98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2659 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2659  hydrogenase maturation protease  100 
 
 
148 aa  301  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.196186  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4495  peptidase M52, hydrogen uptake protein  41.46 
 
 
177 aa  108  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1139  hydrogenase maturation protease  38.24 
 
 
157 aa  84.7  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4827  hydrogenase maturation protease  32.68 
 
 
166 aa  83.2  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385637  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3432  hydrogenase maturation protease  36.36 
 
 
191 aa  81.6  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1857  hydrogenase maturation protease  33.86 
 
 
171 aa  81.3  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3478  hydrogenase maturation protease  32.37 
 
 
166 aa  77  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.314685  normal  0.0224154 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3415  peptidase M52, hydrogen uptake protein  32.37 
 
 
166 aa  77  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100638  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0508  hydrogenase maturation protease  29.05 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04410  soluble hydrogenase processing peptidase, HoxW  35 
 
 
160 aa  72  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3426  hydrogenase maturation protease  30.65 
 
 
166 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.141018 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1020  hydrogenase maturation protease  33.33 
 
 
180 aa  65.5  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00482421 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0472  hydrogenase maturation protease  32.86 
 
 
173 aa  63.9  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.196333 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03840  hydrogenase maturation protease  30 
 
 
137 aa  63.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0853  hydrogenase maturation protease  29.29 
 
 
157 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0705  hydrogenase maturation protease  29.29 
 
 
157 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.862619  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2591  hydrogenase maturation protease  34.68 
 
 
149 aa  62  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.584226  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0109  hydrogenase maturation protease  29.2 
 
 
160 aa  61.2  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_119  Ni/Fe hydrogenase maturation protease  29.66 
 
 
160 aa  61.6  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0522  hydrogenase maturation protease  29.45 
 
 
177 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0259  hydrogenase maturation protease  28.97 
 
 
160 aa  58.5  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2125  hydrogenase maturation protease  29.75 
 
 
156 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.295921  normal  0.0277446 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2531  hypothetical protein  30.37 
 
 
159 aa  58.2  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0542  hydrogenase expression/formation protein  29.08 
 
 
169 aa  57.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.995345  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3804  hydrogenase maturation protease  28.28 
 
 
157 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3329  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  29.08 
 
 
172 aa  57.8  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0380  hydrogenase maturation protease  28.37 
 
 
176 aa  56.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2012  hydrogenase maturation protease  28.67 
 
 
160 aa  57  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1075  peptidase M52, hydrogen uptake protein  29.79 
 
 
188 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0439307  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0936  hydrogenase maturation protease  37.5 
 
 
172 aa  55.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1054  hydrogenase maturation protease  37.5 
 
 
172 aa  55.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.402831 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3367  hydrogenase maturation protease  25.5 
 
 
157 aa  55.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.239776  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3319  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  27.59 
 
 
164 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00237916  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3328  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  27.59 
 
 
164 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.581349  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3399  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  27.59 
 
 
164 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3494  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  27.59 
 
 
164 aa  54.7  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.627392  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3393  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  27.59 
 
 
164 aa  54.7  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.441153 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3969  hydrogenase maturation protease  32.12 
 
 
156 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000953733 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2386  hypothetical protein  30.37 
 
 
159 aa  54.3  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0477  peptidase M52, hydrogen uptake protein  28.37 
 
 
175 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02818  hypothetical protein  26.21 
 
 
164 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3173  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  26.21 
 
 
164 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02869  predicted maturation element for hydrogenase 2  26.21 
 
 
164 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0700  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  26.21 
 
 
164 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3279  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  26.21 
 
 
164 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0703  hydrogenase expression/formation protein  26.21 
 
 
164 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3420  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  26.21 
 
 
164 aa  53.9  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3225  hydrogenase maturation protease  29.37 
 
 
271 aa  53.5  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.679402  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3281  hydrogenase maturation protease  30.4 
 
 
158 aa  52  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3881  hydrogenase maturation protease  30.66 
 
 
156 aa  52.4  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2879  hydrogenase maturation protease  30.4 
 
 
158 aa  52  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.980378 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00344  hydrogenase 2 maturation protease  25.74 
 
 
184 aa  52  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2794  hypothetical protein  30.77 
 
 
147 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3462  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  25.52 
 
 
164 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0333  hydrogenase maturation protease  26.06 
 
 
161 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.835463 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0326  hydrogenase maturation protease  26.06 
 
 
161 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4305  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  25.52 
 
 
164 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227122  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2949  hydrogenase maturation protease  30.77 
 
 
146 aa  50.4  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0109087  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4241  peptidase M52, hydrogen uptake protein  24.65 
 
 
182 aa  50.4  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2862  hypothetical protein  30.77 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.159612  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1650  hydrogenase maturation protease  28.95 
 
 
161 aa  48.5  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2103  hydrogenase maturation protease  26.09 
 
 
159 aa  48.1  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0938724  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0362  hydrogenase maturation protease  28.37 
 
 
176 aa  47.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120918 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0975  hydrogenase maturation protease  25 
 
 
167 aa  47.8  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0660111  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2322  hydrogenase expression/formation protein  24.03 
 
 
166 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.659738  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2733  hydrogenase maturation protease  25.5 
 
 
165 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2606  hydrogenase maturation protease  30.47 
 
 
150 aa  47.4  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0209681  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3043  hydrogenase maturation protease  30 
 
 
146 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000605484  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3406  hydrogenase maturation protease  28.08 
 
 
191 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2740  hydrogenase maturation protease  24.64 
 
 
164 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000112894  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0120  hydrogenase maturation protease  28.15 
 
 
144 aa  46.2  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1233  hydrogenase maturation protease  27.91 
 
 
172 aa  45.4  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1819  hydrogenase maturation protease  26.32 
 
 
157 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1876  hydrogenase maturation protease  24.16 
 
 
165 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252899  normal  0.719205 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  24.11 
 
 
1053 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3947  peptidase M52, hydrogen uptake protein  23.65 
 
 
153 aa  45.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974859  normal  0.0407707 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2138  peptidase M52, hydrogen uptake protein  30.17 
 
 
137 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.577863  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1590  hydrogenase maturation protease  27.48 
 
 
160 aa  45.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2184  peptidase M52, hydrogen uptake protein  30.17 
 
 
137 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.303394 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2053  hydrogenase maturation protease  25.76 
 
 
152 aa  45.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52965  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2530  hydrogenase expression/formation protein  25.52 
 
 
169 aa  44.7  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.780336  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4092  peptidase M52, hydrogen uptake protein  23.61 
 
 
174 aa  44.7  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0783921  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1247  hydrogenase maturation protease  25.81 
 
 
156 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.188771 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0857  hydrogenase maturation protease  26.09 
 
 
157 aa  44.7  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.685665  normal  0.316463 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1414  hydrogenase expression/formation protein  26.32 
 
 
166 aa  44.3  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3760  hydrogenase maturation protease  25.4 
 
 
158 aa  44.3  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2951  hydrogenase expression/formation protein  26.03 
 
 
170 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2367  hydrogenase maturation protease  30.07 
 
 
257 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0307441 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08060  hydrogenase maturation protease  28.19 
 
 
176 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3970  HybD peptidase  24.11 
 
 
159 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1449  peptidase M52, hydrogen uptake protein  21.38 
 
 
158 aa  42  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.230112  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2257  hydrogenase maturation protease  27.69 
 
 
178 aa  41.6  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0505  hydrogenase maturation protease  27.86 
 
 
175 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0510  hydrogenase maturation protease  27.86 
 
 
175 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1844  hydrogenase expression/formation protein  28.33 
 
 
161 aa  40.8  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1556  hydrogenase maturation protease  28.46 
 
 
176 aa  40.8  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1947  hydrogenase maturation protease  21.43 
 
 
166 aa  40.4  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0272  hydrogenase maturation protease  24.26 
 
 
159 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.268401 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>