More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0977 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0977  putative transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 380 aa  766    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.664602  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0190  GntR family transcriptional regulator  64.38 
 
 		 376 aa  513  1e-144  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.557885  normal  0.116027 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0878  GntR family transcriptional regulator  39.89 
 
 		 393 aa  268  1e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  35.95 
 
 		 401 aa  225  8e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 399 aa  208  1e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0865  putative transcriptional regulator, GntR family  35.93 
 
 		 404 aa  203  4e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000909191  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  35.23 
 
 		 399 aa  202  6e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 401 aa  202  9.999999999999999e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  31.23 
 
 		 397 aa  200  3.9999999999999996e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 397 aa  199  7.999999999999999e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 399 aa  197  3e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  33.42 
 
 		 400 aa  197  3e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  33.25 
 
 		 394 aa  196  4.0000000000000005e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0105  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 411 aa  196  8.000000000000001e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1466  GntR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 386 aa  195  1e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.677019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0110  GntR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 411 aa  194  3e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  32.99 
 
 		 402 aa  193  5e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1614  GntR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 411 aa  191  2e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  32.74 
 
 		 402 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 395 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 395 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 409 aa  189  5.999999999999999e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  33.43 
 
 		 395 aa  188  1e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 395 aa  188  2e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1680  GntR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 411 aa  187  2e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.733042  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4054  putative transcriptional regulator, GntR family  32.79 
 
 		 394 aa  187  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 383 aa  185  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0892  GntR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 367 aa  184  3e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3867  putative transcriptional regulator, GntR family  32.33 
 
 		 394 aa  184  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  30.38 
 
 		 394 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 398 aa  183  5.0000000000000004e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  30.98 
 
 		 397 aa  182  9.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0103  putative transcriptional regulator, GntR family  33.7 
 
 		 396 aa  181  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0109  putative transcriptional regulator, GntR family  32.97 
 
 		 396 aa  180  4e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 414 aa  177  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  31.2 
 
 		 400 aa  176  4e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1563  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 398 aa  176  7e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.850295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 477 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2746  aminotransferase, class I and II  31.63 
 
 		 397 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  32.23 
 
 		 395 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3125  GntR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 393 aa  174  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0592  putative transcriptional regulator, GntR family  29.38 
 
 		 411 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2606  aminotransferase, class I and II  30.51 
 
 		 395 aa  172  9e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  31.78 
 
 		 498 aa  171  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 450 aa  170  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0093  putative transcriptional regulator, GntR family  30.91 
 
 		 425 aa  170  4e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0315  putative transcriptional regulator, GntR family  29.74 
 
 		 403 aa  170  4e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.665801  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  30.39 
 
 		 440 aa  169  5e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 403 aa  170  5e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1469  GntR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 413 aa  169  8e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1762  GntR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 396 aa  169  9e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  30.33 
 
 		 396 aa  169  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4690  aminotransferase, class I and II  30.6 
 
 		 439 aa  167  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0229  putative AMINNO transferase protein  32.64 
 
 		 402 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2084  aminotransferase, class I and II  33 
 
 		 406 aa  167  2.9999999999999998e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  30.71 
 
 		 436 aa  166  4e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 416 aa  165  9e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5545  putative transcriptional regulator, GntR family  33.44 
 
 		 367 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.97296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5087  putative transcriptional regulator, GntR family  29.32 
 
 		 454 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  29.14 
 
 		 433 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1642  aminotransferase class I and II  29.97 
 
 		 390 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 393 aa  164  3e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2076  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 395 aa  164  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  30.16 
 
 		 437 aa  163  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2549  putative transcriptional regulator, GntR family  29.59 
 
 		 436 aa  162  6e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.49034  normal  0.185545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  30.33 
 
 		 441 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3581  putative GntR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 441 aa  161  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  30.03 
 
 		 426 aa  160  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 426 aa  160  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  29.71 
 
 		 420 aa  160  4e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 438 aa  159  5e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2514  aminotransferase, class I and II  27.75 
 
 		 397 aa  159  6e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.483717  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  29.82 
 
 		 400 aa  159  6e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0233  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 395 aa  159  7e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.511167 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  29.23 
 
 		 406 aa  158  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  28.76 
 
 		 395 aa  159  1e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5405  putative transcriptional regulator, GntR family  29.7 
 
 		 446 aa  157  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 395 aa  158  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0318  putative transcriptional regulator, GntR family  30.97 
 
 		 432 aa  157  2e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.024163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4022  aminotransferase, class I and II  28.53 
 
 		 433 aa  158  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  29.95 
 
 		 417 aa  158  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2506  GntR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 477 aa  157  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00205118  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2738  transcriptional regulator, GntR family  29.54 
 
 		 477 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000175529  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1955  GntR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 408 aa  157  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479896  normal  0.0640255 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 397 aa  157  3e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  30.03 
 
 		 517 aa  157  3e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  29.4 
 
 		 406 aa  157  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2212  GntR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 468 aa  157  4e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2685  transcriptional regulator, GntR family  29.81 
 
 		 477 aa  157  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000116915 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3370  putative transcriptional regulator, GntR family  29.32 
 
 		 611 aa  156  5.0000000000000005e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0532019  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2152  aminotransferase, class I and II  27.52 
 
 		 416 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2419  GntR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 478 aa  156  6e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.926339  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0411  aminotransferase  31.72 
 
 		 405 aa  156  7e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.894171  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0745  putative transcriptional regulator, GntR family  31.34 
 
 		 416 aa  155  8e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  28.35 
 
 		 406 aa  155  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4583  aminotransferase, class I and II  28.46 
 
 		 437 aa  155  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000597747 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6427  putative transcriptional regulator, GntR family  29 
 
 		 414 aa  155  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2617  transcriptional regulator, GntR family  29.71 
 
 		 477 aa  155  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000489907 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09460  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  28.35 
 
 		 404 aa  155  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1972  GntR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 397 aa  155  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>