106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4827 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4827  hydrogenase maturation protease  100 
 
 		 166 aa  321  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385637  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1857  hydrogenase maturation protease  51.08 
 
 		 171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4495  peptidase M52, hydrogen uptake protein  44.78 
 
 		 177 aa  97.1  9e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0508  hydrogenase maturation protease  35.44 
 
 		 180 aa  91.7  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1139  hydrogenase maturation protease  37.91 
 
 		 157 aa  91.3  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2659  hydrogenase maturation protease  32.68 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.196186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1020  hydrogenase maturation protease  37.25 
 
 		 180 aa  82.4  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00482421 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3432  hydrogenase maturation protease  38.31 
 
 		 191 aa  79.7  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3415  peptidase M52, hydrogen uptake protein  35.48 
 
 		 166 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100638  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3478  hydrogenase maturation protease  35.48 
 
 		 166 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.314685  normal  0.0224154 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2591  hydrogenase maturation protease  42.65 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.584226  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04410  soluble hydrogenase processing peptidase, HoxW  33.99 
 
 		 160 aa  70.9  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3426  hydrogenase maturation protease  35.56 
 
 		 166 aa  70.5  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.141018 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3804  hydrogenase maturation protease  32.89 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4092  peptidase M52, hydrogen uptake protein  33.77 
 
 		 174 aa  67.4  0.00000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0783921  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0472  hydrogenase maturation protease  34.25 
 
 		 173 aa  63.9  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.196333 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2131  hydrogenase maturation protease  32.28 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.829671 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2386  hypothetical protein  32.03 
 
 		 159 aa  62  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3329  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  32.9 
 
 		 172 aa  62  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2530  hydrogenase expression/formation protein  31.21 
 
 		 169 aa  62  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.780336  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2012  hydrogenase maturation protease  34.23 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0853  hydrogenase maturation protease  29.45 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0705  hydrogenase maturation protease  29.45 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.862619  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1414  hydrogenase expression/formation protein  30.57 
 
 		 166 aa  57  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2531  hypothetical protein  28.12 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1247  hydrogenase maturation protease  27.98 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.188771 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3367  hydrogenase maturation protease  28.1 
 
 		 157 aa  53.9  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.239776  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1318  hydrogenase maturation protease  26.25 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2136  peptidase M52, hydrogen uptake protein  26.25 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0542  hydrogenase expression/formation protein  26 
 
 		 169 aa  52  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.995345  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0120  hydrogenase maturation protease  29.66 
 
 		 144 aa  51.6  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0326  hydrogenase maturation protease  23.93 
 
 		 161 aa  51.6  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3225  hydrogenase maturation protease  28.57 
 
 		 271 aa  51.6  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.679402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0333  hydrogenase maturation protease  23.93 
 
 		 161 aa  51.6  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.835463 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3769  hydrogenase expression/formation protein  28.47 
 
 		 209 aa  51.2  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7262  hydrogenase expression/formation protein  26.88 
 
 		 214 aa  50.8  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356245 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1054  hydrogenase maturation protease  37.12 
 
 		 172 aa  50.8  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.402831 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0936  hydrogenase maturation protease  37.12 
 
 		 172 aa  50.8  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50560  hydrogenase expression/formation protein, HoxM  30.72 
 
 		 207 aa  50.8  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00480221  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3538  hypothetical protein  34.23 
 
 		 152 aa  50.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1650  hydrogenase maturation protease  34.13 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3681  hydrogenase maturation protease  29.61 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.157783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1233  hydrogenase maturation protease  24.68 
 
 		 172 aa  49.3  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3947  peptidase M52, hydrogen uptake protein  26.75 
 
 		 153 aa  48.9  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974859  normal  0.0407707 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1075  peptidase M52, hydrogen uptake protein  32.89 
 
 		 188 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0439307  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3969  hydrogenase maturation protease  32.9 
 
 		 156 aa  48.9  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000953733 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3970  HybD peptidase  26.22 
 
 		 159 aa  48.5  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03840  hydrogenase maturation protease  23.74 
 
 		 137 aa  48.5  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1556  hydrogenase maturation protease  34.75 
 
 		 176 aa  48.1  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0259  hydrogenase maturation protease  24 
 
 		 160 aa  47.8  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0857  hydrogenase maturation protease  24.68 
 
 		 157 aa  47.8  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.685665  normal  0.316463 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2422  hydrogenase maturation protease  33.33 
 
 		 155 aa  47.4  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.873028  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1157  hydrogenase expression/formation protein  25.61 
 
 		 195 aa  47.4  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.486513  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00344  hydrogenase 2 maturation protease  26.71 
 
 		 184 aa  47.4  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0109  hydrogenase maturation protease  24.5 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1590  hydrogenase maturation protease  25.16 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1819  hydrogenase maturation protease  24.38 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3819  hydrogenase maturation protease  33.12 
 
 		 167 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.704224  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3323  peptidase M52, hydrogen uptake protein  31.58 
 
 		 154 aa  46.6  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2740  hydrogenase maturation protease  24.46 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000112894  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0834  hydrogenase maturation protease  28.86 
 
 		 177 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.850937  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0477  peptidase M52, hydrogen uptake protein  29.94 
 
 		 175 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1999  hydrogenase maturation  26.25 
 
 		 195 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.116789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3760  hydrogenase maturation protease  29.7 
 
 		 158 aa  45.8  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2862  hypothetical protein  34.27 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.159612  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2053  hydrogenase maturation protease  26.28 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52965  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2949  hydrogenase maturation protease  34.97 
 
 		 146 aa  45.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0109087  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0380  hydrogenase maturation protease  24.39 
 
 		 176 aa  45.1  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0272  hydrogenase maturation protease  26.19 
 
 		 159 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.268401 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_119  Ni/Fe hydrogenase maturation protease  24 
 
 		 160 aa  45.1  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1449  peptidase M52, hydrogen uptake protein  26.28 
 
 		 158 aa  44.7  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.230112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0522  hydrogenase maturation protease  28.67 
 
 		 177 aa  44.3  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3372  hypothetical protein  29.3 
 
 		 206 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1859  hydrogenase maturation protease  26.81 
 
 		 194 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3881  hydrogenase maturation protease  31.41 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0362  hydrogenase maturation protease  25 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120918 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2951  hydrogenase expression/formation protein  23.31 
 
 		 170 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3101  hydrogenase expression/formation protein  29.63 
 
 		 222 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2367  hydrogenase maturation protease  27.81 
 
 		 257 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0307441 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3909  hydrogenase maturation protease  25.68 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3462  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  26.58 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0051  hydrogenase maturation protease  21.71 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0212564  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2879  hydrogenase maturation protease  25.79 
 
 		 158 aa  43.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.980378 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4305  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  26.58 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3281  hydrogenase maturation protease  25.79 
 
 		 158 aa  43.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02869  predicted maturation element for hydrogenase 2  26.58 
 
 		 164 aa  42.4  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0703  hydrogenase expression/formation protein  26.58 
 
 		 164 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3173  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  26.58 
 
 		 164 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0700  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  26.58 
 
 		 164 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3279  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  26.58 
 
 		 164 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3420  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  26.58 
 
 		 164 aa  42.4  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0858  hydrogenase maturation protease  24.03 
 
 		 157 aa  42  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02818  hypothetical protein  26.58 
 
 		 164 aa  42.4  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1164  HyaD peptidase  27.11 
 
 		 198 aa  42  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2322  hydrogenase expression/formation protein  23.68 
 
 		 166 aa  42  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.659738  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0162  hydrogenase expression/formation protein  24.84 
 
 		 201 aa  41.6  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2150  hydrogenase expression/formation protein  27.27 
 
 		 206 aa  41.6  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.133093  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3399  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  26.22 
 
 		 164 aa  41.6  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3328  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  26.22 
 
 		 164 aa  41.6  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.581349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3319  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  26.22 
 
 		 164 aa  41.6  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00237916  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>