More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6512 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_7166  ATP-dependent helicase HrpB  57.43 
 
 		 885 aa  785    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.236213  normal  0.291596 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1244  ATP-dependent helicase HrpB  53.88 
 
 		 836 aa  661    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00036267  normal  0.131071 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6512  ATP-dependent helicase HrpB  100 
 
 		 862 aa  1650    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.302151 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0951  ATP-dependent helicase HrpB  51.7 
 
 		 772 aa  645    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18990  ATP-dependent helicase HrpB  55.65 
 
 		 839 aa  705    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.127417 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1990  ATP-dependent helicase HrpB  59.93 
 
 		 843 aa  833    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00135733  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0785  ATP-dependent helicase HrpB  60.76 
 
 		 880 aa  877    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0363712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1744  ATP-dependent helicase HrpB  57.06 
 
 		 855 aa  752    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564063  normal  0.839045 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1727  ATP-dependent helicase HrpB  57 
 
 		 856 aa  751    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.69515  normal  0.01898 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07780  ATP-dependent helicase HrpB  53.86 
 
 		 830 aa  728    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3972  ATP-dependent helicase HrpB  56.4 
 
 		 841 aa  753    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.120133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1784  ATP-dependent helicase HrpB  48.64 
 
 		 871 aa  555  1e-156  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000613438 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2026  ATP-dependent helicase HrpB  47.31 
 
 		 897 aa  541  9.999999999999999e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.79914  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1838  ATP-dependent helicase HrpB  41.23 
 
 		 846 aa  485  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0458406  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3081  ATP-dependent helicase HrpB  39.89 
 
 		 827 aa  485  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.895104  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0302  ATP-dependent helicase HrpB  40.39 
 
 		 825 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.204863 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0147  ATP-dependent helicase HrpB  40.62 
 
 		 818 aa  481  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.210088  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1180  ATP-dependent helicase HrpB  39.84 
 
 		 828 aa  477  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9477e-16 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0455  ATP-dependent helicase HrpB  40.64 
 
 		 829 aa  478  1e-133  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0127  ATP-dependent helicase HrpB  40.28 
 
 		 832 aa  474  1e-132  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00299316  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1148  ATP-dependent helicase HrpB  41.24 
 
 		 838 aa  474  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.658712  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0359  ATP-dependent helicase HrpB  40.45 
 
 		 872 aa  474  1e-132  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.508853 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7352  ATP-dependent helicase  40.49 
 
 		 824 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4735  ATP-dependent helicase HrpB  38.42 
 
 		 840 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.784057  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0536  ATP-dependent helicase HrpB  40.53 
 
 		 825 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0098  ATP-dependent helicase HrpB  40.79 
 
 		 826 aa  468  9.999999999999999e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.310548 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2232  ATP-dependent helicase HrpB  39.05 
 
 		 842 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0479151  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3464  ATP-dependent RNA helicase HrpB  40.58 
 
 		 829 aa  463  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1001  ATP-dependent RNA helicase HrpB  40.58 
 
 		 853 aa  463  1e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2061  ATP-dependent helicase HrpB  40.93 
 
 		 837 aa  463  1e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0816695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03444  ATP-dependent RNA helicase HrpB  34.91 
 
 		 833 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3335  ATP-dependent RNA helicase HrpB  40.47 
 
 		 834 aa  461  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.825067  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0665  ATP-dependent helicase protein, putative  41.45 
 
 		 832 aa  459  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3739  ATP-dependent helicase HrpB  41.72 
 
 		 844 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0505  ATP-dependent helicase HrpB  39.07 
 
 		 870 aa  458  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.967773 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0976  ATP-dependent helicase HrpB  43.04 
 
 		 848 aa  457  1e-127  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0156609  normal  0.918373 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4651  ATP-dependent helicase HrpB  41.28 
 
 		 833 aa  459  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262977  normal  0.748056 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1588  ATP-dependent helicase HrpB  42.35 
 
 		 847 aa  457  1e-127  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.41464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3982  ATP-dependent RNA helicase HrpB  39.6 
 
 		 812 aa  455  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0579093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2013  DEAD/DEAH box helicase  42.42 
 
 		 808 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.211525  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09990  DEAH-box ATP-dependent helicase HrpB  41.69 
 
 		 838 aa  454  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.371307  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4808  ATP-dependent helicase HrpB  38.7 
 
 		 844 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7107  ATP-dependent helicase HrpB  42.45 
 
 		 850 aa  452  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0648  ATP-dependent helicase HrpB  39.35 
 
 		 842 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.242487  normal  0.649022 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1083  ATP-dependent helicase HrpB  39.82 
 
 		 829 aa  450  1e-125  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.220902 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2348  ATP-dependent helicase HrpB  39.03 
 
 		 842 aa  451  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0157  ATP-dependent RNA helicase HrpB  39.54 
 
 		 824 aa  449  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0073  ATP-dependent helicase HrpB  38.72 
 
 		 824 aa  451  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4801  ATP-dependent helicase HrpB  42.11 
 
 		 826 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.510158 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3454  ATP-dependent helicase HrpB  39.42 
 
 		 824 aa  449  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.629145  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0192  ATP-dependent helicase HrpB  41.59 
 
 		 917 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0135151 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3511  ATP-dependent RNA helicase HrpB  39.42 
 
 		 824 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.661022  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00147  predicted ATP-dependent helicase  39.08 
 
 		 809 aa  443  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0534884  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0151  ATP-dependent RNA helicase HrpB  39.31 
 
 		 809 aa  445  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000698462  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4320  ATP-dependent helicase HrpB  39.5 
 
 		 844 aa  446  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.043486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00146  hypothetical protein  39.08 
 
 		 809 aa  443  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0519083  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03650  ATP-dependent helicase HrpB  45.44 
 
 		 861 aa  444  1e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3110  ATP-dependent helicase  35.08 
 
 		 826 aa  443  1e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.924657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0152  ATP-dependent RNA helicase HrpB  39.31 
 
 		 809 aa  446  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00171749  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0559  ATP-dependent helicase HrpB  38.72 
 
 		 822 aa  443  1e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0159  ATP-dependent RNA helicase HrpB  39.17 
 
 		 824 aa  442  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.805468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0723  ATP-dependent helicase HrpB  42.03 
 
 		 808 aa  442  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336305  normal  0.341531 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4772  ATP-dependent helicase HrpB  39.3 
 
 		 842 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0178797 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2580  ATP-dependent RNA helicase  42.68 
 
 		 834 aa  439  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.262395  hitchhiker  0.0000513711 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0139  ATP-dependent RNA helicase HrpB  39.19 
 
 		 809 aa  442  9.999999999999999e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4935  ATP-dependent helicase HrpB  38.88 
 
 		 839 aa  442  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557516 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2470  ATP-dependent helicase HrpB  39.15 
 
 		 844 aa  441  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.590615  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3111  ATP-dependent RNA helicase HrpB  38.69 
 
 		 820 aa  441  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4043  ATP-dependent helicase HrpB  39.81 
 
 		 821 aa  441  9.999999999999999e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1773  ATP-dependent helicase HrpB  39.08 
 
 		 798 aa  442  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0295014  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3111  ATP-dependent helicase HrpB  41.84 
 
 		 808 aa  442  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.577878  normal  0.0241826 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0221  ATP-dependent RNA helicase HrpB  38.59 
 
 		 824 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002567  ATP-dependent helicase HrpB  33.68 
 
 		 822 aa  439  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1590  ATP-dependent helicase HrpB  41.05 
 
 		 825 aa  439  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.357448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4648  ATP-dependent helicase HrpB  39.19 
 
 		 842 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.052727  normal  0.20008 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1261  ATP-dependent helicase HrpB  36.82 
 
 		 825 aa  439  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0343419 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0206  ATP-dependent RNA helicase HrpB  38.7 
 
 		 824 aa  438  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.776045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3275  ATP-dependent helicase HrpB  38.04 
 
 		 821 aa  437  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0217  ATP-dependent RNA helicase HrpB  38.47 
 
 		 824 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.976044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0067  DEAD box-like helicase  37.96 
 
 		 820 aa  439  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0419076  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4284  ATP-dependent helicase HrpB  41.5 
 
 		 854 aa  435  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1573  thiolase  36.94 
 
 		 864 aa  434  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4854  ATP-dependent helicase HrpB  38.55 
 
 		 877 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.951101 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12630  putative ATP-dependent helicase  40.32 
 
 		 830 aa  433  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1167  ATP-dependent RNA helicase HrpB  38.51 
 
 		 814 aa  435  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3991  ATP-dependent helicase HrpB  38.27 
 
 		 821 aa  432  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0688  ATP-dependent RNA helicase HrpB  38.34 
 
 		 809 aa  431  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0972793  normal  0.531464 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2816  ATP-dependent RNA helicase HrpB  39.35 
 
 		 812 aa  430  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1349  ATP-dependent helicase HrpB  37.8 
 
 		 842 aa  432  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.228837  hitchhiker  0.00000000348515 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0223  ATP-dependent RNA helicase HrpB  38.12 
 
 		 824 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4319  ATP-dependent helicase HrpB  37.43 
 
 		 821 aa  432  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3449  ATP-dependent helicase HrpB  39.86 
 
 		 814 aa  431  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.206852 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0205  ATP-dependent RNA helicase HrpB  38.12 
 
 		 824 aa  432  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.879127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2322  ATP-dependent helicase HrpB  37.53 
 
 		 834 aa  428  1e-118  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.334263 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1172  ATP-dependent helicase HrpB  39.8 
 
 		 863 aa  427  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2129  ATP-dependent helicase HrpB  42.22 
 
 		 837 aa  428  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0640  ATP-dependent helicase HrpB  41.31 
 
 		 802 aa  427  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.163213  normal  0.637588 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2844  ATP-dependent helicase HrpB  39.48 
 
 		 830 aa  425  1e-117  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.454612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3869  ATP-dependent helicase HrpB  34.59 
 
 		 849 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04570  ATP-dependent helicase HrpB  43.91 
 
 		 893 aa  421  1e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0937803  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>