More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0190 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0190  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 376 aa  756    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.557885  normal  0.116027 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0977  putative transcriptional regulator, GntR family  64.38 
 
 		 380 aa  513  1e-144  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.664602  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0878  GntR family transcriptional regulator  43.77 
 
 		 393 aa  286  5.999999999999999e-76  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 399 aa  207  4e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 383 aa  201  9.999999999999999e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  33.69 
 
 		 401 aa  199  6e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 401 aa  198  1.0000000000000001e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0865  putative transcriptional regulator, GntR family  35.34 
 
 		 404 aa  195  1e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000909191  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 399 aa  193  4e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 409 aa  192  8e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  34.51 
 
 		 400 aa  191  2e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 398 aa  190  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  33.42 
 
 		 414 aa  189  5e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  33.42 
 
 		 400 aa  189  7e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1466  GntR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 386 aa  188  1e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.677019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  33.69 
 
 		 399 aa  186  5e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  33.88 
 
 		 397 aa  184  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 450 aa  181  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3125  GntR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 393 aa  180  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 395 aa  179  8e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  31.87 
 
 		 394 aa  179  8e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4690  aminotransferase, class I and II  32.42 
 
 		 439 aa  177  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0892  GntR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 367 aa  176  5e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2746  aminotransferase, class I and II  32.73 
 
 		 397 aa  176  6e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 397 aa  175  9e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 477 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  32.26 
 
 		 440 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 395 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 395 aa  173  5e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1563  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 398 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.850295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2076  GntR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 395 aa  171  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1762  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 396 aa  172  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  32.03 
 
 		 402 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  32.03 
 
 		 402 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 395 aa  171  2e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6427  putative transcriptional regulator, GntR family  29.86 
 
 		 414 aa  170  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  31.04 
 
 		 441 aa  169  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2152  aminotransferase, class I and II  31.78 
 
 		 416 aa  169  6e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5087  putative transcriptional regulator, GntR family  32.09 
 
 		 454 aa  169  7e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3581  putative GntR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 441 aa  169  7e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  31.62 
 
 		 395 aa  169  8e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  30.87 
 
 		 397 aa  169  9e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  30.05 
 
 		 437 aa  168  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2606  aminotransferase, class I and II  30.77 
 
 		 395 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  32.1 
 
 		 426 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  34.35 
 
 		 394 aa  167  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 398 aa  167  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4054  putative transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 		 394 aa  166  5e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 426 aa  166  5e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0110  GntR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 411 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0093  putative transcriptional regulator, GntR family  30.79 
 
 		 425 aa  166  8e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  30.43 
 
 		 463 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  32.79 
 
 		 404 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  33.42 
 
 		 398 aa  164  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  33.25 
 
 		 395 aa  163  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 416 aa  163  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4583  aminotransferase, class I and II  30.46 
 
 		 437 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000597747 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  32.01 
 
 		 398 aa  162  8.000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  34.71 
 
 		 377 aa  162  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0105  GntR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 411 aa  161  1e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3867  putative transcriptional regulator, GntR family  29.2 
 
 		 394 aa  161  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  32.69 
 
 		 398 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  33.33 
 
 		 517 aa  160  4e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3370  putative transcriptional regulator, GntR family  30.96 
 
 		 611 aa  160  4e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0532019  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5101  GntR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 437 aa  160  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000307944 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  31.84 
 
 		 397 aa  159  6e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  30.85 
 
 		 436 aa  159  6e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 393 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  32.6 
 
 		 393 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  32.6 
 
 		 393 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2549  putative transcriptional regulator, GntR family  29.48 
 
 		 436 aa  159  8e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.49034  normal  0.185545 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  32.13 
 
 		 393 aa  159  8e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  31.96 
 
 		 396 aa  159  9e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  32.13 
 
 		 393 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  31.61 
 
 		 406 aa  158  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  30.41 
 
 		 446 aa  159  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3539  GntR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 407 aa  158  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00400893 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1614  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 411 aa  159  1e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 406 aa  159  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1469  GntR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 413 aa  158  1e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  31.68 
 
 		 396 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  29.75 
 
 		 394 aa  156  4e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  32.04 
 
 		 498 aa  157  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2693  transcriptional regulator, GntR family  28.53 
 
 		 461 aa  156  4e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.686412  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0068  putative transcriptional regulator, GntR family  30.65 
 
 		 397 aa  157  4e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  29.59 
 
 		 438 aa  156  5.0000000000000005e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  32.24 
 
 		 393 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1642  aminotransferase class I and II  29.7 
 
 		 390 aa  156  6e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2469  transcriptional regulator  29.72 
 
 		 503 aa  156  6e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0495293  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0103  putative transcriptional regulator, GntR family  30.33 
 
 		 396 aa  156  7e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1680  GntR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 411 aa  155  9e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.733042  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  30.39 
 
 		 396 aa  155  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2514  aminotransferase, class I and II  29.36 
 
 		 397 aa  155  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.483717  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7090  putative transcriptional regulator, GntR family  29.59 
 
 		 438 aa  155  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635615  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  32.22 
 
 		 417 aa  154  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 393 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 393 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0109  putative transcriptional regulator, GntR family  28.96 
 
 		 396 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  31.77 
 
 		 393 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2617  transcriptional regulator, GntR family  29.36 
 
 		 477 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000489907 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>