More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2066 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_2066  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 
135 aa  277  5e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1543  biopolymer transport protein ExbD/TolR  48.87 
 
 
135 aa  127  6e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0400  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.54 
 
 
131 aa  108  4.0000000000000004e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.376121  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1369  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.11 
 
 
133 aa  100  9e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0690  biopolymer transport protein  39.17 
 
 
132 aa  90.9  5e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0276966  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2158  TonB system transport protein ExbD  37.19 
 
 
131 aa  83.2  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0628  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.96 
 
 
130 aa  82  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.203844  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1241  TonB system transport protein ExbD  35.9 
 
 
126 aa  81.6  0.000000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.977225  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0393  TonB system transport protein ExbD  35.9 
 
 
127 aa  81.3  0.000000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0498331  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.66 
 
 
144 aa  77.4  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1783  protein TolR  33.33 
 
 
144 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000043737  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1740  biopolymer transport TolR  33.33 
 
 
144 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000388711  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1744  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 
144 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000276409  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0011  biopolymer transport ExbD1 protein  33.33 
 
 
139 aa  75.5  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2540  protein TolR  33.33 
 
 
144 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000662541  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1620  biopolymer transport exbD protein  32.5 
 
 
136 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.916703  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1587  protein TolR  33.07 
 
 
138 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.437138  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1801  biopolymer transport exbD protein  31.67 
 
 
136 aa  73.9  0.0000000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.221711  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0011  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.04 
 
 
136 aa  73.2  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03474  biopolymer transport ExbD1 protein  34.11 
 
 
129 aa  73.6  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0467  TonB system transport protein ExbD  31.62 
 
 
129 aa  72.8  0.000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1988  biopolymer transport exbD protein  31.67 
 
 
136 aa  73.6  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1525  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.85 
 
 
144 aa  72  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0168753  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2154  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.51 
 
 
155 aa  72  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.8914  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2088  tolR protein  32.37 
 
 
145 aa  72  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00030908  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2566  biopolymer transport TolR  34.15 
 
 
145 aa  72  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000208666  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1650  TonB system transport protein ExbD  32.77 
 
 
129 aa  72  0.000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.351181  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0391  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.03 
 
 
159 aa  71.6  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3058  biopolymer transport TolR  37.27 
 
 
152 aa  71.6  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0312035  normal  0.159163 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3753  biopolymer transport exbD protein  30.37 
 
 
133 aa  70.9  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.677985  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0848  TonB system transport protein ExbD  33.33 
 
 
128 aa  70.9  0.000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000199461  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3062  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.08 
 
 
127 aa  70.5  0.000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.196503  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1605  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.71 
 
 
144 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000781876  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2279  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.48 
 
 
138 aa  70.5  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.435564 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0729  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.08 
 
 
127 aa  70.5  0.000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120053  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00634  biopolymer transport protein  31.34 
 
 
135 aa  70.1  0.000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2237  biopolymer ExbD/TolR family transporter  34.43 
 
 
134 aa  69.7  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271991  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2135  biopolymer transport, TolR  34.48 
 
 
167 aa  70.1  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3389  protein TolR  35.45 
 
 
145 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436196  normal  0.250194 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2667  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.08 
 
 
127 aa  70.1  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2580  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.28 
 
 
141 aa  70.1  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.25042  normal  0.920318 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0684  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.75 
 
 
154 aa  70.1  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.508331  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2733  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2733  protein TolR  32.79 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0139663  hitchhiker  0.0000179602 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5304  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.84 
 
 
149 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.159444  normal  0.423662 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.78 
 
 
149 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2367  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.78 
 
 
162 aa  69.3  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2215  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 
154 aa  68.9  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2719  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.86 
 
 
151 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.746273  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0277  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.77 
 
 
127 aa  68.6  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0879  TonB system transport protein ExbD  28.33 
 
 
127 aa  68.6  0.00000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1855  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.79 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126112  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1370  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.15 
 
 
140 aa  68.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.34 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2089  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.82 
 
 
141 aa  67.8  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0440021  normal  0.632014 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0283  TonB system transport protein ExbD  32.82 
 
 
126 aa  68.2  0.00000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2533  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.68 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432796  normal  0.100758 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1460  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.33 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00381179  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4434  protein TolR  34.55 
 
 
147 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0620039  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2370  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.68 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000201992  normal  0.146866 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4762  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.5 
 
 
149 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.718124  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5229  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.5 
 
 
149 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.334933  normal  0.0672636 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2200  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.59 
 
 
140 aa  67  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2225  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.59 
 
 
142 aa  67  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361252  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5877  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.59 
 
 
140 aa  67  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0746  protein TolR  36.94 
 
 
148 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0573  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.19 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.234389  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0620  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.21 
 
 
151 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3381  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.46 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000113024 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0725  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.44 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.154388  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0711  putative biopolymer transport protein  33.93 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0310861 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0219  putative transport-related membrane protein  34.11 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.748949  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03432  Biopolymer transport protein  28.18 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0840  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32 
 
 
137 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0352738 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5529  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.61 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2155  biopolymer transport protein (ExbD2)  30.91 
 
 
136 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0010  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.77 
 
 
141 aa  66.6  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041719 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1063  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.83 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3522  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.46 
 
 
133 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2608  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.85 
 
 
135 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3630  biopolymer ExbD/TolR family transporter  33.33 
 
 
146 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1460  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.52 
 
 
158 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1532  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.39 
 
 
141 aa  65.9  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2955  putative TolR-like translocation protein  32.54 
 
 
142 aa  65.9  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163827  normal  0.682621 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0653  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.21 
 
 
151 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1851  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.15 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0170  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.21 
 
 
151 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0486  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  32.46 
 
 
134 aa  65.1  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.244667  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1531  hypothetical protein  26.15 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1452  hypothetical protein  26.15 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0548  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268527  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0646  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.46 
 
 
134 aa  65.1  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.419547  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0971  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.78 
 
 
137 aa  65.1  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0478  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.77 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3973  biopolymer transport exbD protein  27.52 
 
 
136 aa  64.7  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2589  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.25 
 
 
158 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.382062  hitchhiker  0.000000237185 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2192  biopolymer transport TolR  31.53 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0164726  normal  0.458286 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0863  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.78 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0638904  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2363  protein TolR  32.48 
 
 
139 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372464 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2941  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.95 
 
 
140 aa  64.3  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000159512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>