220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1247 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1247  hydrogenase maturation protease  100 
 
 		 156 aa  317  3e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.188771 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0272  hydrogenase maturation protease  70.78 
 
 		 159 aa  231  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.268401 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2136  peptidase M52, hydrogen uptake protein  71.24 
 
 		 156 aa  229  9e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1968  hydrogenase maturation protease  54.49 
 
 		 155 aa  157  7e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1924  hydrogenase maturation protease  41.45 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0267  hydrogenase expression/formation protein  41.06 
 
 		 165 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.312911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1037  hydrogenase expression/formation protein  42.25 
 
 		 161 aa  110  9e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0456714  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2139  hydrogenase expression/formation protein  37.33 
 
 		 165 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0765  hydrogenase expression/formation protein  35.53 
 
 		 161 aa  103  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0269  hydrogenase expression/formation protein  36.91 
 
 		 168 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0820491 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1244  hydrogenase expression/formation protein  38.93 
 
 		 165 aa  99  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.791163  normal  0.298279 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1233  hydrogenase maturation protease  35.57 
 
 		 172 aa  92.4  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2951  hydrogenase expression/formation protein  32.69 
 
 		 170 aa  92.4  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3329  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  41.18 
 
 		 172 aa  90.9  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0380  hydrogenase maturation protease  37.82 
 
 		 176 aa  89  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2740  hydrogenase maturation protease  33.11 
 
 		 164 aa  85.5  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000112894  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0542  hydrogenase expression/formation protein  39.83 
 
 		 169 aa  85.1  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.995345  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3145  hydrogenase expression/formation protein  32.89 
 
 		 159 aa  84.7  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00208925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2322  hydrogenase expression/formation protein  35 
 
 		 166 aa  84.3  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.659738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_119  Ni/Fe hydrogenase maturation protease  33.09 
 
 		 160 aa  82  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1165  hydrogenase expression/formation protein  31.97 
 
 		 203 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.464172  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0109  hydrogenase maturation protease  33.09 
 
 		 160 aa  80.9  0.000000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0259  hydrogenase maturation protease  33.09 
 
 		 160 aa  80.9  0.000000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3406  hydrogenase maturation protease  35.81 
 
 		 191 aa  80.5  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2879  hydrogenase maturation protease  35.46 
 
 		 158 aa  80.1  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.980378 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3281  hydrogenase maturation protease  35.46 
 
 		 158 aa  80.1  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11780  hydrogenase maturation protease  33.1 
 
 		 179 aa  79.7  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0353355 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3769  hydrogenase expression/formation protein  36.3 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2131  hydrogenase maturation protease  35.1 
 
 		 181 aa  79  0.00000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.829671 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1157  hydrogenase expression/formation protein  33.12 
 
 		 195 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.486513  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0162  hydrogenase expression/formation protein  28.85 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1650  hydrogenase maturation protease  33.33 
 
 		 161 aa  76.6  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2036  peptidase M52, hydrogen uptake protein  26.62 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1999  hydrogenase maturation  31.08 
 
 		 195 aa  74.7  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.116789  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0362  hydrogenase maturation protease  38.66 
 
 		 176 aa  73.9  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120918 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0120  hydrogenase maturation protease  35.92 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0051  hydrogenase maturation protease  30.32 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0212564  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2106  hydrogenase maturation protease  31.72 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2012  hydrogenase maturation protease  31.58 
 
 		 160 aa  72  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3970  HybD peptidase  28.86 
 
 		 159 aa  72  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1676  hydrogenase expression/formation protein  32.88 
 
 		 185 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1876  hydrogenase maturation protease  33.61 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252899  normal  0.719205 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2733  hydrogenase maturation protease  32.23 
 
 		 165 aa  70.9  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0335  hydrogenase expression/formation protein  30.92 
 
 		 191 aa  70.5  0.000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00352637  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4092  peptidase M52, hydrogen uptake protein  30.82 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0783921  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3372  hypothetical protein  28.48 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3135  hydrogenase maturation protease  29.75 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0522  hydrogenase maturation protease  31.41 
 
 		 177 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2546  hydrogenase maturation protease  31.17 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.316612  normal  0.0941351 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1414  hydrogenase expression/formation protein  32.64 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7262  hydrogenase expression/formation protein  32 
 
 		 214 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356245 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1211  hydrogenase 1 maturation protease  30 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1090  hydrogenase 1 maturation protease  28.95 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557672  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1127  hydrogenase maturation protease  29.11 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0477  peptidase M52, hydrogen uptake protein  29.41 
 
 		 175 aa  67.8  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0786  hydrogenase maturation protease  28.29 
 
 		 160 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1433  peptidase M52, hydrogenase expression/formation protein  32.26 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.50886  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3804  hydrogenase maturation protease  38.27 
 
 		 157 aa  67  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1819  hydrogenase expression/formation protein  28.87 
 
 		 192 aa  67  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2158  hydrogenase expression/formation protein  28.87 
 
 		 192 aa  67  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.6852  normal  0.309785 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2502  HybD peptidase  39.13 
 
 		 183 aa  67  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644035 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1877  hydrogenase expression/formation protein  28.87 
 
 		 192 aa  67  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00344  hydrogenase 2 maturation protease  28.67 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00978  HyaD  29.29 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.106803  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2669  hydrogenase expression/formation protein  29.29 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.112067  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00985  hypothetical protein  29.29 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4495  peptidase M52, hydrogen uptake protein  33.02 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2621  hydrogenase 1 maturation protease  29.29 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00823631 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1762  hydrogenase expression/formation protein  30.28 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2340  hydrogenase 1 maturation protease  30.58 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.732485  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1083  hydrogenase 1 maturation protease  29.29 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08520  hydrogenase maturation protease  28.57 
 
 		 175 aa  65.5  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2407  hydrogenase expression/formation protein  28.87 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132093  hitchhiker  0.000269982 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1280  hydrogenase maturation protease HydD  34.15 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00834079  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1400  hydrogenase maturation protease HydD  34.15 
 
 		 178 aa  64.7  0.0000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1072  hydrogenase maturation protease  30.5 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00076364  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2096  hydrogenase expression/formation protein  27.46 
 
 		 192 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1139  hydrogenase maturation protease  30.83 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0098  hydrogenase maturation protease HydD  30.6 
 
 		 180 aa  63.9  0.0000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0404839  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2053  hydrogenase maturation protease  25 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52965  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2142  hydrogenase 1 maturation protease  28.57 
 
 		 195 aa  63.9  0.0000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.152456  normal  0.47053 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1103  hydrogenase maturation protease  30.77 
 
 		 179 aa  63.5  0.0000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0864  hydrogenase maturation protease HydD  30.6 
 
 		 181 aa  63.9  0.0000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0505  hydrogenase maturation protease  31.67 
 
 		 175 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3101  hydrogenase expression/formation protein  30.53 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3225  hydrogenase maturation protease  35.8 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.679402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1886  hydrogenase expression/formation protein  28.17 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0510  hydrogenase maturation protease  31.67 
 
 		 175 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1919  hydrogenase expression/formation protein  28.17 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1912  hydrogenase expression/formation protein  28.17 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0462  hydrogenase maturation protease HydD  32.52 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000346095  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1280  hydrogenase maturation protease  28.7 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.172644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03840  hydrogenase maturation protease  31.78 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0472  hydrogenase maturation protease  38.36 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.196333 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0853  hydrogenase maturation protease  28.57 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1905  hydrogenase expression/formation protein  27.46 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0136333 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1947  hydrogenase maturation protease  28.35 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2530  hydrogenase expression/formation protein  35 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.780336  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0705  hydrogenase maturation protease  28.57 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.862619  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50560  hydrogenase expression/formation protein, HoxM  28.86 
 
 		 207 aa  62  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00480221  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>