More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0892 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0892  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 367 aa  744    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  37.06 
 
 		 401 aa  258  1e-67  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 401 aa  257  3e-67  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 399 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  35.33 
 
 		 399 aa  228  9e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1466  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 386 aa  227  2e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.677019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 409 aa  223  4e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 399 aa  221  9.999999999999999e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  32.61 
 
 		 400 aa  217  2.9999999999999998e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 397 aa  214  9.999999999999999e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  34.15 
 
 		 417 aa  215  9.999999999999999e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1469  GntR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 413 aa  210  4e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  31.54 
 
 		 433 aa  209  5e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  33.24 
 
 		 397 aa  207  3e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  33.7 
 
 		 394 aa  206  7e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3581  putative GntR family transcriptional regulator  33.24 
 
 		 441 aa  203  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0315  putative transcriptional regulator, GntR family  31.88 
 
 		 403 aa  203  4e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.665801  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4022  aminotransferase, class I and II  32.34 
 
 		 433 aa  200  3e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  33.79 
 
 		 398 aa  199  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 395 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  32.89 
 
 		 517 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  34.06 
 
 		 398 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  32.43 
 
 		 406 aa  196  8.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  33.06 
 
 		 377 aa  195  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0865  putative transcriptional regulator, GntR family  35.08 
 
 		 404 aa  195  1e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000909191  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  33.24 
 
 		 395 aa  195  1e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  33.51 
 
 		 397 aa  194  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  31.51 
 
 		 463 aa  194  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  31.71 
 
 		 440 aa  194  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  32.43 
 
 		 396 aa  193  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  32.43 
 
 		 396 aa  194  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3370  putative transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 611 aa  193  4e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0532019  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0105  GntR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 411 aa  193  4e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1567  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 397 aa  193  5e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  30.81 
 
 		 402 aa  192  9e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0924  GntR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 397 aa  192  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554993 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  32.24 
 
 		 493 aa  191  1e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  30.54 
 
 		 402 aa  189  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 398 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0110  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 411 aa  187  2e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 395 aa  187  2e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  29.89 
 
 		 441 aa  187  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  29.43 
 
 		 436 aa  186  7e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 398 aa  185  9e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 383 aa  185  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  32.51 
 
 		 393 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3539  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 407 aa  184  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00400893 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  32.24 
 
 		 404 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0977  putative transcriptional regulator, GntR family  33.97 
 
 		 380 aa  184  3e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.664602  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  32.79 
 
 		 393 aa  184  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03480  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  31.69 
 
 		 416 aa  184  3e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.147628 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  32.51 
 
 		 393 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 393 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  32.51 
 
 		 393 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  32.61 
 
 		 396 aa  182  8.000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 395 aa  182  9.000000000000001e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3812  putative transcriptional regulator, GntR family  30.43 
 
 		 435 aa  182  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2549  putative transcriptional regulator, GntR family  28.61 
 
 		 436 aa  181  2e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.49034  normal  0.185545 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  32.15 
 
 		 393 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1641  valine-pyruvate aminotransferase  30.98 
 
 		 440 aa  181  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.320192  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0592  putative transcriptional regulator, GntR family  32.26 
 
 		 411 aa  181  2e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09460  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  29.7 
 
 		 404 aa  180  2.9999999999999997e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  32.15 
 
 		 498 aa  180  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 393 aa  180  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  28.14 
 
 		 437 aa  179  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 395 aa  179  5.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4975  putative transcriptional regulator, GntR family  30.27 
 
 		 430 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 393 aa  179  9e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  31.97 
 
 		 393 aa  179  9e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  29.27 
 
 		 438 aa  178  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  33.24 
 
 		 405 aa  178  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  33.06 
 
 		 394 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1680  GntR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 411 aa  177  2e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.733042  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 403 aa  177  3e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1052  putative transcriptional regulator, GntR family  30.25 
 
 		 398 aa  177  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  30.88 
 
 		 406 aa  176  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0093  putative transcriptional regulator, GntR family  31.06 
 
 		 425 aa  177  4e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1240  transcriptional regulator  30.22 
 
 		 478 aa  176  5e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0190  GntR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 376 aa  176  5e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.557885  normal  0.116027 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1614  GntR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 411 aa  176  6e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 450 aa  175  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0318  putative transcriptional regulator, GntR family  31.3 
 
 		 432 aa  174  1.9999999999999998e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.024163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0209  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.88 
 
 		 474 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2741  putative transcriptional regulator, GntR family  30.85 
 
 		 405 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.343456 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  27.99 
 
 		 446 aa  173  5e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0214  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  33.15 
 
 		 478 aa  173  5e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 426 aa  173  5e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1450  GntR family transcriptional regulator  30.79 
 
 		 504 aa  171  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00080879  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  32.15 
 
 		 393 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  32.15 
 
 		 393 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  32.15 
 
 		 393 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7090  putative transcriptional regulator, GntR family  27.32 
 
 		 438 aa  171  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635615  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  32.15 
 
 		 393 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  32.15 
 
 		 393 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4690  aminotransferase, class I and II  26.7 
 
 		 439 aa  171  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  32.15 
 
 		 393 aa  171  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3867  putative transcriptional regulator, GntR family  30.39 
 
 		 394 aa  170  4e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4054  putative transcriptional regulator, GntR family  29.56 
 
 		 394 aa  170  4e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  30.06 
 
 		 426 aa  170  4e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0411  aminotransferase  31.81 
 
 		 405 aa  169  5e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.894171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>