More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2402 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007947  Mfla_2402  biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 		 134 aa  271  2.0000000000000002e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.705571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2221  biopolymer transport protein ExbD/TolR  53.49 
 
 		 134 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.109447  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2237  biopolymer ExbD/TolR family transporter  49.24 
 
 		 134 aa  136  7.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271991  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2991  biopolymer transport protein ExbD/TolR  48.84 
 
 		 134 aa  133  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158684  normal  0.0282837 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2919  biopolymer transport protein ExbD/TolR  50.39 
 
 		 134 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0661927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2569  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.21 
 
 		 134 aa  130  5e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0358  biopolymer ExbD/TolR family transporter  47.69 
 
 		 135 aa  129  9e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0309097 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1088  biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.15 
 
 		 136 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00516772  normal  0.155031 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2106  biopolymer transport protein ExbD/TolR  49.62 
 
 		 135 aa  121  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2608  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.97 
 
 		 135 aa  113  8.999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2403  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.64 
 
 		 135 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1460  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.19 
 
 		 135 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2499  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.31 
 
 		 141 aa  100  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4816  transport protein ExbD  43.8 
 
 		 139 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55340  transport protein ExbD  43.8 
 
 		 139 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00981285 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2198  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.18 
 
 		 137 aa  85.9  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  31.45 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.45 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0150  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.71 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000194485  hitchhiker  0.00605756 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3511  protein TolR  29.84 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114553  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3062  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.3 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.196503  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  29.84 
 
 		 139 aa  67  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0690  biopolymer transport protein  30.95 
 
 		 132 aa  67  0.00000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0276966  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2192  biopolymer transport TolR  30.16 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0164726  normal  0.458286 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0470  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.91 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.923665 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0205  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.04 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000105504  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1805  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.67 
 
 		 137 aa  63.5  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3233  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.2 
 
 		 142 aa  63.5  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1440  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.69 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4624  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.5 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000994253 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1213  protein TolR  26.83 
 
 		 147 aa  62  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1851  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.47 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2408  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.69 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.692692  normal  0.803966 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2570  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.12 
 
 		 136 aa  62  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00988954  hitchhiker  0.000963498 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3074  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.13 
 
 		 136 aa  62  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00262954  normal  0.170197 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3053  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.34 
 
 		 136 aa  62  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2200  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.19 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0805  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251807 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5877  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.19 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2225  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.19 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2118  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.19 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5529  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.19 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2239  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.4 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1619  protein TolR  28.12 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.1444  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0506  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.69 
 
 		 154 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529067  hitchhiker  0.000695312 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1531  hypothetical protein  29.63 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1452  hypothetical protein  29.63 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1899  protein TolR  27.34 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.937922 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1617  protein TolR  27.34 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776263  hitchhiker  0.0037279 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0371  biopolymer ExbD/TolR family transporter  29.69 
 
 		 176 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2454  biopolymer ExbD/TolR family transporter  29.69 
 
 		 176 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3203  protein TolR  30.33 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.349327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2641  biopolymer ExbD/TolR family transporter  29.69 
 
 		 176 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1230  biopolymer ExbD/TolR family transporter  29.69 
 
 		 176 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3498  protein TolR  30.33 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124794 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3313  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.69 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.93238  normal  0.758523 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2667  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.36 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2089  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.56 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0440021  normal  0.632014 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2941  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000159512  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02686  Biopolymer transport protein  28.99 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00153637  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1803  biopolymer ExbD/TolR family transporter  25.6 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.831218  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0711  putative biopolymer transport protein  25.64 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0310861 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1930  biopolymer ExbD/TolR family transporter  25.6 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0800  ExbD/TolR family transport energizing protein  25.6 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2064  ExbD/TolR family transport energizing protein  25.6 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132783  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0617  ExbD/TolR family transport energizing protein  25.6 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.843085  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2066  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.39 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.45 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2589  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.2 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.382062  hitchhiker  0.000000237185 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1512  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.56 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1076  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.05 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1092  ExbD/TolR family transport energizing protein  25.6 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0520  ExbD/TolR family transport energizing protein  25.6 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3453  biopolymer ExbD/TolR family transporter  28.91 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2212  biopolymer transport TolR  29.17 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000948089  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3520  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.62 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1460  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.93 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0878  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.64 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0295235  normal  0.0766117 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1022  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.64 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0335138  normal  0.0307792 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1396  protein TolR  28.8 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2026  biopolymer ExbD/TolR family transporter  24.8 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.597145  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4693  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.17 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1370  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.8 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3121  protein TolR  27.64 
 
 		 142 aa  57  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0011  biopolymer transport ExbD1 protein  27.78 
 
 		 139 aa  57  0.00000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003915  Tol biopolymer transport system TolR protein  28.68 
 
 		 147 aa  57  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0762164  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.97 
 
 		 144 aa  57  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3325  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.9 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.110206  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1937  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.36 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.218457 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1114  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.6 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.809728  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0065  TolR protein  30.33 
 
 		 136 aa  57  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0122118  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0689  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.4 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.828997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0066  protein TolR  30.33 
 
 		 136 aa  57  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.659052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1238  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.9 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0696  protein TolR  27.05 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.76246  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0661  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.05 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602006  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1532  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.19 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1460  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.61 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0695  protein TolR  27.05 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0856  protein TolR  28.8 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>