More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1241 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1241  TonB system transport protein ExbD  100 
 
 		 126 aa  246  1e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.977225  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0393  TonB system transport protein ExbD  78.74 
 
 		 127 aa  198  1.9999999999999998e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0498331  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0848  TonB system transport protein ExbD  60.16 
 
 		 128 aa  149  1e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000199461  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0467  TonB system transport protein ExbD  59.68 
 
 		 129 aa  144  6e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1650  TonB system transport protein ExbD  55.91 
 
 		 129 aa  138  1.9999999999999998e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.351181  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1801  biopolymer transport exbD protein  57.26 
 
 		 136 aa  137  4.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.221711  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1988  biopolymer transport exbD protein  57.26 
 
 		 136 aa  137  4.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1620  biopolymer transport exbD protein  57.26 
 
 		 136 aa  136  8.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.916703  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0283  TonB system transport protein ExbD  47.15 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0879  TonB system transport protein ExbD  47.9 
 
 		 127 aa  114  6e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0628  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.17 
 
 		 130 aa  103  9e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.203844  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2158  TonB system transport protein ExbD  40.5 
 
 		 131 aa  97.1  8e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1003  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.67 
 
 		 125 aa  95.9  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0277  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.21 
 
 		 127 aa  93.2  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3669  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.13 
 
 		 127 aa  91.3  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0717  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.54 
 
 		 126 aa  90.9  6e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.962323  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3062  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.52 
 
 		 127 aa  84.7  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.196503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1369  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.54 
 
 		 133 aa  84  7e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1568  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.29 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.969872  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2279  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.34 
 
 		 138 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.435564 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2066  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.9 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1623  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.77 
 
 		 128 aa  81.6  0.000000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122502  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1466  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.04 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0559794  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1249  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.65 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0729  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.76 
 
 		 127 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120053  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0690  biopolymer transport protein  36.36 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0276966  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2667  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.48 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3406  biopolymer transport protein ExbD  32.54 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.479649 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3412  biopolymer transport protein ExbD  32.54 
 
 		 141 aa  72  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1543  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.29 
 
 		 135 aa  72  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3341  biopolymer transport protein ExbD  32.54 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.620363 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3332  biopolymer transport protein ExbD  32.54 
 
 		 141 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3507  biopolymer transport protein ExbD  32.54 
 
 		 141 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3173  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.1 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.673251  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02879  membrane spanning protein in TonB-ExbB-ExbD complex  32.43 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0693  TonB system transport protein ExbD  32.43 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4316  biopolymer transport protein ExbD  32.43 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3290  biopolymer transport protein ExbD  32.43 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0267  biopolymer transport protein ExbD  31.53 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.134786  normal  0.162508 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3184  biopolymer transport protein ExbD  32.43 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0690  biopolymer transport protein ExbD  32.43 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3433  biopolymer transport protein ExbD  32.43 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3474  biopolymer transport protein ExbD  32.43 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0592  biopolymer transport protein ExbD  31.53 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02829  hypothetical protein  32.43 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0673  biopolymer transport protein ExbD  31.53 
 
 		 143 aa  70.1  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.717059  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0389  biopolymer transport protein ExbD  31.53 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.627769  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0400  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.77 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.376121  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1216  biopolymer transport TolR  28.93 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1699  ExbD/TolR family TonB system transport protein  28.1 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0352  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.47 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0391  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.05 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2135  biopolymer transport, TolR  30.4 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1641  protein TolR  28.1 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0346  biopolymer transport protein ExbD  31.53 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0388  biopolymer transport protein  30.47 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2163  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.36 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0401461  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1397  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.03 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3760  TonB system transport protein ExbD  31.53 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3416  biopolymer transport protein ExbD  32.54 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1015  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.66 
 
 		 150 aa  67  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0272  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.66 
 
 		 149 aa  67  0.00000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.512888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3520  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.88 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0527  protein TolR  26.5 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1308  biopolymer transport exbD protein  28 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.47684  normal  0.431843 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2719  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.27 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.746273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4210  TonB system transport protein ExbD type-1  30.63 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0011  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.27 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00589  biopolymer transport protein  28.93 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.265658  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0857  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.66 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.345374  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0506  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.03 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529067  hitchhiker  0.000695312 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3597  TonB system transport protein ExbD  28.83 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5983  TonB system transport protein ExbD  29.31 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.241351  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1132  TonB system transport protein ExbD  31.09 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0745  protein TolR  29.66 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000786072  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0671  ExbD/TolR family protein  30.25 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045773  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4429  protein TolR  29.09 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.681247 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3136  protein TolR  26.09 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2629  biopolymer transport TolR  25.62 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2324  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.25 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0663066  normal  0.292388 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3619  protein TolR  24.79 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1255  TonB system transport protein ExbD type-1  28.57 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.51439  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1109  biopolymer transport TolR  29.75 
 
 		 134 aa  62  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00176605  normal  0.311844 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  29.66 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5556  biopolymer transport protein ExbD  32.43 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.66 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1433  TonB system transport protein ExbD  29.75 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.584969  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.58 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2221  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.33 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.109447  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1904  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.17 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.358326  normal  0.205106 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0560  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.09 
 
 		 156 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2418  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.6 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1662  iopolymer transport protein ExbD/TolR  30.43 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00365164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3514  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.33 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262132  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0173  biopolymer ExbD/TolR family transporter  31.93 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.311198  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2154  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.05 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.8914  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0922  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.66 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.219154 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3511  protein TolR  28.81 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114553  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0592  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.8 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.127488 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1249  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.97 
 
 		 133 aa  60.8  0.000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.368012 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>