163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0853 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0705  hydrogenase maturation protease  100 
 
 		 157 aa  317  5e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.862619  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0853  hydrogenase maturation protease  100 
 
 		 157 aa  317  5e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1819  hydrogenase maturation protease  49.32 
 
 		 157 aa  154  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3760  hydrogenase maturation protease  55.64 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3947  peptidase M52, hydrogen uptake protein  46.26 
 
 		 153 aa  149  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974859  normal  0.0407707 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0333  hydrogenase maturation protease  43.79 
 
 		 161 aa  148  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.835463 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3367  hydrogenase maturation protease  47.3 
 
 		 157 aa  148  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.239776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0326  hydrogenase maturation protease  43.79 
 
 		 161 aa  148  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1318  hydrogenase maturation protease  43.79 
 
 		 157 aa  144  5e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3804  hydrogenase maturation protease  43.23 
 
 		 157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0472  hydrogenase maturation protease  47.01 
 
 		 173 aa  121  5e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.196333 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3201  hydrogenase maturation protease  41.22 
 
 		 161 aa  114  6e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3225  hydrogenase maturation protease  43.97 
 
 		 271 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.679402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1075  peptidase M52, hydrogen uptake protein  41.89 
 
 		 188 aa  112  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0439307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2367  hydrogenase maturation protease  43.54 
 
 		 257 aa  111  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0307441 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3885  hydrogenase maturation protease  35.33 
 
 		 158 aa  92.4  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.445128  normal  0.911983 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0464  hydrogenase maturation protease HyaD  47.5 
 
 		 92 aa  85.9  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496486 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2053  hydrogenase maturation protease  36.24 
 
 		 152 aa  84  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52965  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0109  hydrogenase maturation protease  26.35 
 
 		 160 aa  67.4  0.00000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_119  Ni/Fe hydrogenase maturation protease  25.68 
 
 		 160 aa  67  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2012  hydrogenase maturation protease  35.42 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3329  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  30.87 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4092  peptidase M52, hydrogen uptake protein  29.33 
 
 		 174 aa  65.5  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0783921  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2951  hydrogenase expression/formation protein  33.55 
 
 		 170 aa  65.5  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3415  peptidase M52, hydrogen uptake protein  35.48 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100638  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3478  hydrogenase maturation protease  35.48 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.314685  normal  0.0224154 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0269  hydrogenase expression/formation protein  29.75 
 
 		 168 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0820491 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0259  hydrogenase maturation protease  25 
 
 		 160 aa  63.5  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1233  hydrogenase maturation protease  29.14 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03840  hydrogenase maturation protease  28.26 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3432  hydrogenase maturation protease  35.14 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1247  hydrogenase maturation protease  28.57 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.188771 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2659  hydrogenase maturation protease  29.29 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.196186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0267  hydrogenase expression/formation protein  27.92 
 
 		 165 aa  62  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.312911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0542  hydrogenase expression/formation protein  36.17 
 
 		 169 aa  62  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.995345  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2257  hydrogenase maturation protease  35.82 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1244  hydrogenase expression/formation protein  37.97 
 
 		 165 aa  60.5  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.791163  normal  0.298279 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2422  hydrogenase maturation protease  31.33 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.873028  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1414  hydrogenase expression/formation protein  33.97 
 
 		 166 aa  60.5  0.000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2606  hydrogenase maturation protease  33.56 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0209681  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4827  hydrogenase maturation protease  29.45 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3319  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  32.3 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00237916  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3399  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  32.3 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2530  hydrogenase expression/formation protein  33.99 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.780336  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3328  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  32.3 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.581349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00344  hydrogenase 2 maturation protease  26.06 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2139  hydrogenase expression/formation protein  39.24 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3881  hydrogenase maturation protease  34.69 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3494  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  32.3 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.627392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0380  hydrogenase maturation protease  34.07 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2322  hydrogenase expression/formation protein  29.05 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.659738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3462  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  31.68 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3393  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  32.3 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.441153 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4305  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  31.68 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227122  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02869  predicted maturation element for hydrogenase 2  31.06 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0703  hydrogenase expression/formation protein  31.06 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02818  hypothetical protein  31.06 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0272  hydrogenase maturation protease  27.39 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.268401 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3173  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  31.06 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0700  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  31.06 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3279  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  31.06 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3420  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  31.06 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3970  HybD peptidase  26.49 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3969  hydrogenase maturation protease  34.48 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000953733 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0162  hydrogenase expression/formation protein  30.97 
 
 		 201 aa  57  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1844  hydrogenase expression/formation protein  33.62 
 
 		 161 aa  57  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2733  hydrogenase maturation protease  30.19 
 
 		 165 aa  57  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2740  hydrogenase maturation protease  26.24 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000112894  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0120  hydrogenase maturation protease  30.43 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0786  hydrogenase maturation protease  26.95 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1165  hydrogenase expression/formation protein  27.63 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.464172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1650  hydrogenase maturation protease  31.62 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0508  hydrogenase maturation protease  33.58 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2131  hydrogenase maturation protease  30.52 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.829671 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3135  hydrogenase maturation protease  25 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1157  hydrogenase expression/formation protein  27.63 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.486513  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1127  hydrogenase maturation protease  25.53 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2502  HybD peptidase  26.85 
 
 		 183 aa  53.9  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644035 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2879  hydrogenase maturation protease  26.32 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.980378 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3281  hydrogenase maturation protease  26.32 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4495  peptidase M52, hydrogen uptake protein  30.66 
 
 		 177 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3426  hydrogenase maturation protease  33.85 
 
 		 166 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.141018 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1280  hydrogenase maturation protease  31.37 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.172644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1139  hydrogenase maturation protease  30.71 
 
 		 157 aa  53.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04410  soluble hydrogenase processing peptidase, HoxW  33.56 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2531  hypothetical protein  25.87 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08060  hydrogenase maturation protease  30.82 
 
 		 176 aa  52  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0522  hydrogenase maturation protease  32.21 
 
 		 177 aa  52.4  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0051  hydrogenase maturation protease  26.77 
 
 		 166 aa  51.2  0.000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0212564  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1876  hydrogenase maturation protease  29.37 
 
 		 165 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252899  normal  0.719205 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2386  hypothetical protein  24.65 
 
 		 159 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1164  HyaD peptidase  27.81 
 
 		 198 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0362  hydrogenase maturation protease  34.81 
 
 		 176 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120918 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0693  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  30.48 
 
 		 171 aa  50.1  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.845339  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1037  hydrogenase expression/formation protein  27.33 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0456714  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0765  hydrogenase expression/formation protein  32.91 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0173  hydrogenase maturation protease  30 
 
 		 170 aa  48.9  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3145  hydrogenase expression/formation protein  26.35 
 
 		 159 aa  48.9  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00208925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1971  hydrogenase expression/formation protein  26.28 
 
 		 223 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.814536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0195  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  28.57 
 
 		 174 aa  48.1  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>