96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3478 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_3478  hydrogenase maturation protease  100 
 
 		 166 aa  319  8e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.314685  normal  0.0224154 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3415  peptidase M52, hydrogen uptake protein  100 
 
 		 166 aa  319  8e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100638  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3426  hydrogenase maturation protease  98.8 
 
 		 166 aa  315  1e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.141018 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3432  hydrogenase maturation protease  45.77 
 
 		 191 aa  109  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1139  hydrogenase maturation protease  40.54 
 
 		 157 aa  94.4  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1857  hydrogenase maturation protease  43.75 
 
 		 171 aa  88.2  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0508  hydrogenase maturation protease  36.18 
 
 		 180 aa  85.1  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2659  hydrogenase maturation protease  32.37 
 
 		 148 aa  77  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.196186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4827  hydrogenase maturation protease  35.48 
 
 		 166 aa  76.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4495  peptidase M52, hydrogen uptake protein  38.58 
 
 		 177 aa  73.9  0.0000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3760  hydrogenase maturation protease  35.88 
 
 		 158 aa  73.2  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2591  hydrogenase maturation protease  42.47 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.584226  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0853  hydrogenase maturation protease  35.48 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0705  hydrogenase maturation protease  35.48 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.862619  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04410  soluble hydrogenase processing peptidase, HoxW  34.9 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2103  hydrogenase maturation protease  26.53 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0938724  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2125  hydrogenase maturation protease  36.6 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.295921  normal  0.0277446 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4092  peptidase M52, hydrogen uptake protein  27.4 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0783921  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1020  hydrogenase maturation protease  33.57 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00482421 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0936  hydrogenase maturation protease  29.53 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3225  hydrogenase maturation protease  31.21 
 
 		 271 aa  55.1  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.679402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3367  hydrogenase maturation protease  26.45 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.239776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1054  hydrogenase maturation protease  29.53 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.402831 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3804  hydrogenase maturation protease  34.93 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0477  peptidase M52, hydrogen uptake protein  30.72 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2367  hydrogenase maturation protease  31.87 
 
 		 257 aa  54.7  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0307441 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2257  hydrogenase maturation protease  30.46 
 
 		 178 aa  54.3  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03840  hydrogenase maturation protease  26.61 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3329  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  29.25 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2951  hydrogenase expression/formation protein  30 
 
 		 170 aa  53.9  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3681  hydrogenase maturation protease  27.89 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.157783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1075  peptidase M52, hydrogen uptake protein  32.21 
 
 		 188 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0439307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0333  hydrogenase maturation protease  24.5 
 
 		 161 aa  51.6  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.835463 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2740  hydrogenase maturation protease  26.67 
 
 		 164 aa  51.6  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000112894  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0326  hydrogenase maturation protease  24.5 
 
 		 161 aa  51.6  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2184  peptidase M52, hydrogen uptake protein  39.64 
 
 		 137 aa  50.8  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.303394 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2012  hydrogenase maturation protease  31.82 
 
 		 160 aa  50.8  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2138  peptidase M52, hydrogen uptake protein  39.64 
 
 		 137 aa  50.8  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.577863  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1650  hydrogenase maturation protease  30.89 
 
 		 161 aa  50.8  0.000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1318  hydrogenase maturation protease  27.81 
 
 		 157 aa  50.8  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0542  hydrogenase expression/formation protein  27.89 
 
 		 169 aa  50.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.995345  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0472  hydrogenase maturation protease  30.77 
 
 		 173 aa  50.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.196333 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0113  HoxW protein  32.35 
 
 		 180 aa  50.1  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.486904  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2530  hydrogenase expression/formation protein  29.66 
 
 		 169 aa  50.1  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.780336  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3494  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.28 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.627392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3319  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.28 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00237916  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3328  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.28 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.581349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3393  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.28 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.441153 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1859  hydrogenase maturation protease  26.28 
 
 		 194 aa  49.3  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3399  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.28 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2053  hydrogenase maturation protease  26.32 
 
 		 152 aa  48.9  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52965  n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3201  hydrogenase maturation protease  34.75 
 
 		 161 aa  48.9  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0975  hydrogenase maturation protease  27.08 
 
 		 167 aa  48.9  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0660111  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1556  hydrogenase maturation protease  29.41 
 
 		 176 aa  48.5  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0380  hydrogenase maturation protease  27.33 
 
 		 176 aa  48.5  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1247  hydrogenase maturation protease  26.49 
 
 		 156 aa  48.9  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.188771 
 
 
-
 
NC_002936  DET0109  hydrogenase maturation protease  23.81 
 
 		 160 aa  48.5  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2422  hydrogenase maturation protease  28.67 
 
 		 155 aa  48.5  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.873028  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_119  Ni/Fe hydrogenase maturation protease  23.97 
 
 		 160 aa  48.1  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0085  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  29.22 
 
 		 181 aa  48.1  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0501687  normal  0.0549727 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02818  hypothetical protein  27.45 
 
 		 164 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3420  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  27.45 
 
 		 164 aa  47.8  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02869  predicted maturation element for hydrogenase 2  27.45 
 
 		 164 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08520  hydrogenase maturation protease  29.73 
 
 		 175 aa  48.1  0.00006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2606  hydrogenase maturation protease  30.37 
 
 		 150 aa  47.8  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0209681  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3947  peptidase M52, hydrogen uptake protein  26.14 
 
 		 153 aa  47.8  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974859  normal  0.0407707 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00344  hydrogenase 2 maturation protease  28.28 
 
 		 184 aa  47.4  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0272  hydrogenase maturation protease  27.67 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.268401 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0335  hydrogenase expression/formation protein  31.97 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00352637  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3970  HybD peptidase  27.52 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0259  hydrogenase maturation protease  23.29 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1233  hydrogenase maturation protease  26.58 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3462  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  27.45 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4665  hypothetical protein  31.37 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4305  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  27.45 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  29.29 
 
 		 1053 aa  45.8  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0703  hydrogenase expression/formation protein  26.8 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1414  hydrogenase expression/formation protein  29.93 
 
 		 166 aa  45.8  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3279  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  26.8 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0700  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  26.8 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3173  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  26.8 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0478  hydrogenase maturation protease  26.99 
 
 		 181 aa  45.4  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0362  hydrogenase maturation protease  28.57 
 
 		 176 aa  45.1  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120918 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2136  peptidase M52, hydrogen uptake protein  28 
 
 		 156 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3885  hydrogenase maturation protease  25.85 
 
 		 158 aa  45.1  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.445128  normal  0.911983 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2175  hydrogenase maturation protease  27.38 
 
 		 186 aa  44.7  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08060  hydrogenase maturation protease  29.03 
 
 		 176 aa  44.3  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2131  hydrogenase maturation protease  27.4 
 
 		 181 aa  43.1  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.829671 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2139  hydrogenase expression/formation protein  28.38 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1819  hydrogenase maturation protease  26.39 
 
 		 157 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4161  peptidase M52, hydrogen uptake protein  32.29 
 
 		 156 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0284488  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11780  hydrogenase maturation protease  28.39 
 
 		 179 aa  42.4  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0353355 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0269  hydrogenase expression/formation protein  27.52 
 
 		 168 aa  41.6  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0820491 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2182  hydrogenase 3 maturation protease  27.78 
 
 		 158 aa  41.2  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.359585 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0120  hydrogenase maturation protease  28.43 
 
 		 144 aa  40.8  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1280  hydrogenase maturation protease  30.32 
 
 		 166 aa  40.4  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.172644  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>