265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0283 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0283  TonB system transport protein ExbD  100 
 
 		 126 aa  247  3e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1620  biopolymer transport exbD protein  53.54 
 
 		 136 aa  132  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.916703  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1988  biopolymer transport exbD protein  52.76 
 
 		 136 aa  131  3e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1801  biopolymer transport exbD protein  52.76 
 
 		 136 aa  130  3.9999999999999996e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.221711  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1241  TonB system transport protein ExbD  47.15 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.977225  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0393  TonB system transport protein ExbD  52.42 
 
 		 127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0498331  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0467  TonB system transport protein ExbD  51.56 
 
 		 129 aa  124  6e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0848  TonB system transport protein ExbD  50.81 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000199461  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1650  TonB system transport protein ExbD  49.6 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.351181  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0879  TonB system transport protein ExbD  50.78 
 
 		 127 aa  112  1.0000000000000001e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0628  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.5 
 
 		 130 aa  97.8  4e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.203844  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1003  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.21 
 
 		 125 aa  97.4  6e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0277  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.74 
 
 		 127 aa  97.1  8e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2158  TonB system transport protein ExbD  36.97 
 
 		 131 aa  88.2  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0717  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.29 
 
 		 126 aa  84.3  5e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.962323  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1568  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.1 
 
 		 127 aa  81.6  0.000000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.969872  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0690  biopolymer transport protein  36.59 
 
 		 132 aa  79.3  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0276966  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1249  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.05 
 
 		 125 aa  79  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1466  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.67 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0559794  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0729  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.36 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120053  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1543  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.5 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2279  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.77 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.435564 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1623  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.17 
 
 		 128 aa  72  0.000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122502  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2667  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.25 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3062  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.25 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.196503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2066  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.82 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3669  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.91 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1369  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.45 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0400  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.21 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.376121  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0267  biopolymer transport protein ExbD  31.36 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.134786  normal  0.162508 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0673  biopolymer transport protein ExbD  31.36 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.717059  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0592  biopolymer transport protein ExbD  31.36 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3520  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.4 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0863  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.18 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0638904  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0594  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.5 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0352  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.58 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0388  biopolymer transport protein  25.58 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0173  biopolymer ExbD/TolR family transporter  31.93 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.311198  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3142  biopolymer transport transmembrane protein, ExbD/TolR like  24.37 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.421775  normal  0.0460891 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3453  biopolymer ExbD/TolR family transporter  22.03 
 
 		 176 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0922  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.12 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.219154 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0272  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.42 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.512888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1190  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.62 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.693897  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1230  biopolymer ExbD/TolR family transporter  22.03 
 
 		 176 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2641  biopolymer ExbD/TolR family transporter  22.03 
 
 		 176 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2454  biopolymer ExbD/TolR family transporter  22.03 
 
 		 176 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0371  biopolymer ExbD/TolR family transporter  22.03 
 
 		 176 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3233  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.42 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1407  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.84 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.757544  normal  0.100791 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3381  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  21.19 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000113024 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2145  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.05 
 
 		 167 aa  50.8  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3406  biopolymer transport protein ExbD  24.79 
 
 		 141 aa  50.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.479649 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2733  biopolymer transport protein ExbD/TolR  22.88 
 
 		 153 aa  50.8  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03474  biopolymer transport ExbD1 protein  31.37 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3332  biopolymer transport protein ExbD  24.79 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3341  biopolymer transport protein ExbD  24.79 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.620363 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0478  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.69 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3507  biopolymer transport protein ExbD  24.79 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1512  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.53 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3412  biopolymer transport protein ExbD  24.79 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3760  TonB system transport protein ExbD  26.79 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1563  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.6 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3597  TonB system transport protein ExbD  27.93 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2719  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.62 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.746273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1908  ExbD/TolR family protein  24.37 
 
 		 141 aa  48.9  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0011  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.27 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2417  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.27 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.978308  normal  0.103563 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0575  biopolymer transport protein ExbD/TolR  21.19 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2589  biopolymer transport protein ExbD/TolR  22.69 
 
 		 158 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.382062  hitchhiker  0.000000237185 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0285  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.41 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1397  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.14 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1699  ExbD/TolR family TonB system transport protein  24.58 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1641  protein TolR  24.58 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.56 
 
 		 148 aa  48.9  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0273  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.83 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2089  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.27 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0440021  normal  0.632014 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2806  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.37 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.0047121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2212  biopolymer transport TolR  25.83 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000948089  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00589  biopolymer transport protein  23.2 
 
 		 154 aa  47.8  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.265658  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0391  biopolymer transport protein ExbD/TolR  20.83 
 
 		 159 aa  47.8  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0527  protein TolR  23.81 
 
 		 155 aa  47.4  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0646  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  22.66 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.419547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0486  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  22.66 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.244667  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02686  Biopolymer transport protein  23.2 
 
 		 139 aa  47.4  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00153637  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1855  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.4 
 
 		 144 aa  47  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126112  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1049  biopolymer transport ExbD protein  28.21 
 
 		 133 aa  47  0.00009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1249  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.37 
 
 		 133 aa  47  0.00009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.368012 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3173  biopolymer transport protein ExbD/TolR  22.03 
 
 		 149 aa  47  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.673251  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0693  TonB system transport protein ExbD  24.79 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3290  biopolymer transport protein ExbD  24.79 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1783  protein TolR  25 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000043737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0313  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.48 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1015  biopolymer transport protein ExbD/TolR  20.66 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2060  GTP cyclohydrolase I  25.38 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.552907 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3619  protein TolR  22.88 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2991  biopolymer transport protein ExbD/TolR  22.31 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158684  normal  0.0282837 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3474  biopolymer transport protein ExbD  24.79 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0011  biopolymer transport ExbD1 protein  28.07 
 
 		 139 aa  46.2  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3433  biopolymer transport protein ExbD  24.79 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4316  biopolymer transport protein ExbD  24.79 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>