More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0393 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0393  TonB system transport protein ExbD  100 
 
 		 127 aa  244  4e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0498331  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1241  TonB system transport protein ExbD  78.74 
 
 		 126 aa  198  1.9999999999999998e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.977225  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0467  TonB system transport protein ExbD  61.29 
 
 		 129 aa  154  6e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1650  TonB system transport protein ExbD  57.48 
 
 		 129 aa  148  2e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.351181  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1801  biopolymer transport exbD protein  58.87 
 
 		 136 aa  144  4.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.221711  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1988  biopolymer transport exbD protein  58.87 
 
 		 136 aa  143  6e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1620  biopolymer transport exbD protein  58.87 
 
 		 136 aa  143  9e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.916703  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0848  TonB system transport protein ExbD  58.87 
 
 		 128 aa  139  9.999999999999999e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000199461  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0283  TonB system transport protein ExbD  52.42 
 
 		 126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0879  TonB system transport protein ExbD  48.31 
 
 		 127 aa  115  3e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1003  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.98 
 
 		 125 aa  97.4  6e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0277  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.19 
 
 		 127 aa  94  7e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0628  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.7 
 
 		 130 aa  93.6  8e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.203844  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0717  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.7 
 
 		 126 aa  92  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.962323  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1369  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.02 
 
 		 133 aa  90.9  5e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3062  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.29 
 
 		 127 aa  90.9  6e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.196503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2158  TonB system transport protein ExbD  38.71 
 
 		 131 aa  90.5  7e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0690  biopolymer transport protein  41.6 
 
 		 132 aa  90.1  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0276966  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3669  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.14 
 
 		 127 aa  88.6  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1568  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.71 
 
 		 127 aa  87  9e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.969872  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1543  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.34 
 
 		 135 aa  84.3  5e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1249  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.93 
 
 		 125 aa  84  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1466  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.19 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0559794  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2066  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.9 
 
 		 135 aa  81.3  0.000000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0729  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.48 
 
 		 127 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120053  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2279  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.21 
 
 		 138 aa  80.9  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.435564 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1623  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 		 128 aa  80.1  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122502  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0400  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.5 
 
 		 131 aa  78.2  0.00000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.376121  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2667  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.54 
 
 		 127 aa  78.6  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3406  biopolymer transport protein ExbD  33.07 
 
 		 141 aa  72  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.479649 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3341  biopolymer transport protein ExbD  33.07 
 
 		 141 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.620363 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3412  biopolymer transport protein ExbD  33.07 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3332  biopolymer transport protein ExbD  33.07 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3507  biopolymer transport protein ExbD  33.07 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02879  membrane spanning protein in TonB-ExbB-ExbD complex  33.04 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0693  TonB system transport protein ExbD  33.04 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3474  biopolymer transport protein ExbD  33.04 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0690  biopolymer transport protein ExbD  33.04 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4316  biopolymer transport protein ExbD  33.04 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3290  biopolymer transport protein ExbD  33.04 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3433  biopolymer transport protein ExbD  33.04 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02829  hypothetical protein  33.04 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3184  biopolymer transport protein ExbD  33.04 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3630  biopolymer ExbD/TolR family transporter  31.62 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0506  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529067  hitchhiker  0.000695312 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0527  protein TolR  32.23 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.61 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3511  protein TolR  34.71 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114553  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  33.88 
 
 		 139 aa  67  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1587  protein TolR  32.73 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.437138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1397  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.55 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0592  biopolymer transport protein ExbD  31.25 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02686  Biopolymer transport protein  35.71 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00153637  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0267  biopolymer transport protein ExbD  31.25 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.134786  normal  0.162508 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0673  biopolymer transport protein ExbD  31.25 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.717059  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  32.77 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2955  putative TolR-like translocation protein  33.61 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163827  normal  0.682621 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3416  biopolymer transport protein ExbD  30.71 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1851  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.51 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4210  TonB system transport protein ExbD type-1  29.92 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0586  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.47 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0531481  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3760  TonB system transport protein ExbD  31.25 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0391  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.02 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0346  biopolymer transport protein ExbD  31.25 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0389  biopolymer transport protein ExbD  31.25 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.627769  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3520  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.06 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0281  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.77 
 
 		 139 aa  62  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149561  hitchhiker  0.000106063 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3136  protein TolR  27.94 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3597  TonB system transport protein ExbD  28.57 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2324  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.41 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0663066  normal  0.292388 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1109  biopolymer transport TolR  27.73 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00176605  normal  0.311844 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0671  ExbD/TolR family protein  29.41 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045773  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1908  ExbD/TolR family protein  30.25 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0745  protein TolR  32.06 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000786072  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0011  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.18 
 
 		 136 aa  62  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1216  biopolymer transport TolR  30.08 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1699  ExbD/TolR family TonB system transport protein  29.27 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1641  protein TolR  29.27 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2390  biopolymer transport protein  30.4 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.817875  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.05 
 
 		 166 aa  60.8  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2941  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000159512  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2733  protein TolR  31.2 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0139663  hitchhiker  0.0000179602 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1015  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.73 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0840  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.93 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0352738 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3173  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.59 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.673251  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.06 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2629  biopolymer transport TolR  26.23 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1308  biopolymer transport exbD protein  28.57 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.47684  normal  0.431843 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0560  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.25 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0478  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.5 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2719  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.1 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.746273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2221  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.93 
 
 		 134 aa  60.1  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.109447  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1855  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.8 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126112  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0388  biopolymer transport protein  27.82 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5983  TonB system transport protein ExbD  29.17 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.241351  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3619  protein TolR  23.77 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0352  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.82 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0684  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.05 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.508331  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0704  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.68 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.486388 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2039  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.68 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.827879  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>