More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1088 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1088  biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 		 136 aa  269  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00516772  normal  0.155031 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2106  biopolymer transport protein ExbD/TolR  83.46 
 
 		 135 aa  201  4e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2569  biopolymer transport protein ExbD/TolR  68.7 
 
 		 134 aa  191  3e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2221  biopolymer transport protein ExbD/TolR  72.87 
 
 		 134 aa  189  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.109447  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2919  biopolymer transport protein ExbD/TolR  70.54 
 
 		 134 aa  186  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0661927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2991  biopolymer transport protein ExbD/TolR  66.67 
 
 		 134 aa  185  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158684  normal  0.0282837 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2237  biopolymer ExbD/TolR family transporter  64.89 
 
 		 134 aa  183  6e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271991  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0358  biopolymer ExbD/TolR family transporter  68.75 
 
 		 135 aa  183  6e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0309097 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2499  biopolymer transport protein ExbD/TolR  64.12 
 
 		 141 aa  167  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2403  biopolymer transport protein ExbD/TolR  57.25 
 
 		 135 aa  166  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4816  transport protein ExbD  67.77 
 
 		 139 aa  165  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55340  transport protein ExbD  67.77 
 
 		 139 aa  165  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00981285 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2198  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  66.94 
 
 		 137 aa  155  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2608  biopolymer transport protein ExbD/TolR  52.76 
 
 		 135 aa  149  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1460  biopolymer transport protein ExbD/TolR  55.83 
 
 		 135 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2402  biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.15 
 
 		 134 aa  142  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.705571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2026  biopolymer ExbD/TolR family transporter  36.8 
 
 		 142 aa  90.9  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.597145  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2064  ExbD/TolR family transport energizing protein  36 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132783  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1803  biopolymer ExbD/TolR family transporter  36 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.831218  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1930  biopolymer ExbD/TolR family transporter  36 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0520  ExbD/TolR family transport energizing protein  36 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1092  ExbD/TolR family transport energizing protein  36 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0617  ExbD/TolR family transport energizing protein  36 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.843085  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0800  ExbD/TolR family transport energizing protein  36 
 
 		 140 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3074  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.8 
 
 		 136 aa  88.6  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00262954  normal  0.170197 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2408  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.38 
 
 		 136 aa  86.3  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.692692  normal  0.803966 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.51 
 
 		 137 aa  86.3  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1440  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.43 
 
 		 136 aa  85.5  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3053  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.65 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1114  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.809728  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.59 
 
 		 166 aa  82  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1213  protein TolR  32.03 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2200  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.09 
 
 		 140 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2225  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.09 
 
 		 142 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5877  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.09 
 
 		 140 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02686  Biopolymer transport protein  34.81 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00153637  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5529  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.09 
 
 		 140 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2570  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.07 
 
 		 136 aa  80.1  0.000000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00988954  hitchhiker  0.000963498 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3313  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.43 
 
 		 135 aa  80.1  0.000000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.93238  normal  0.758523 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4624  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 		 137 aa  79  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000994253 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3520  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.06 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1512  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.8 
 
 		 133 aa  78.6  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1076  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.05 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0997  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.13 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975721 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1805  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.5 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2239  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.58 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0757  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.59 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0863  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.75 
 
 		 138 aa  76.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0638904  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3062  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.65 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.196503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2118  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.58 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4606  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.89 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2477  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.45 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0883915  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4694  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.58 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3511  protein TolR  31.45 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114553  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1531  hypothetical protein  34.81 
 
 		 151 aa  74.7  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1452  hypothetical protein  34.81 
 
 		 151 aa  74.7  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0225  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.71 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.798627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2589  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.27 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.382062  hitchhiker  0.000000237185 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  31.45 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2454  biopolymer ExbD/TolR family transporter  29.37 
 
 		 176 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2733  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.36 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2641  biopolymer ExbD/TolR family transporter  29.37 
 
 		 176 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1230  biopolymer ExbD/TolR family transporter  29.37 
 
 		 176 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0371  biopolymer ExbD/TolR family transporter  29.37 
 
 		 176 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3136  protein TolR  33.87 
 
 		 146 aa  73.9  0.0000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0470  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.93 
 
 		 141 aa  73.9  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.923665 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0612  ExbD/TolR family protein  32.26 
 
 		 143 aa  73.9  0.0000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3453  biopolymer ExbD/TolR family transporter  29.37 
 
 		 176 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2733  protein TolR  33.58 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0139663  hitchhiker  0.0000179602 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0689  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.82 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.828997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1052  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.34 
 
 		 156 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2120  biopolymer transport TolR  33.61 
 
 		 152 aa  72.8  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0523748  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0690  biopolymer transport protein  33.59 
 
 		 132 aa  73.6  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0276966  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3787  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.88 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0620  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.91 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4551  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.71 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.22 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1619  protein TolR  31.5 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.1444  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1855  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.58 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126112  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0840  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.82 
 
 		 137 aa  72  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0352738 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2667  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.65 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2941  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.06 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000159512  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1662  iopolymer transport protein ExbD/TolR  29.6 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00365164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3381  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.27 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000113024 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3619  protein TolR  30.58 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1587  protein TolR  35.48 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.437138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4210  TonB system transport protein ExbD type-1  33.83 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0346  biopolymer transport protein ExbD  37.9 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0653  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.13 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0575  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.27 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0170  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.13 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1740  biopolymer transport TolR  30.83 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000388711  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0695  protein TolR  32.28 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2540  protein TolR  30.83 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000662541  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.65 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0661  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.28 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602006  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1783  protein TolR  30.83 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000043737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1744  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.83 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000276409  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0696  protein TolR  32.28 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.76246  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3203  protein TolR  30.89 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.349327  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>