More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_04570 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1784  ATP-dependent helicase HrpB  54.73 
 
 		 871 aa  685    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000613438 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04570  ATP-dependent helicase HrpB  100 
 
 		 893 aa  1639    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0937803  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2026  ATP-dependent helicase HrpB  53.21 
 
 		 897 aa  679    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.79914  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03650  ATP-dependent helicase HrpB  50.29 
 
 		 861 aa  563  1.0000000000000001e-159  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18990  ATP-dependent helicase HrpB  49.77 
 
 		 839 aa  528  1e-148  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.127417 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7166  ATP-dependent helicase HrpB  47.44 
 
 		 885 aa  509  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.236213  normal  0.291596 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1744  ATP-dependent helicase HrpB  47.01 
 
 		 855 aa  507  9.999999999999999e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564063  normal  0.839045 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07780  ATP-dependent helicase HrpB  47.07 
 
 		 830 aa  503  1e-141  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1990  ATP-dependent helicase HrpB  46.34 
 
 		 843 aa  498  1e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00135733  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3972  ATP-dependent helicase HrpB  44.18 
 
 		 841 aa  495  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.120133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1727  ATP-dependent helicase HrpB  47.04 
 
 		 856 aa  493  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.69515  normal  0.01898 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1244  ATP-dependent helicase HrpB  45.87 
 
 		 836 aa  479  1e-134  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00036267  normal  0.131071 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6512  ATP-dependent helicase HrpB  43.93 
 
 		 862 aa  466  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.302151 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0785  ATP-dependent helicase HrpB  44.11 
 
 		 880 aa  447  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0363712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0951  ATP-dependent helicase HrpB  42.68 
 
 		 772 aa  428  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0559  ATP-dependent helicase HrpB  37.41 
 
 		 822 aa  384  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0976  ATP-dependent helicase HrpB  40.56 
 
 		 848 aa  384  1e-105  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0156609  normal  0.918373 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1838  ATP-dependent helicase HrpB  38.22 
 
 		 846 aa  380  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0458406  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2061  ATP-dependent helicase HrpB  40.47 
 
 		 837 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0816695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0073  ATP-dependent helicase HrpB  37.86 
 
 		 824 aa  381  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3449  ATP-dependent helicase HrpB  40.43 
 
 		 814 aa  379  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.206852 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2348  ATP-dependent helicase HrpB  36.81 
 
 		 842 aa  377  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2322  ATP-dependent helicase HrpB  36.58 
 
 		 834 aa  375  1e-102  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.334263 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1573  thiolase  34.24 
 
 		 864 aa  376  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2365  ATP-dependent helicase HrpB  41.03 
 
 		 860 aa  372  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.701913  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3081  ATP-dependent helicase HrpB  37.05 
 
 		 827 aa  369  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.895104  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4651  ATP-dependent helicase HrpB  38.57 
 
 		 833 aa  365  2e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262977  normal  0.748056 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0067  DEAD box-like helicase  35.39 
 
 		 820 aa  364  5.0000000000000005e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0419076  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0665  ATP-dependent helicase protein, putative  37.42 
 
 		 832 aa  362  2e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0302  ATP-dependent helicase HrpB  37.44 
 
 		 825 aa  361  4e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.204863 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0455  ATP-dependent helicase HrpB  36.57 
 
 		 829 aa  360  8e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02411  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.46 
 
 		 853 aa  359  9.999999999999999e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0516  ATP-dependent helicase HrpB  39.52 
 
 		 822 aa  359  1.9999999999999998e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.355693 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1180  ATP-dependent helicase HrpB  36.77 
 
 		 828 aa  358  2.9999999999999997e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9477e-16 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0147  ATP-dependent helicase HrpB  35.58 
 
 		 818 aa  358  2.9999999999999997e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.210088  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0369  ATP-dependent helicase HrpB  35.63 
 
 		 834 aa  357  5.999999999999999e-97  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7352  ATP-dependent helicase  36 
 
 		 824 aa  355  1e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1349  ATP-dependent helicase HrpB  37.58 
 
 		 842 aa  355  1e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.228837  hitchhiker  0.00000000348515 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1590  ATP-dependent helicase HrpB  38.34 
 
 		 825 aa  355  2e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.357448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2470  ATP-dependent helicase HrpB  37.92 
 
 		 844 aa  354  4e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.590615  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0648  ATP-dependent helicase HrpB  36.28 
 
 		 842 aa  354  4e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.242487  normal  0.649022 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0536  ATP-dependent helicase HrpB  37.6 
 
 		 825 aa  353  7e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2232  ATP-dependent helicase HrpB  34.07 
 
 		 842 aa  353  8e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0479151  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0098  ATP-dependent helicase HrpB  37.3 
 
 		 826 aa  352  1e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.310548 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0359  ATP-dependent helicase HrpB  36.59 
 
 		 872 aa  351  4e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.508853 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002567  ATP-dependent helicase HrpB  30.84 
 
 		 822 aa  349  1e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4801  ATP-dependent helicase HrpB  38.24 
 
 		 826 aa  348  3e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.510158 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7107  ATP-dependent helicase HrpB  39.55 
 
 		 850 aa  346  8.999999999999999e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4319  ATP-dependent helicase HrpB  35.35 
 
 		 821 aa  346  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1172  ATP-dependent helicase HrpB  37.78 
 
 		 863 aa  345  2e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0505  ATP-dependent helicase HrpB  35.56 
 
 		 870 aa  345  2e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.967773 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3991  ATP-dependent helicase HrpB  35.67 
 
 		 821 aa  345  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0127  ATP-dependent helicase HrpB  35.85 
 
 		 832 aa  343  8e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00299316  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0192  ATP-dependent helicase HrpB  37.83 
 
 		 917 aa  342  1e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0135151 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09990  DEAH-box ATP-dependent helicase HrpB  39.8 
 
 		 838 aa  342  1e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.371307  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2844  ATP-dependent helicase HrpB  35.56 
 
 		 830 aa  342  2e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.454612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4808  ATP-dependent helicase HrpB  33.93 
 
 		 844 aa  342  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03444  ATP-dependent RNA helicase HrpB  30.43 
 
 		 833 aa  340  5.9999999999999996e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3869  ATP-dependent helicase HrpB  32.23 
 
 		 849 aa  340  9e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4854  ATP-dependent helicase HrpB  35.35 
 
 		 877 aa  340  9e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.951101 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3110  ATP-dependent helicase  31.88 
 
 		 826 aa  339  9.999999999999999e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.924657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2580  ATP-dependent RNA helicase  39.2 
 
 		 834 aa  339  9.999999999999999e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.262395  hitchhiker  0.0000513711 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3743  ATP-dependent helicase HrpB  32.39 
 
 		 856 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3111  ATP-dependent RNA helicase HrpB  34.09 
 
 		 820 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0640  ATP-dependent helicase HrpB  38.16 
 
 		 802 aa  339  1.9999999999999998e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.163213  normal  0.637588 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4284  ATP-dependent helicase HrpB  38.91 
 
 		 854 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0632  ATP-dependent helicase HrpB  32.37 
 
 		 835 aa  337  5e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3458  ATP-dependent helicase HrpB  37.07 
 
 		 798 aa  337  5.999999999999999e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0582  ATP-dependent helicase HrpB  32.46 
 
 		 854 aa  336  1e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3407  ATP-dependent helicase HrpB  32.54 
 
 		 835 aa  336  1e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.982669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2013  DEAD/DEAH box helicase  38.42 
 
 		 808 aa  335  2e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.211525  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4648  ATP-dependent helicase HrpB  37.28 
 
 		 842 aa  334  4e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.052727  normal  0.20008 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1148  ATP-dependent helicase HrpB  36.89 
 
 		 838 aa  334  4e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.658712  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3686  ATP-dependent helicase HrpB  32.35 
 
 		 856 aa  334  5e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4935  ATP-dependent helicase HrpB  35.99 
 
 		 839 aa  333  7.000000000000001e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557516 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4772  ATP-dependent helicase HrpB  37.17 
 
 		 842 aa  333  8e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0178797 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3111  ATP-dependent helicase HrpB  37.26 
 
 		 808 aa  333  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.577878  normal  0.0241826 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0622  ATP-dependent helicase HrpB  32.66 
 
 		 835 aa  333  1e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.53674 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0669  ATP-dependent helicase HrpB  37.28 
 
 		 841 aa  332  2e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.345787 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1261  ATP-dependent helicase HrpB  34.43 
 
 		 825 aa  331  3e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0343419 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4735  ATP-dependent helicase HrpB  33 
 
 		 840 aa  332  3e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.784057  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0655  ATP-dependent helicase HrpB  31.99 
 
 		 846 aa  332  3e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0723  ATP-dependent helicase HrpB  38.42 
 
 		 808 aa  331  3e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336305  normal  0.341531 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0688  ATP-dependent RNA helicase HrpB  34.01 
 
 		 809 aa  331  5.0000000000000004e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0972793  normal  0.531464 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4320  ATP-dependent helicase HrpB  34.78 
 
 		 844 aa  331  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.043486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3275  ATP-dependent helicase HrpB  35.16 
 
 		 821 aa  330  7e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0623  ATP-dependent helicase HrpB  32.43 
 
 		 835 aa  330  8e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3739  ATP-dependent helicase HrpB  37.27 
 
 		 844 aa  329  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41641  predicted protein  35.12 
 
 		 936 aa  326  9e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000692526 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1167  ATP-dependent RNA helicase HrpB  33.52 
 
 		 814 aa  326  1e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12630  putative ATP-dependent helicase  37.56 
 
 		 830 aa  326  1e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0159  ATP-dependent RNA helicase HrpB  34.38 
 
 		 824 aa  325  3e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.805468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0217  ATP-dependent RNA helicase HrpB  34.58 
 
 		 824 aa  324  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.976044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0488  ATP-dependent helicase HrpB  31.52 
 
 		 823 aa  323  9.000000000000001e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.531683  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1588  ATP-dependent helicase HrpB  37.64 
 
 		 847 aa  323  9.000000000000001e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.41464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0221  ATP-dependent RNA helicase HrpB  34.46 
 
 		 824 aa  323  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3793  ATP-dependent helicase HrpB  30.46 
 
 		 842 aa  323  9.999999999999999e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000841118 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0205  ATP-dependent RNA helicase HrpB  34.46 
 
 		 824 aa  323  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.879127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0157  ATP-dependent RNA helicase HrpB  34.38 
 
 		 824 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2129  ATP-dependent helicase HrpB  38.61 
 
 		 837 aa  322  1.9999999999999998e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>