  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.88 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000276409  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2719  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.51 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.746273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1740  biopolymer transport TolR  30.88 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000388711  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0388  biopolymer transport protein  31.15 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.5 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1699  ExbD/TolR family TonB system transport protein  29.2 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3173  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.23 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.673251  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1619  protein TolR  29.27 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.1444  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0646  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.91 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.419547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0486  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  33.91 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.244667  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1641  protein TolR  29.2 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2120  biopolymer transport TolR  30.51 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0523748  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2367  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.97 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0856  protein TolR  31.15 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3058  biopolymer transport TolR  30.08 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0312035  normal  0.159163 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04990  TolR-like protein  30.08 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0118688  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.2 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2221  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.28 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.109447  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2919  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.07 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0661927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.88 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3619  protein TolR  25.83 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1397  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.87 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2418  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.69 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2442  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.83 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000689995  normal  0.227653 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4892  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.03 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.310639 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4061  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.37 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.603451  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2237  biopolymer ExbD/TolR family transporter  31.82 
 
 		 134 aa  67  0.00000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271991  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3389  protein TolR  30.58 
 
 		 145 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436196  normal  0.250194 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1003  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.4 
 
 		 125 aa  67  0.00000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1392  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.36 
 
 		 142 aa  67  0.00000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000255119  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0594  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.71 
 
 		 143 aa  67  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0470  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.65 
 
 		 141 aa  67  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.923665 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4434  protein TolR  29.75 
 
 		 147 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0620039  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3166  protein TolR  26.23 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2154  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.31 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.8914  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0391  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.27 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3514  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.87 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262132  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1460  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.1 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00381179  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1370  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.61 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>