More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1249 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1249  biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 		 125 aa  246  7e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1466  biopolymer transport protein ExbD/TolR  64 
 
 		 126 aa  165  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0559794  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3669  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  60.98 
 
 		 127 aa  144  5e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3062  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.72 
 
 		 127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.196503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2667  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.34 
 
 		 127 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0729  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.72 
 
 		 127 aa  107  7.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120053  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2279  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.34 
 
 		 138 aa  103  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.435564 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0628  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.87 
 
 		 130 aa  96.7  8e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.203844  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0467  TonB system transport protein ExbD  35.29 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1543  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.5 
 
 		 135 aa  84.3  5e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0393  TonB system transport protein ExbD  37.93 
 
 		 127 aa  84  6e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0498331  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0277  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.51 
 
 		 127 aa  84  7e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1568  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.52 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.969872  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2158  TonB system transport protein ExbD  42.61 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1241  TonB system transport protein ExbD  35.65 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.977225  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1369  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.92 
 
 		 133 aa  79  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0848  TonB system transport protein ExbD  40.54 
 
 		 128 aa  78.6  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000199461  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0283  TonB system transport protein ExbD  33.05 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1650  TonB system transport protein ExbD  36.97 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.351181  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0690  biopolymer transport protein  34.13 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0276966  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0717  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.75 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.962323  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1003  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.48 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1620  biopolymer transport exbD protein  31.09 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.916703  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1801  biopolymer transport exbD protein  31.09 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.221711  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1988  biopolymer transport exbD protein  31.09 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0879  TonB system transport protein ExbD  30.58 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0400  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.5 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.376121  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0856  protein TolR  35.77 
 
 		 157 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4055  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.2 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1396  protein TolR  34.15 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1623  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.95 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122502  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1617  protein TolR  34.68 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776263  hitchhiker  0.0037279 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1899  protein TolR  34.68 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.937922 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1049  biopolymer transport ExbD protein  32.06 
 
 		 133 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1619  protein TolR  33.87 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.1444  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1916  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.04 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0105  TonB system transport protein ExbD, putative  34.65 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.664696  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0145  TonB system transport protein ExbD, putative  34.65 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000057869  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2269  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  33.04 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.309606  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2066  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.2 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0117  TonB system transport protein ExbD, putative  34.65 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000384782  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3166  protein TolR  32.77 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2817  biopolymer transport protein (ExbD2)  29.27 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276974  hitchhiker  0.00000182227 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0725  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.91 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.154388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2154  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.84 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.8914  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1742  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.26 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0872  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.2 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.532124  normal  0.142279 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1190  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.71 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.693897  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2237  biopolymer ExbD/TolR family transporter  33.33 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271991  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2733  protein TolR  29.77 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0139663  hitchhiker  0.0000179602 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1522  ExbDTolR family transport protein  31.4 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0198  TonB system transport protein ExbD  33.33 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00125254  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2533  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.92 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432796  normal  0.100758 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.15 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.58 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2370  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.92 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000201992  normal  0.146866 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1855  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.77 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126112  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3580  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.96 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0470  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.4 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.923665 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1730  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.97 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02686  Biopolymer transport protein  28.46 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00153637  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0646  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.8 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.419547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0486  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  32.8 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.244667  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0197  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.48 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.058797  normal  0.711097 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0173  biopolymer ExbD/TolR family transporter  25.98 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.311198  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3630  biopolymer ExbD/TolR family transporter  34.15 
 
 		 146 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2955  putative TolR-like translocation protein  33.07 
 
 		 142 aa  57  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163827  normal  0.682621 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1783  protein TolR  30 
 
 		 144 aa  57  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000043737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1744  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30 
 
 		 144 aa  57  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000276409  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1740  biopolymer transport TolR  30 
 
 		 144 aa  57  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000388711  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2540  protein TolR  30 
 
 		 144 aa  57  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000662541  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2589  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.77 
 
 		 158 aa  57  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.382062  hitchhiker  0.000000237185 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3004  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  31.93 
 
 		 132 aa  57  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2614  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.93 
 
 		 132 aa  57  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2390  biopolymer transport protein  33.64 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.817875  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1460  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.72 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00381179  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2941  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.46 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000159512  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  32.52 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2225  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.52 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361252  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1531  hypothetical protein  27.01 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1452  hypothetical protein  27.01 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2569  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.11 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0273  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.26 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1015  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.25 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2991  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.81 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158684  normal  0.0282837 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2200  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.52 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2155  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.02 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5877  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.52 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2363  protein TolR  32.06 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372464 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0784  protein TolR  29.01 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0363173  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0527  protein TolR  29.92 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2120  biopolymer transport TolR  34.4 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0523748  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3216  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.4 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.300081  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0920  putative polysaccharide deacetylase  29.92 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0743675  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0594  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.84 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1525  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.48 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0168753  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2088  tolR protein  28.79 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00030908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2442  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.92 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000689995  normal  0.227653 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2239  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.71 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3753  biopolymer transport exbD protein  26.83 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.677985  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>