More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4816 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4816  transport protein ExbD  100 
 
 
139 aa  275  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55340  transport protein ExbD  100 
 
 
139 aa  275  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00981285 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2499  biopolymer transport protein ExbD/TolR  90.65 
 
 
141 aa  231  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1088  biopolymer transport protein ExbD/TolR  66.93 
 
 
136 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00516772  normal  0.155031 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2198  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  72.5 
 
 
137 aa  160  6e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2106  biopolymer transport protein ExbD/TolR  66.93 
 
 
135 aa  158  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2237  biopolymer ExbD/TolR family transporter  57.81 
 
 
134 aa  154  3e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271991  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0358  biopolymer ExbD/TolR family transporter  57.58 
 
 
135 aa  150  7e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0309097 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2569  biopolymer transport protein ExbD/TolR  54.33 
 
 
134 aa  147  3e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2991  biopolymer transport protein ExbD/TolR  55.73 
 
 
134 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158684  normal  0.0282837 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2221  biopolymer transport protein ExbD/TolR  58.59 
 
 
134 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.109447  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2919  biopolymer transport protein ExbD/TolR  57.48 
 
 
134 aa  140  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0661927  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2608  biopolymer transport protein ExbD/TolR  50.39 
 
 
135 aa  135  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1460  biopolymer transport protein ExbD/TolR  53.91 
 
 
135 aa  134  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2403  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.67 
 
 
135 aa  123  9e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2402  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.31 
 
 
134 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.705571  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1803  biopolymer ExbD/TolR family transporter  37.04 
 
 
142 aa  94.4  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.831218  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2064  ExbD/TolR family transport energizing protein  37.04 
 
 
142 aa  94.4  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132783  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1930  biopolymer ExbD/TolR family transporter  37.04 
 
 
142 aa  94.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0617  ExbD/TolR family transport energizing protein  37.04 
 
 
142 aa  94.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.843085  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1092  ExbD/TolR family transport energizing protein  37.04 
 
 
142 aa  94.4  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0520  ExbD/TolR family transport energizing protein  36.3 
 
 
142 aa  92.8  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0800  ExbD/TolR family transport energizing protein  37.01 
 
 
140 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2026  biopolymer ExbD/TolR family transporter  35.56 
 
 
142 aa  89  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.597145  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1119  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.5 
 
 
144 aa  85.9  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.58 
 
 
137 aa  84  7e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1512  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.54 
 
 
133 aa  83.6  9e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3074  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.71 
 
 
136 aa  82.8  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00262954  normal  0.170197 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1619  protein TolR  35.04 
 
 
153 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.1444  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3511  protein TolR  30.08 
 
 
139 aa  82  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114553  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5529  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.35 
 
 
140 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4694  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.09 
 
 
141 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2225  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 
142 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361252  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  30.08 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1440  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 
136 aa  81.3  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2408  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 
136 aa  81.3  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.692692  normal  0.803966 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.54 
 
 
139 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031299  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3053  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.54 
 
 
136 aa  80.9  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2200  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.86 
 
 
140 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5877  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.86 
 
 
140 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0689  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.34 
 
 
140 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.828997  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1442  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.83 
 
 
140 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2118  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.09 
 
 
142 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  31.54 
 
 
139 aa  79  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2239  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.07 
 
 
140 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1662  iopolymer transport protein ExbD/TolR  32.54 
 
 
133 aa  79.3  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00365164  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0997  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.09 
 
 
141 aa  79.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.975721 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1213  protein TolR  33.33 
 
 
147 aa  79  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2570  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 
136 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00988954  hitchhiker  0.000963498 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2998  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.83 
 
 
140 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0225  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.27 
 
 
136 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.798627  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3313  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.92 
 
 
135 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.93238  normal  0.758523 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1617  protein TolR  32.12 
 
 
153 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776263  hitchhiker  0.0037279 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1899  protein TolR  32.12 
 
 
153 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.937922 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7324  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.83 
 
 
140 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.880013 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.19 
 
 
166 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2733  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 
153 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0863  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.6 
 
 
138 aa  77.4  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0638904  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1805  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.95 
 
 
137 aa  77  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0813  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.2 
 
 
136 aa  76.3  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0527  protein TolR  33.33 
 
 
155 aa  75.9  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3136  protein TolR  36.03 
 
 
146 aa  75.5  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0757  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0620  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.19 
 
 
151 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1904  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.95 
 
 
133 aa  75.5  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.358326  normal  0.205106 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3619  protein TolR  34.17 
 
 
152 aa  75.9  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1114  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 
141 aa  75.1  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.809728  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0470  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.23 
 
 
141 aa  75.1  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.923665 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0653  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.19 
 
 
151 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0170  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.19 
 
 
151 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0672  TonB system transport protein ExbD  38.24 
 
 
134 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.678508  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0548  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.19 
 
 
151 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268527  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0690  biopolymer transport protein  33.33 
 
 
132 aa  73.9  0.0000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0276966  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3381  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.23 
 
 
143 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000113024 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0840  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36 
 
 
137 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0352738 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1532  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.66 
 
 
141 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0383  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.88 
 
 
141 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0787741 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1052  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.07 
 
 
156 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4624  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.71 
 
 
137 aa  72.8  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000994253 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3498  protein TolR  33.33 
 
 
151 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.124794 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3787  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.66 
 
 
148 aa  72.8  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3203  protein TolR  33.33 
 
 
151 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.349327  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1460  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.4 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2641  biopolymer ExbD/TolR family transporter  33.33 
 
 
176 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2454  biopolymer ExbD/TolR family transporter  33.33 
 
 
176 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2589  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.06 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.382062  hitchhiker  0.000000237185 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0371  biopolymer ExbD/TolR family transporter  33.33 
 
 
176 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1756  biopolymer transport ExbD protein  32.62 
 
 
143 aa  72  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.439399 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1230  biopolymer ExbD/TolR family transporter  33.33 
 
 
176 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3142  biopolymer transport transmembrane protein, ExbD/TolR like  33.33 
 
 
139 aa  72  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.421775  normal  0.0460891 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2477  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.28 
 
 
140 aa  72  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0883915  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2629  biopolymer transport TolR  35.25 
 
 
149 aa  72.8  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02686  Biopolymer transport protein  35.43 
 
 
139 aa  72  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00153637  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4429  protein TolR  32.23 
 
 
173 aa  72  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.681247 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3453  biopolymer ExbD/TolR family transporter  33.33 
 
 
176 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1396  protein TolR  32.62 
 
 
156 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3232  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.06 
 
 
146 aa  71.2  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4606  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.52 
 
 
142 aa  71.2  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3739  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35 
 
 
152 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.220249 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0575  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.4 
 
 
143 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523101  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>