More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_0145 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0105  TonB system transport protein ExbD, putative  100 
 
 
129 aa  258  2e-68  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.664696  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0145  TonB system transport protein ExbD, putative  100 
 
 
129 aa  258  2e-68  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000057869  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0117  TonB system transport protein ExbD, putative  99.22 
 
 
129 aa  257  3e-68  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000384782  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0198  TonB system transport protein ExbD  77.17 
 
 
128 aa  204  4e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00125254  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1741  ExbDTolR family transport protein  55.47 
 
 
132 aa  150  5e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.490579  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0920  putative polysaccharide deacetylase  56.25 
 
 
132 aa  149  1e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0743675  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0690  ExbDTolR family transport protein  56.35 
 
 
132 aa  137  4.999999999999999e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00894494  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1522  ExbDTolR family transport protein  52.42 
 
 
130 aa  135  2e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1400  biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.61 
 
 
130 aa  114  5e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.377979  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0518  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.77 
 
 
130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.17 
 
 
147 aa  85.5  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0745  protein TolR  38.02 
 
 
140 aa  84.7  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000786072  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0748  protein TolR  35.48 
 
 
155 aa  84  6e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.031429  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0389  biopolymer transport protein ExbD  38.21 
 
 
141 aa  82.8  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.627769  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3597  TonB system transport protein ExbD  34.96 
 
 
139 aa  82  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0346  biopolymer transport protein ExbD  38.21 
 
 
141 aa  82.4  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.16 
 
 
137 aa  81.6  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.4 
 
 
144 aa  80.9  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2163  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.48 
 
 
131 aa  80.9  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0401461  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.07 
 
 
149 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1049  biopolymer transport ExbD protein  35.25 
 
 
133 aa  79  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2733  protein TolR  34.65 
 
 
145 aa  79  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0139663  hitchhiker  0.0000179602 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0135  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.13 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2370  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.8 
 
 
144 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000201992  normal  0.146866 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2533  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.8 
 
 
144 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432796  normal  0.100758 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2566  biopolymer transport TolR  34.65 
 
 
145 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000208666  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0612  ExbD/TolR family protein  35.54 
 
 
143 aa  77.8  0.00000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3058  biopolymer transport TolR  36.29 
 
 
152 aa  77.8  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0312035  normal  0.159163 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  34.71 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0746  protein TolR  37.9 
 
 
148 aa  77.4  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.4 
 
 
166 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4210  TonB system transport protein ExbD type-1  34.68 
 
 
142 aa  77.4  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1525  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.86 
 
 
144 aa  77  0.00000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0168753  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0478  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.4 
 
 
146 aa  77.4  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1147  TonB system transport protein ExbD type-1  36.59 
 
 
141 aa  77  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103894  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1908  ExbD/TolR family protein  34.15 
 
 
141 aa  77  0.00000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2120  biopolymer transport TolR  36.22 
 
 
152 aa  77  0.00000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0523748  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1855  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.86 
 
 
144 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126112  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1114  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.2 
 
 
141 aa  76.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.809728  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5304  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.02 
 
 
149 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.159444  normal  0.423662 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5556  biopolymer transport protein ExbD  34.71 
 
 
142 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3760  TonB system transport protein ExbD  33.88 
 
 
139 aa  76.6  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4762  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.02 
 
 
149 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.718124  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5229  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.02 
 
 
149 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.334933  normal  0.0672636 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3520  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 
138 aa  76.6  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2442  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.4 
 
 
144 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000689995  normal  0.227653 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1783  protein TolR  33.6 
 
 
144 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000043737  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1740  biopolymer transport TolR  33.6 
 
 
144 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000388711  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0173  biopolymer ExbD/TolR family transporter  34.65 
 
 
136 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.311198  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2540  protein TolR  33.6 
 
 
144 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000662541  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0711  putative biopolymer transport protein  32.28 
 
 
140 aa  75.9  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0310861 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.06 
 
 
139 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031299  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1744  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.6 
 
 
144 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000276409  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0857  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.88 
 
 
139 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.345374  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1605  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.66 
 
 
144 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000781876  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0166  biopolymer transport protein ExbD  32.23 
 
 
142 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0981914 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1216  biopolymer transport TolR  35.83 
 
 
150 aa  75.1  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3416  biopolymer transport protein ExbD  36.22 
 
 
141 aa  75.1  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2088  tolR protein  32.28 
 
 
145 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00030908  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3511  protein TolR  33.06 
 
 
139 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114553  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2750  tolr protein  35.2 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2154  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.57 
 
 
155 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.8914  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1396  protein TolR  37.19 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1641  protein TolR  35 
 
 
150 aa  73.9  0.0000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1699  ExbD/TolR family TonB system transport protein  35 
 
 
150 aa  73.9  0.0000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2418  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.87 
 
 
144 aa  73.9  0.0000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5307  biopolymer transport protein ExbD  32.26 
 
 
142 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.153689 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5216  biopolymer transport protein ExbD  32.26 
 
 
142 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2719  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.07 
 
 
151 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.746273  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4429  protein TolR  33.87 
 
 
173 aa  73.6  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.681247 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3142  biopolymer transport transmembrane protein, ExbD/TolR like  33.61 
 
 
139 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.421775  normal  0.0460891 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0068  TonB system transport protein ExbD  34.43 
 
 
141 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3389  protein TolR  37.1 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436196  normal  0.250194 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0204  biopolymer transport protein ExbD  34.43 
 
 
141 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5355  biopolymer transport protein ExbD  31.4 
 
 
142 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610359  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2135  biopolymer transport, TolR  34.15 
 
 
167 aa  73.2  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3514  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.43 
 
 
151 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262132  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0330  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.52 
 
 
173 aa  73.2  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175992  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  31.71 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1460  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.28 
 
 
142 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00381179  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0856  protein TolR  36.36 
 
 
157 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0592  biopolymer transport protein ExbD  33.88 
 
 
143 aa  72  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0673  biopolymer transport protein ExbD  33.88 
 
 
143 aa  72  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.717059  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1213  protein TolR  34.75 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3580  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.52 
 
 
144 aa  72  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0374  TonB system transport protein ExbD type-1  33.06 
 
 
141 aa  72  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0391  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.71 
 
 
159 aa  71.6  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1392  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 
142 aa  72  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000255119  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0267  biopolymer transport protein ExbD  33.88 
 
 
143 aa  72  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.134786  normal  0.162508 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1805  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.4 
 
 
137 aa  71.2  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2212  biopolymer transport TolR  32.79 
 
 
140 aa  71.2  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000948089  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2237  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.72 
 
 
137 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3173  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 
149 aa  70.9  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.673251  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3239  tolR protein  31.34 
 
 
148 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4541  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.36 
 
 
142 aa  70.1  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0863  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.6 
 
 
138 aa  69.3  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0638904  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0661  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.58 
 
 
150 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602006  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4003  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.71 
 
 
145 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3619  protein TolR  32.5 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2279  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.64 
 
 
137 aa  69.7  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.079959  normal  0.0276297 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>