124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1924 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1924  hydrogenase maturation protease  100 
 
 		 158 aa  321  3e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2136  peptidase M52, hydrogen uptake protein  40 
 
 		 156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1247  hydrogenase maturation protease  41.45 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.188771 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0272  hydrogenase maturation protease  37.91 
 
 		 159 aa  108  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.268401 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1968  hydrogenase maturation protease  39.71 
 
 		 155 aa  100  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2139  hydrogenase expression/formation protein  34.23 
 
 		 165 aa  90.1  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0269  hydrogenase expression/formation protein  34.42 
 
 		 168 aa  87.4  7e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0820491 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2951  hydrogenase expression/formation protein  32.68 
 
 		 170 aa  83.2  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1233  hydrogenase maturation protease  26.67 
 
 		 172 aa  79.3  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1244  hydrogenase expression/formation protein  34.19 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.791163  normal  0.298279 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0267  hydrogenase expression/formation protein  30.26 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.312911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2740  hydrogenase maturation protease  25.64 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000112894  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1271  peptidase M52, hydrogen uptake protein  33.76 
 
 		 167 aa  74.3  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.813931  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1037  hydrogenase expression/formation protein  32.68 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0456714  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3145  hydrogenase expression/formation protein  31.29 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00208925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0765  hydrogenase expression/formation protein  28.19 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2322  hydrogenase expression/formation protein  30.67 
 
 		 166 aa  68.9  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.659738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2733  hydrogenase maturation protease  35.33 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1529  hydrogenase 1 maturation protease  31.91 
 
 		 198 aa  67.8  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  0.329104 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1927  hydrogenase 1 maturation protease  31.91 
 
 		 198 aa  67  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1931  hydrogenase 1 maturation protease  31.91 
 
 		 198 aa  67  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_119  Ni/Fe hydrogenase maturation protease  28.28 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1090  hydrogenase 1 maturation protease  33.33 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557672  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0259  hydrogenase maturation protease  28.28 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1345  hydrogenase 1 maturation protease  31.21 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0109  hydrogenase maturation protease  27.59 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1987  hydrogenase 1 maturation protease  31.21 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1211  hydrogenase 1 maturation protease  33.57 
 
 		 195 aa  64.3  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00978  HyaD  33.57 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.106803  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2669  hydrogenase expression/formation protein  33.57 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.112067  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3970  HybD peptidase  26.35 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1083  hydrogenase 1 maturation protease  33.57 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00985  hypothetical protein  33.57 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2621  hydrogenase 1 maturation protease  33.57 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00823631 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2142  hydrogenase 1 maturation protease  33.57 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.152456  normal  0.47053 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0380  hydrogenase maturation protease  28.29 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0362  hydrogenase maturation protease  28.95 
 
 		 176 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120918 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2340  hydrogenase 1 maturation protease  32.68 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.732485  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0542  hydrogenase expression/formation protein  28.77 
 
 		 169 aa  61.2  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.995345  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1157  hydrogenase expression/formation protein  31.43 
 
 		 195 aa  60.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.486513  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0522  hydrogenase maturation protease  30.46 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1876  hydrogenase maturation protease  30.57 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252899  normal  0.719205 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0051  hydrogenase maturation protease  26.14 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0212564  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3372  hypothetical protein  28.95 
 
 		 206 aa  57.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1165  hydrogenase expression/formation protein  29.14 
 
 		 203 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.464172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2053  hydrogenase maturation protease  24.14 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52965  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1072  hydrogenase maturation protease  21.79 
 
 		 154 aa  57  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00076364  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1414  hydrogenase expression/formation protein  33.1 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3329  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  27.4 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00344  hydrogenase 2 maturation protease  26.85 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0786  hydrogenase maturation protease  26.49 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2879  hydrogenase maturation protease  31.58 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.980378 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3281  hydrogenase maturation protease  31.58 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4092  peptidase M52, hydrogen uptake protein  25.52 
 
 		 174 aa  53.9  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0783921  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3769  hydrogenase expression/formation protein  28.99 
 
 		 209 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2150  hydrogenase expression/formation protein  29.53 
 
 		 206 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.133093  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0162  hydrogenase expression/formation protein  27.59 
 
 		 201 aa  52  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03840  hydrogenase maturation protease  27.73 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0499  HyaD peptidase  28.86 
 
 		 206 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0858  hydrogenase maturation protease  29.61 
 
 		 157 aa  51.6  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1999  hydrogenase maturation  27.27 
 
 		 195 aa  50.8  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.116789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7262  hydrogenase expression/formation protein  30.46 
 
 		 214 aa  50.8  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356245 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2131  hydrogenase maturation protease  26.14 
 
 		 181 aa  50.8  0.000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.829671 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2502  HybD peptidase  26.32 
 
 		 183 aa  50.4  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644035 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2530  hydrogenase expression/formation protein  29.8 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.780336  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3986  HyaD peptidase  26.45 
 
 		 204 aa  48.9  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2026  HyaD peptidase  33.33 
 
 		 208 aa  48.9  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.462165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3101  hydrogenase expression/formation protein  28.39 
 
 		 222 aa  48.9  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2176  hydrogenase expression/formation protein  29.37 
 
 		 208 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0123485  normal  0.201269 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2487  hydrogenase maturation protease  32.28 
 
 		 170 aa  48.5  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3406  hydrogenase maturation protease  32.89 
 
 		 191 aa  47.4  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11780  hydrogenase maturation protease  27.1 
 
 		 179 aa  47.4  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0353355 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2036  peptidase M52, hydrogen uptake protein  24.18 
 
 		 190 aa  46.6  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08060  hydrogenase maturation protease  28.57 
 
 		 176 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1293  HyaD peptidase  26.45 
 
 		 221 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000175592  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3909  hydrogenase maturation protease  28.1 
 
 		 168 aa  47  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3804  hydrogenase maturation protease  31.25 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0148  hydrogenase maturation protease  26.85 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1280  hydrogenase maturation protease  25.16 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.172644  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02869  predicted maturation element for hydrogenase 2  25.53 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0703  hydrogenase expression/formation protein  25.53 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0120  hydrogenase maturation protease  29.41 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1380  peptidase M52, hydrogen uptake protein  33.07 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0298181  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02818  hypothetical protein  25.53 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1676  hydrogenase expression/formation protein  26.75 
 
 		 185 aa  46.2  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3173  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  25.53 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0700  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  25.53 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3279  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  25.53 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3420  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  25.53 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3399  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  24.32 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3328  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  24.32 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.581349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3319  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  24.32 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00237916  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0173  hydrogenase maturation protease  28 
 
 		 170 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3462  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  25.53 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0289  hydrogenase maturation protease  26.47 
 
 		 189 aa  45.4  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0450124  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3393  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  24.32 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.441153 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3494  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  24.32 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.627392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4305  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  25.53 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227122  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3225  hydrogenase maturation protease  29.73 
 
 		 271 aa  45.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.679402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0335  hydrogenase expression/formation protein  28.1 
 
 		 191 aa  44.7  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00352637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>